More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0230 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0230  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 147 aa  302  8.000000000000001e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00330553  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1451  50S ribosomal protein L13  70.07 
 
 		 147 aa  224  2e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000158182  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0628  50S ribosomal protein L13  70.95 
 
 		 148 aa  220  6e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0115715  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0127  50S ribosomal protein L13  65.75 
 
 		 148 aa  209  1e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000749109  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0214  50S ribosomal protein L13  65.07 
 
 		 148 aa  207  3e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000083935  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0322  50S ribosomal protein L13  65.99 
 
 		 158 aa  207  3e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000362186  hitchhiker  1.16201e-17 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2584  50S ribosomal protein L13  63.95 
 
 		 148 aa  204  4e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  63.64 
 
 		 145 aa  192  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2245  50S ribosomal protein L13  62.94 
 
 		 145 aa  190  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000176479  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2286  50S ribosomal protein L13  62.94 
 
 		 145 aa  190  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101681  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  61.81 
 
 		 145 aa  190  6e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  62.24 
 
 		 145 aa  189  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  62.24 
 
 		 145 aa  189  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  62.24 
 
 		 145 aa  189  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  62.24 
 
 		 145 aa  189  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  62.24 
 
 		 145 aa  189  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  62.24 
 
 		 145 aa  189  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  62.24 
 
 		 145 aa  189  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  62.24 
 
 		 145 aa  188  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  62.24 
 
 		 145 aa  187  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  61.54 
 
 		 145 aa  186  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1799  50S ribosomal protein L13  61.54 
 
 		 145 aa  187  5.999999999999999e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  59.03 
 
 		 145 aa  186  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0022  50S ribosomal protein L13  58.33 
 
 		 154 aa  178  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.550014  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2176  50S ribosomal protein L13  58.33 
 
 		 154 aa  178  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1651  50S ribosomal protein L13  58.33 
 
 		 154 aa  178  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.364317 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  55.94 
 
 		 145 aa  176  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf386  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 144 aa  175  2e-43  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.112252  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1682  50S ribosomal protein L13  58.62 
 
 		 154 aa  174  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124683  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 144 aa  172  9e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  57.25 
 
 		 148 aa  171  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0901  50S ribosomal protein L13  57.93 
 
 		 154 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.469735  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 144 aa  169  7.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2969  50S ribosomal protein L13  56.25 
 
 		 154 aa  169  7.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0186742  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2495  50S ribosomal protein L13  57.93 
 
 		 154 aa  169  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 143 aa  169  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0791  50S ribosomal protein L13  57.93 
 
 		 154 aa  167  5e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.532879  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0787  50S ribosomal protein L13  57.93 
 
 		 154 aa  167  5e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.945783  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  53.47 
 
 		 147 aa  166  7e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1164  50S ribosomal protein L13  56.94 
 
 		 153 aa  166  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  52.45 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 150 aa  165  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  54.17 
 
 		 145 aa  165  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0720  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 147 aa  165  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1873  ribosomal protein L13  54.73 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  50.71 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0862  50S ribosomal protein L13  54.86 
 
 		 154 aa  164  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1322  50S ribosomal protein L13  55.17 
 
 		 154 aa  164  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0148  50S ribosomal protein L13  55.56 
 
 		 153 aa  164  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1385  50S ribosomal protein L13  52.78 
 
 		 152 aa  163  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1235  50S ribosomal protein L13  55.86 
 
 		 154 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  55 
 
 		 147 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0971  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 147 aa  163  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.704336  normal  0.0786185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6565  50S ribosomal protein L13  52.08 
 
 		 147 aa  162  9e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.870556  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4612  50S ribosomal protein L13  54.86 
 
 		 153 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118736 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2707  50S ribosomal protein L13  54.86 
 
 		 154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613136  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3106  50S ribosomal protein L13  56.94 
 
 		 154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.668534  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1250  ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2671  50S ribosomal protein L13  54.17 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.133439 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4595  50S ribosomal protein L13  49.66 
 
 		 159 aa  161  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2937  50S ribosomal protein L13  52.78 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493547 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 151 aa  161  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1421  50S ribosomal protein L13  53.47 
 
 		 154 aa  160  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.356798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  53.85 
 
 		 147 aa  160  5.0000000000000005e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0663  50S ribosomal protein L13  52.78 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.131584  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 143 aa  159  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  48.94 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29360  LSU ribosomal protein L13P  53.15 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  50 
 
 		 148 aa  159  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  50.71 
 
 		 142 aa  158  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl493  50S ribosomal protein L13  55.86 
 
 		 150 aa  158  2e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.363056  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  51.39 
 
 		 147 aa  158  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 147 aa  158  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  52.14 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2455  50S ribosomal protein L13  52.78 
 
 		 154 aa  158  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.409282  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  50.71 
 
 		 142 aa  158  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17141  50S ribosomal protein L13  54.2 
 
 		 143 aa  158  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0575985  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  48.59 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 147 aa  157  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1602  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 152 aa  157  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.206566  normal  0.915061 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3349  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 142 aa  158  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.084598 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3628  50S ribosomal protein L13  50.71 
 
 		 144 aa  158  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 143 aa  157  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 147 aa  157  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  51.06 
 
 		 149 aa  157  4e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16870  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 147 aa  157  5e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1176  ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 147 aa  157  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.874786 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  51.37 
 
 		 151 aa  157  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  51.37 
 
 		 151 aa  157  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>