More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1671 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1671  PfkB  100 
 
 
331 aa  669    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  64.95 
 
 
330 aa  451  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  66.06 
 
 
333 aa  432  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  58.16 
 
 
335 aa  381  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  46.46 
 
 
328 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  45.35 
 
 
330 aa  275  7e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  44.76 
 
 
407 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  44.07 
 
 
330 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  44.07 
 
 
330 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  45.29 
 
 
330 aa  265  7e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  45.29 
 
 
330 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  41.52 
 
 
330 aa  264  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  41.52 
 
 
330 aa  264  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  43.81 
 
 
337 aa  263  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  42.09 
 
 
331 aa  263  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  43.77 
 
 
330 aa  262  6e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  43.93 
 
 
338 aa  261  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  45.95 
 
 
329 aa  259  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  44.07 
 
 
330 aa  256  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  42.99 
 
 
333 aa  255  7e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  42.04 
 
 
330 aa  255  7e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  44.11 
 
 
338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  41.41 
 
 
338 aa  253  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  41.98 
 
 
342 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  40.85 
 
 
333 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  39.51 
 
 
348 aa  252  6e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  39.14 
 
 
335 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  42.99 
 
 
335 aa  248  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  42.81 
 
 
331 aa  246  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  42.07 
 
 
333 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  42.52 
 
 
337 aa  243  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  43.02 
 
 
337 aa  243  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  43.02 
 
 
337 aa  243  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  42.09 
 
 
331 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  44.79 
 
 
330 aa  243  5e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  42.68 
 
 
333 aa  242  5e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  42.41 
 
 
332 aa  243  5e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  42.07 
 
 
337 aa  242  7e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  38.84 
 
 
335 aa  242  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  37.54 
 
 
333 aa  239  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  41.77 
 
 
333 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  36.7 
 
 
334 aa  238  9e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  41.89 
 
 
337 aa  236  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  37.54 
 
 
333 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  35.89 
 
 
338 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  40.96 
 
 
333 aa  230  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  42.24 
 
 
333 aa  231  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  41.46 
 
 
333 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  42.15 
 
 
331 aa  226  4e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  39.7 
 
 
333 aa  215  5.9999999999999996e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  41.4 
 
 
333 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  30.91 
 
 
328 aa  169  5e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  31.65 
 
 
331 aa  169  7e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  31.13 
 
 
327 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  31.13 
 
 
327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  30.53 
 
 
328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  30.28 
 
 
336 aa  159  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  32.82 
 
 
370 aa  159  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  30.67 
 
 
330 aa  155  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  33.33 
 
 
360 aa  144  3e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  26.41 
 
 
341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  28.7 
 
 
339 aa  123  5e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  29.45 
 
 
339 aa  122  7e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  28.66 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  29.38 
 
 
334 aa  114  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  28.09 
 
 
317 aa  87.4  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  29.09 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  28.52 
 
 
323 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  30.04 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  28.53 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  29.86 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  28.38 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  23.94 
 
 
645 aa  69.3  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  27.54 
 
 
299 aa  68.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  26.36 
 
 
298 aa  68.9  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  27.72 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  27.24 
 
 
642 aa  67  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3227  inosine kinase  26.38 
 
 
432 aa  65.9  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00215137  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  26.34 
 
 
307 aa  65.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50659  predicted protein  24.19 
 
 
347 aa  64.7  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  28.22 
 
 
326 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  29.15 
 
 
307 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3688  PfkB domain protein  25.75 
 
 
317 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  23.77 
 
 
307 aa  63.9  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  25.76 
 
 
424 aa  63.5  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  28.82 
 
 
273 aa  63.2  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  27.97 
 
 
315 aa  63.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  28.94 
 
 
304 aa  63.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  27.57 
 
 
304 aa  63.2  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  25.58 
 
 
311 aa  62.8  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  29.15 
 
 
311 aa  62.8  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  27.42 
 
 
308 aa  62.8  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1847  inosine-guanosine kinase  24.62 
 
 
434 aa  62  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.324608  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  26.45 
 
 
304 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0500  inosine-guanosine kinase  23.62 
 
 
434 aa  62.4  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0187048  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  26.1 
 
 
306 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  26.69 
 
 
302 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4394  ribokinase-like domain-containing protein  30.94 
 
 
319 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0284996  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  26.37 
 
 
291 aa  61.6  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  26.45 
 
 
304 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>