More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1613 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1613  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
523 aa  991    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00385179  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.39 
 
 
547 aa  310  4e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.85 
 
 
537 aa  289  7e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.69 
 
 
538 aa  287  2.9999999999999996e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018308  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.4 
 
 
546 aa  286  9e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5010  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.93 
 
 
538 aa  283  5.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36630  methyl-accepting chemotaxis protein  53.73 
 
 
540 aa  283  6.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2095  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.52 
 
 
538 aa  283  7.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36620  methyl-accepting chemotaxis protein  54.75 
 
 
543 aa  280  7e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0835028  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2984  chemotaxis sensory transducer  41.73 
 
 
545 aa  277  4e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06110  methyl-accepting chemotaxis protein  53.77 
 
 
533 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.232988  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.71 
 
 
545 aa  273  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3602  chemotaxis sensory transducer  51.5 
 
 
518 aa  269  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05890  methyl-accepting chemotaxis protein  54.43 
 
 
538 aa  266  5.999999999999999e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32360  methyl-accepting chemotaxis protein  48.59 
 
 
530 aa  257  4e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0109  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.45 
 
 
528 aa  257  4e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268294  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30950  methyl-accepting chemotaxis protein  40.38 
 
 
540 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.664181  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32370  methyl-accepting chemotaxis protein  49.41 
 
 
531 aa  254  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27420  methyl-accepting chemotaxis protein  53.8 
 
 
540 aa  254  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141989  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.91 
 
 
544 aa  254  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.09 
 
 
535 aa  253  5.000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.286616  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30970  methyl-accepting chemotaxis protein  51.66 
 
 
562 aa  253  6e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2197  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.81 
 
 
522 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1293  chemotaxis sensory transducer  43.96 
 
 
542 aa  251  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320257  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03110  methyl-accepting chemotaxis protein  47.98 
 
 
347 aa  250  6e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0123169  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07600  methyl-accepting chemotaxis protein  42.49 
 
 
533 aa  248  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0696595 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1974  chemotaxis sensory transducer  51.13 
 
 
535 aa  246  6e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.63 
 
 
532 aa  243  7e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.570256  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0651  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.31 
 
 
535 aa  241  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406234  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.72 
 
 
538 aa  240  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30960  methyl-accepting chemotaxis protein  44.93 
 
 
540 aa  238  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1995  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.26 
 
 
394 aa  238  3e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0359  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.73 
 
 
542 aa  236  7e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.36 
 
 
904 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0421  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.86 
 
 
623 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.308823 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3089  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.36 
 
 
526 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30940  methyl-accepting chemotaxis protein  45.8 
 
 
407 aa  233  8.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.682285  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47 
 
 
544 aa  230  4e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1913  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.27 
 
 
524 aa  226  8e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0934644  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.05 
 
 
531 aa  225  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1526  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.81 
 
 
858 aa  225  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.787952  normal  0.35844 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.93 
 
 
530 aa  224  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.22 
 
 
1150 aa  224  4e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.48 
 
 
702 aa  220  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105528  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.06 
 
 
536 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483396  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.05 
 
 
529 aa  218  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.28 
 
 
545 aa  216  8e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0156977  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30920  methyl-accepting chemotaxis protein  47.09 
 
 
583 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.84 
 
 
545 aa  214  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.03 
 
 
550 aa  210  5e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.37871  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0127  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.34 
 
 
397 aa  209  8e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.362921  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0198  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.17 
 
 
715 aa  206  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.419669  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0049  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.47 
 
 
539 aa  204  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0550535  normal  0.228084 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.86 
 
 
535 aa  199  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79817  normal  0.653673 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1783  chemotaxis sensory transducer  44.51 
 
 
515 aa  197  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.552405  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1909  chemotaxis sensory transducer  58.92 
 
 
965 aa  196  7e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2646  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.86 
 
 
625 aa  189  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.97 
 
 
572 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0673  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  52.45 
 
 
533 aa  180  4.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0753  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.79 
 
 
558 aa  180  5.999999999999999e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75846  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  38.73 
 
 
566 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0026  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.33 
 
 
686 aa  179  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.64 
 
 
554 aa  178  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000234986  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2460  chemotaxis sensory transducer  39.63 
 
 
565 aa  177  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1148  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.12 
 
 
650 aa  177  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.605213  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1840  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.5 
 
 
561 aa  177  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.31 
 
 
656 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.46 
 
 
731 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  37.63 
 
 
566 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3504  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.63 
 
 
657 aa  175  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193477  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0718  chemotaxis sensory transducer  48.37 
 
 
669 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.845917  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.74 
 
 
573 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  36.75 
 
 
691 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.73 
 
 
573 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.28 
 
 
710 aa  172  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.142887  normal  0.0205131 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.69 
 
 
566 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.81 
 
 
687 aa  171  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.53 
 
 
730 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.49 
 
 
562 aa  170  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2906  putative methyl-accepting chemotaxis protein  35.61 
 
 
564 aa  169  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.7 
 
 
563 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  47.47 
 
 
691 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.19 
 
 
741 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.36 
 
 
670 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.82 
 
 
493 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.31 
 
 
698 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 
562 aa  169  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743011  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.9 
 
 
730 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6993  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  36.51 
 
 
697 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.73 
 
 
560 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.14669 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.4 
 
 
672 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0644  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  37.79 
 
 
565 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.29 
 
 
563 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.47 
 
 
561 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  37.04 
 
 
602 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2076  chemotaxis sensory transducer  47.47 
 
 
561 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723039  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.49 
 
 
561 aa  166  9e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20550  methyl-accepting chemotaxis protein  38.6 
 
 
733 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.375054  normal  0.44591 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  40.34 
 
 
656 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2078  chemotaxis sensory transducer  47.47 
 
 
561 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>