52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0087 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0087  Ion transport protein  100 
 
 		 258 aa  513  1.0000000000000001e-145  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3493  voltage-gated sodium channel  74.32 
 
 		 262 aa  390  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.840711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2848  Ion transport protein  72.8 
 
 		 261 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2895  Ion transport protein  71.2 
 
 		 261 aa  362  4e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.248664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2044  Ion transport protein  64.35 
 
 		 292 aa  282  4.0000000000000003e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146995 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0798  Ion transport protein  51.79 
 
 		 274 aa  273  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.265179  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0322  Ion transport protein  54.33 
 
 		 288 aa  270  1e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.297527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1575  Ion transport protein  57.5 
 
 		 268 aa  262  4e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2617  Ion transport protein  50.38 
 
 		 272 aa  247  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.017869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4370  Ion transport protein  50.21 
 
 		 277 aa  245  4.9999999999999997e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4775  cation channel family protein  49.22 
 
 		 271 aa  242  3.9999999999999997e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1920  Ion transport protein  54.59 
 
 		 290 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0586  Ion transport protein  49.41 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2187  Ion transport protein  50.38 
 
 		 300 aa  232  4.0000000000000004e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1696  Ion transport protein  48.24 
 
 		 280 aa  228  6e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0823848 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0966  Ion transport protein  50 
 
 		 281 aa  228  7e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1706  Ion transport protein  47.62 
 
 		 280 aa  226  3e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10825 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1761  cold shock protein  48.74 
 
 		 289 aa  222  4.9999999999999996e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0915  Ion transport protein  48.67 
 
 		 278 aa  222  6e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0582642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3404  ion transport protein  48.02 
 
 		 290 aa  218  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6234  ion transport protein  41.04 
 
 		 278 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212299 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1880  Ion transport protein  45.58 
 
 		 328 aa  202  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.893979 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0150  Ion transport protein  37.86 
 
 		 315 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.615831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2426  Ion transport protein  41.63 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666812  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0383  hypothetical protein  39.37 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2590  Ion transport protein  46.3 
 
 		 282 aa  156  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0425181  normal  0.02659 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0546  Ion transport protein  33.08 
 
 		 276 aa  152  4e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1904  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  37.4 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0421  Ion transport protein  38.63 
 
 		 282 aa  149  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3143  Ion transport protein  33.87 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54164  bacterial type voltage activated sodium channel  34.2 
 
 		 415 aa  143  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4165  Ion transport protein  32.83 
 
 		 276 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3585  cation channel family protein  34.25 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03691  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  34.31 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.270624  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3349  Ion transport protein  36.21 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00642666  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5101  Ion transport protein  31.37 
 
 		 304 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.327555 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3700  putative cation transporter component  36.36 
 
 		 291 aa  132  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.772401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4024  Ion transport protein  36.82 
 
 		 282 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.457934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2669  Ion transport protein  36.53 
 
 		 277 aa  120  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0277523 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43828  bacterial type voltage activated sodium channel  32.41 
 
 		 718 aa  112  8.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43878  cation channel protein  32.39 
 
 		 469 aa  110  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32140  VIC family transporter: calcium ion channel  30.86 
 
 		 1701 aa  94.4  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.00000826212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45407  VIC family transporter: calcium ion channel  27.57 
 
 		 938 aa  80.5  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.000000016856  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28283  VIC family transporter: calcium ion channel  26.78 
 
 		 1742 aa  58.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.501794  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03320  hypothetical protein  22.08 
 
 		 2028 aa  54.7  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073092  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01168  Calcium channel [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X1E9]  25.32 
 
 		 2110 aa  53.1  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13647  VIC family transporter: calcium ion channel  30.34 
 
 		 1546 aa  52.8  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.998781  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16877  VIC family transporter: sodium/calcium ion channel  26.45 
 
 		 1012 aa  52.8  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0101498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7925  VIC family transporter: sodium ion channel  30.77 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  19.03 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0929  Ion transport protein  25.45 
 
 		 274 aa  42.4  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  28.65 
 
 		 289 aa  42  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427173 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>