More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2746 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_2412  putative chloride channel protein  73.41 
 
 
562 aa  706    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03983  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  100 
 
 
543 aa  1068    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0693  Cl- channel, voltage gated  66.91 
 
 
564 aa  661    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0559233  hitchhiker  0.000374815 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2054  Cl- channel, voltage-gated family protein  39.15 
 
 
565 aa  298  1e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.88 
 
 
582 aa  292  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1534  Cl- channel, voltage gated  44.69 
 
 
527 aa  267  4e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.123029  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  32.15 
 
 
615 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  37.47 
 
 
626 aa  229  7e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.89 
 
 
587 aa  226  1e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  31.86 
 
 
470 aa  219  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  34.49 
 
 
669 aa  219  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  29.57 
 
 
614 aa  218  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  29.81 
 
 
631 aa  217  5e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  32.27 
 
 
597 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  34.08 
 
 
608 aa  213  5.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  36.25 
 
 
600 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  32.03 
 
 
577 aa  204  3e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  28.69 
 
 
627 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.33 
 
 
593 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.33 
 
 
589 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.33 
 
 
593 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.41 
 
 
579 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.41 
 
 
579 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.41 
 
 
636 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.41 
 
 
579 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.33 
 
 
589 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.33 
 
 
589 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.33 
 
 
598 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.41 
 
 
628 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  31.17 
 
 
606 aa  188  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  32.58 
 
 
624 aa  188  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  30.55 
 
 
585 aa  188  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.91 
 
 
591 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.1 
 
 
577 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  29.81 
 
 
613 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.56 
 
 
620 aa  183  6e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  33.33 
 
 
402 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1772  Cl- channel, voltage-gated family protein  38.75 
 
 
585 aa  180  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  29.27 
 
 
628 aa  180  7e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.3 
 
 
591 aa  179  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  27.4 
 
 
627 aa  178  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  34.59 
 
 
589 aa  178  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.6 
 
 
575 aa  177  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.23 
 
 
591 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  29.09 
 
 
613 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.77 
 
 
461 aa  171  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  31.83 
 
 
456 aa  165  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  28.31 
 
 
598 aa  164  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  30.69 
 
 
569 aa  164  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0358  Cl- channel, voltage gated  30.92 
 
 
575 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  31.91 
 
 
464 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  31.91 
 
 
464 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  28.6 
 
 
584 aa  162  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.97 
 
 
591 aa  160  8e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  29.61 
 
 
629 aa  159  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  27.39 
 
 
462 aa  157  4e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  30.92 
 
 
593 aa  151  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.13 
 
 
754 aa  150  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3300  Cl- channel, voltage gated  31.41 
 
 
585 aa  150  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0616826  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  30.04 
 
 
590 aa  150  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.87 
 
 
580 aa  150  6e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4064  Cl- channel, voltage gated  31.52 
 
 
602 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  30 
 
 
457 aa  146  9e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.9 
 
 
594 aa  143  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  26.41 
 
 
603 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  29.89 
 
 
625 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0490  voltage gated chloride channel family protein  28.7 
 
 
596 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.889673  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2049  Chloride channel core  28.6 
 
 
596 aa  140  7.999999999999999e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.993111  normal  0.527331 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1257  chloride channel-like  35.11 
 
 
615 aa  138  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.95023  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3883  chloride channel core  28.41 
 
 
603 aa  139  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0604  chloride channel core  28.08 
 
 
597 aa  137  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  28.18 
 
 
586 aa  136  8e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.406579 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  27.98 
 
 
582 aa  136  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43785  predicted protein  28.76 
 
 
588 aa  135  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000378872  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  24.58 
 
 
617 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2144  Cl- channel voltage-gated family protein  28.64 
 
 
604 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.16 
 
 
426 aa  133  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  28.74 
 
 
640 aa  133  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1650  Chloride channel core  31.95 
 
 
604 aa  133  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  27.31 
 
 
863 aa  132  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  27.41 
 
 
602 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01599  putative Voltage-gated ClC-type chloride channel clcA  30.12 
 
 
538 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2374  Chloride channel core  30.37 
 
 
596 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124913  decreased coverage  0.00191401 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2902  Chloride channel core  30.45 
 
 
614 aa  130  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.452389  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4701  Chloride channel core  31.17 
 
 
471 aa  130  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.10029 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2134  Chloride channel core  30.39 
 
 
596 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262546  normal  0.105647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2779  chloride channel core  30.34 
 
 
649 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.674097  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2595  Cl- channel, voltage gated  29.71 
 
 
544 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4857  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0630  Chloride channel core  25.17 
 
 
475 aa  128  2.0000000000000002e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  27.99 
 
 
579 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0546  Cl- channel, voltage gated  27.39 
 
 
559 aa  127  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  29.34 
 
 
863 aa  126  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0957  Chloride channel core  27.62 
 
 
615 aa  126  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3006  Chloride channel core  30.18 
 
 
614 aa  126  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0264261  normal  0.0792273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5810  Chloride channel core  30.38 
 
 
606 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.688487  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1201  chloride channel core  27.25 
 
 
575 aa  124  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000459194 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.87 
 
 
612 aa  124  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0815  voltage-gated chloride channel  27.72 
 
 
590 aa  124  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2161  chloride channel protein  28.91 
 
 
594 aa  123  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1761  Chloride channel core  30.1 
 
 
605 aa  123  8e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>