More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5716 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  100 
 
 
495 aa  970    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  40.3 
 
 
486 aa  277  4e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  40.68 
 
 
455 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  37.7 
 
 
451 aa  244  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  37.53 
 
 
554 aa  244  3.9999999999999997e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  40.09 
 
 
445 aa  244  3.9999999999999997e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  39.57 
 
 
451 aa  242  1e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.21 
 
 
464 aa  230  6e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.22 
 
 
476 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.71 
 
 
464 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  34.03 
 
 
460 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.93 
 
 
464 aa  224  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.71 
 
 
464 aa  224  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.71 
 
 
464 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.71 
 
 
464 aa  224  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.71 
 
 
464 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.71 
 
 
464 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.71 
 
 
464 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.37 
 
 
464 aa  223  6e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.95 
 
 
476 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.9 
 
 
481 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.89 
 
 
477 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.11 
 
 
476 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.11 
 
 
476 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  35.88 
 
 
461 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  33.61 
 
 
469 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  35.37 
 
 
452 aa  211  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  31.48 
 
 
464 aa  209  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  37.24 
 
 
483 aa  208  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  33.33 
 
 
467 aa  208  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.73 
 
 
484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  44.07 
 
 
482 aa  199  6e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.5 
 
 
484 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.5 
 
 
492 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  44.78 
 
 
409 aa  194  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  35.1 
 
 
415 aa  194  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  36.73 
 
 
485 aa  193  6e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  33.97 
 
 
424 aa  193  7e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1124  isochorismate synthase  31.82 
 
 
453 aa  192  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0744105  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1101  isochorismate synthase  31.82 
 
 
453 aa  192  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  35.48 
 
 
428 aa  190  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  41.86 
 
 
498 aa  190  5.999999999999999e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.32 
 
 
481 aa  186  8e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  30.08 
 
 
456 aa  184  3e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  43.28 
 
 
407 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1026  isochorismate synthase  44.33 
 
 
484 aa  180  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102724 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  34.75 
 
 
506 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1490  isochorismate synthase  38.46 
 
 
395 aa  179  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0238943  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0332  isochorismate synthase  32.47 
 
 
473 aa  179  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0246955  normal  0.0588972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  42.16 
 
 
412 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  28.35 
 
 
492 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  44.89 
 
 
401 aa  177  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  35.94 
 
 
466 aa  177  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  28.35 
 
 
492 aa  177  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  35.84 
 
 
449 aa  176  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20870  isochorismate synthase family protein  41.34 
 
 
390 aa  177  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.483877  normal  0.0157067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  42.11 
 
 
403 aa  176  8e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1701  isochorismate synthase  31.11 
 
 
482 aa  176  9e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  40.54 
 
 
406 aa  172  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0130  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  30.8 
 
 
452 aa  171  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331361  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2188  isochorismate synthase  35.88 
 
 
467 aa  170  6e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.976142  normal  0.55094 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  38.1 
 
 
395 aa  169  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0536  isochorismate synthase  33.04 
 
 
469 aa  169  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  36.4 
 
 
391 aa  168  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  39.92 
 
 
473 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1234  isochorismate synthase  27.23 
 
 
465 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0970  isochorismate synthase  40.74 
 
 
425 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3961  isochorismate synthases  29.57 
 
 
452 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.338247  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3913  isochorismate synthases  30.32 
 
 
460 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.348383  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4071  isochorismate synthases  31.94 
 
 
452 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.381607  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2720  isochorismate synthase  33.56 
 
 
441 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.307499 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  41.75 
 
 
377 aa  163  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3873  isochorismate synthase  31.94 
 
 
452 aa  162  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.971486  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1395  isochorismate synthase  36.27 
 
 
471 aa  162  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2074  isochorismate synthase  31.5 
 
 
471 aa  162  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.49442  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  38.02 
 
 
402 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2047  isochorismate synthase  29.42 
 
 
473 aa  161  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.489046  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0466  isochorismate synthase  40.96 
 
 
447 aa  161  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  37.31 
 
 
398 aa  160  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2422  isochorismate synthase  29.49 
 
 
468 aa  159  7e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33230  isochorismate synthase family protein  41.41 
 
 
383 aa  159  8e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4713  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  31.17 
 
 
452 aa  159  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0691  isochorismate synthase EntC  38.34 
 
 
391 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0634  isochorismate synthase EntC  38.34 
 
 
391 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2120  isochorismate synthase  32.15 
 
 
475 aa  159  1e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0753  isochorismate synthase EntC  38.34 
 
 
391 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0707  isochorismate synthase EntC  38.34 
 
 
391 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0613  isochorismate synthase  38.98 
 
 
391 aa  158  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00560  isochorismate synthase  38.98 
 
 
391 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3033  isochorismate synthase  38.98 
 
 
391 aa  158  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.652174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0678  isochorismate synthase, entC  38.98 
 
 
391 aa  158  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131945  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0648  isochorismate synthase EntC  38.34 
 
 
391 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0495  isochorismate synthase, entC  38.98 
 
 
391 aa  158  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4256  isochorismate synthase  30.57 
 
 
452 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4311  isochorismate synthase  30.57 
 
 
452 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240135  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3868  isochorismate synthases  31.68 
 
 
452 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172754  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02521  isochorismate synthase  28.85 
 
 
466 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3051  isochorismate synthase  38.98 
 
 
391 aa  158  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0644  isochorismate synthase  38.98 
 
 
391 aa  158  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00549  hypothetical protein  38.98 
 
 
391 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>