174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0011 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0011  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
204 aa  386  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234092 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0978  protein tyrosine phosphatase  39.89 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020469 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0751  protein tyrosine phosphatase  39.02 
 
 
195 aa  70.1  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0206443 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0037  protein tyrosine phosphatase  36.44 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.895909  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4026  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20917  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2770  protein tyrosine phosphatase  37.61 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0211  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.67 
 
 
194 aa  64.7  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5510  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  33.93 
 
 
146 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000212559  unclonable  3.15729e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5168  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  34.55 
 
 
146 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000249866  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5001  protein tyrosine phosphatase  32.46 
 
 
146 aa  62.8  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000640822  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5018  protein tyrosine phosphatase  33.64 
 
 
146 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000828384  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5561  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  34.55 
 
 
146 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5410  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  33.64 
 
 
146 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.20464e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3838  protein tyrosine phosphatase  30.36 
 
 
146 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00365174  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4054  protein tyrosine phosphatase  37.04 
 
 
150 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3033  protein tyrosine phosphatase  31.19 
 
 
214 aa  62.8  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.720799 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5441  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  33.04 
 
 
146 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5117  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
146 aa  62  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000717991  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0097  protein tyrosine phosphatase  29.2 
 
 
153 aa  62  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.858615  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0508  protein tyrosine phosphatase  34.82 
 
 
150 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3277  protein tyrosine phosphatase  36.7 
 
 
145 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.248393  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29890  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.1 
 
 
148 aa  60.1  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4179  protein tyrosine phosphatase  35.45 
 
 
156 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000868477  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2141  protein tyrosine phosphatase  36.93 
 
 
225 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3693  protein tyrosine phosphatase  36.61 
 
 
149 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566781  normal  0.81094 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2596  protein tyrosine phosphatase  26.36 
 
 
159 aa  58.9  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.108724  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3845  protein tyrosine phosphatase  37.61 
 
 
146 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24620  protein-tyrosine-phosphatase  31.34 
 
 
202 aa  58.2  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6262  protein tyrosine phosphatase  34.69 
 
 
145 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.70235  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1703  protein tyrosine phosphatase  36.6 
 
 
146 aa  57.8  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.368639  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1019  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  33.04 
 
 
145 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.523657  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5444  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  31.25 
 
 
146 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000228107  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5497  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  31.82 
 
 
146 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000011124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6510  Protein-tyrosine-phosphatase-like protein  34.15 
 
 
267 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701892  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5906  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 
144 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305161  normal  0.183123 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1941  protein tyrosine phosphatase  37.61 
 
 
144 aa  56.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6174  protein tyrosine phosphatase  34.82 
 
 
144 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3224  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.94 
 
 
150 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.067627  normal  0.207784 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0069  protein tyrosine phosphatase  31.58 
 
 
154 aa  55.5  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326824  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7399  protein tyrosine phosphatase  35.14 
 
 
144 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.406706 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0648  protein tyrosine phosphatase  30 
 
 
143 aa  54.7  0.0000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.396254 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0406  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.32 
 
 
184 aa  54.3  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0620  protein tyrosine phosphatase  33.11 
 
 
147 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0796312  normal  0.256744 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4410  protein tyrosine phosphatase  40.19 
 
 
148 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4917  protein tyrosine phosphatase  40.16 
 
 
147 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.2258  hitchhiker  0.000710684 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0610  protein tyrosine phosphatase  27.27 
 
 
143 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.24726 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3227  protein tyrosine phosphatase  32.17 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357428  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4431  protein tyrosine phosphatase  39.25 
 
 
148 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1419  phosphotyrosine protein phosphatase  28.45 
 
 
154 aa  53.1  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5369  protein tyrosine phosphatase  36.28 
 
 
162 aa  52.8  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1290  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
263 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0258  protein tyrosine phosphatase  28.32 
 
 
168 aa  53.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000607836  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  32.08 
 
 
159 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6746  protein tyrosine phosphatase  35.45 
 
 
156 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0406991  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  31.03 
 
 
322 aa  52.4  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4541  protein tyrosine phosphatase  38.58 
 
 
147 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415134  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5117  protein tyrosine phosphatase  37.38 
 
 
145 aa  52  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0199458 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3822  protein tyrosine phosphatase  38.58 
 
 
147 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1190  protein tyrosine phosphatase  32.46 
 
 
151 aa  51.6  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2149  protein tyrosine phosphatase  33.72 
 
 
157 aa  52  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3702  protein tyrosine phosphatase  38.58 
 
 
147 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2274  protein tyrosine phosphatase  36.8 
 
 
147 aa  51.6  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796116  normal  0.14091 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0579  phosphotyrosine protein phosphatase  28.44 
 
 
154 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0795489  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2393  protein tyrosine phosphatase  32.14 
 
 
228 aa  51.2  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0736757 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4276  tyrosine phosphatase  41.67 
 
 
148 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4205  adenylylsulfate kinase  29.9 
 
 
670 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3622  protein tyrosine phosphatase  32.43 
 
 
164 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27551  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0965  protein tyrosine phosphatase  34.48 
 
 
167 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151413  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0252  protein tyrosine phosphatase  26.17 
 
 
143 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.796574  hitchhiker  0.00298229 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2865  protein tyrosine phosphatase  38.89 
 
 
159 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1791  protein-tyrosine-phosphatase  30.28 
 
 
172 aa  50.4  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.568904  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1394  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  21.19 
 
 
151 aa  49.7  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.560214  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3442  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  29.55 
 
 
155 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.759017  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1137  protein tyrosine phosphatase  35.45 
 
 
145 aa  49.7  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00271844  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0808  protein tyrosine phosphatase  30.09 
 
 
147 aa  49.7  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3035  protein tyrosine phosphatase  35.96 
 
 
144 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2256  putative protein tyrosine phosphatase  39.25 
 
 
145 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.78 
 
 
453 aa  49.3  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2888  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
164 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0779863  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2909  protein tyrosine phosphatase  37.82 
 
 
184 aa  49.3  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2192  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.56 
 
 
145 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1049  protein tyrosine phosphatase  32.17 
 
 
165 aa  49.3  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2343  tyrosine phosphatase  35.19 
 
 
149 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.670359 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2242  tyrosine phosphatase  35.19 
 
 
149 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 
182 aa  48.9  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3164  protein tyrosine phosphatase  34.48 
 
 
153 aa  48.9  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000152155  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4757  protein tyrosine phosphatase  33.64 
 
 
174 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.347333  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2457  tyrosine phosphatase  35.19 
 
 
149 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0395006 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3429  protein tyrosine phosphatase  27.19 
 
 
148 aa  48.9  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0950  protein tyrosine phosphatase  37.35 
 
 
124 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0932  protein tyrosine phosphatase  37.35 
 
 
157 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0798  protein tyrosine phosphatase  34.23 
 
 
150 aa  48.5  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1274  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  22.03 
 
 
151 aa  48.5  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000934312  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  34.62 
 
 
152 aa  48.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1059  protein tyrosine phosphatase  35.34 
 
 
153 aa  48.5  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0163  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  28.97 
 
 
145 aa  48.1  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147103  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2299  tyrosine phosphatase  35.19 
 
 
149 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.911775  normal  0.4735 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1702  protein tyrosine phosphatase  40.96 
 
 
154 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2350  tyrosine phosphatase  35.19 
 
 
149 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3358  protein tyrosine phosphatase  32.2 
 
 
165 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603407  normal  0.299244 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>