More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2195 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2195  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 
224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32600  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  51.69 
 
 
222 aa  211  7e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.158524  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3319  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  47.71 
 
 
224 aa  166  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.14 
 
 
379 aa  150  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00807242  normal  0.0158039 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3929  HAD family hydrolase  41.15 
 
 
224 aa  150  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436954  normal  0.193081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.36 
 
 
222 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.525568  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4839  HAD family hydrolase  40.95 
 
 
224 aa  148  8e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1478  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.94 
 
 
220 aa  146  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0104021  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4703  HAD family hydrolase  40.18 
 
 
224 aa  139  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.84 
 
 
222 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0861  HAD superfamily hydrolase  38.79 
 
 
227 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0852  HAD superfamily hydrolase  38.79 
 
 
227 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0403  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.23 
 
 
215 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2365  HAD family hydrolase  38.32 
 
 
227 aa  134  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2162  HAD family hydrolase  39.91 
 
 
216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0225096 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3528  HAD family hydrolase  41.85 
 
 
222 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58335  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4663  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.44 
 
 
215 aa  121  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.828051  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10440  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  40.78 
 
 
242 aa  118  7.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00307768  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3313  putative phosphatase  37.32 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109043  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3098  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.42 
 
 
214 aa  115  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1449  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.7 
 
 
226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0077861  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1626  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.13 
 
 
223 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0186201  normal  0.633699 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01370  conserved hypothetical protein  38.03 
 
 
250 aa  113  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.647335  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3383  HAD family hydrolase  45.51 
 
 
221 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.603016  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  41.97 
 
 
735 aa  112  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1822  putative phosphatase  39.62 
 
 
218 aa  111  7.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1487  putative phosphatase  36.45 
 
 
224 aa  111  9e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.751605  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1446  putative phosphatase  39.62 
 
 
218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0649  HAD family hydrolase  45.81 
 
 
234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1554  putative phosphatase  39.62 
 
 
218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2837  putative phosphatase  37.5 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.390104  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2777  putative phosphatase  36.23 
 
 
224 aa  109  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06436  hypothetical protein  29 
 
 
214 aa  108  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1388  putative phosphatase  38.76 
 
 
218 aa  108  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00329661  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2448  putative phosphatase  39.44 
 
 
216 aa  106  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.745831  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3432  putative phosphatase  38.97 
 
 
216 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.166368  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02218  predicted hydrolase or phosphatase  38.97 
 
 
216 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1363  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.97 
 
 
216 aa  105  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0110117  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2586  putative phosphatase  38.97 
 
 
216 aa  105  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118565  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02178  hypothetical protein  38.97 
 
 
216 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1359  putative phosphatase  38.97 
 
 
216 aa  105  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2442  putative phosphatase  38.97 
 
 
216 aa  105  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.647489  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2562  putative phosphatase  39.15 
 
 
219 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166759  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2574  putative phosphatase  39.15 
 
 
219 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2474  putative phosphatase  39.15 
 
 
219 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764335  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2682  putative phosphatase  39.15 
 
 
219 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2519  putative phosphatase  39.15 
 
 
219 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0435339  normal  0.279321 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2669  putative phosphatase  38.5 
 
 
216 aa  102  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.91748  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  36.06 
 
 
218 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4784  HAD family hydrolase  38.19 
 
 
215 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.625758  decreased coverage  0.0000248953 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2556  putative phosphatase  35.92 
 
 
218 aa  101  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.76 
 
 
202 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  33 
 
 
202 aa  98.6  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  33 
 
 
202 aa  98.6  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  33 
 
 
202 aa  98.6  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.83 
 
 
222 aa  97.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0794  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.16 
 
 
197 aa  97.8  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0913327  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3077  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.16 
 
 
212 aa  97.8  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.79741  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1550  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.98 
 
 
249 aa  96.7  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  36.59 
 
 
213 aa  95.9  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1843  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.74 
 
 
241 aa  94.7  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101722  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.5 
 
 
202 aa  92.8  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.24 
 
 
201 aa  91.7  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3473  HAD family hydrolase  34.67 
 
 
243 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  34.78 
 
 
236 aa  88.6  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2637  HAD family hydrolase  37.62 
 
 
286 aa  87  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  35.14 
 
 
248 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3540  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.82 
 
 
209 aa  87  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  0.491386 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03180  hypothetical protein  38.64 
 
 
325 aa  86.3  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2141  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.32 
 
 
200 aa  86.3  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.189137  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2293  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.84 
 
 
218 aa  85.9  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000494788  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0179  phosphatase  31.18 
 
 
200 aa  85.9  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  32.7 
 
 
235 aa  85.5  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1072  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.37 
 
 
243 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  32.5 
 
 
209 aa  85.1  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
227 aa  84.7  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20940  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  35.71 
 
 
273 aa  84.3  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.650807 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4343  HAD family hydrolase  35.9 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195907  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  33.84 
 
 
216 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2212  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.75 
 
 
220 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4442  HAD superfamily hydrolase  31.52 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  31.77 
 
 
233 aa  82.8  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.68 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2076  HAD family hydrolase  31.48 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2687  HAD family hydrolase  31.48 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02470  phosphatase, putative  32.26 
 
 
411 aa  82.4  0.000000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2488  HAD family hydrolase  34.78 
 
 
237 aa  82  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271509  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2406  HAD family hydrolase  34.64 
 
 
219 aa  82  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.1338 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  31.18 
 
 
222 aa  81.6  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2605  HAD family hydrolase  33.65 
 
 
240 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.38 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219512  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.34 
 
 
227 aa  81.3  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03084  HAD superfamily hydrolase  35.16 
 
 
226 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
216 aa  81.3  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  30.62 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01216  Glycerol-3-phosphate phosphatasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC6]  33.96 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00109898  normal  0.137881 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  29.61 
 
 
456 aa  80.1  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0243  HAD family hydrolase  32.64 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  35.71 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>