More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1290 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1290  Methyltransferase type 12  100 
 
 
341 aa  683    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  0.108647 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  39.94 
 
 
351 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  39.69 
 
 
351 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  39.69 
 
 
351 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  34.12 
 
 
356 aa  203  4e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  34.12 
 
 
356 aa  202  5e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2765  methyltransferase type 12  38.8 
 
 
348 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306767  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  37.3 
 
 
360 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  38.37 
 
 
360 aa  193  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  36.7 
 
 
348 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  33.23 
 
 
344 aa  192  5e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  34.32 
 
 
353 aa  192  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  38.07 
 
 
369 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  39.62 
 
 
348 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.292154 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  33.92 
 
 
351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  37.69 
 
 
348 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18860  hypothetical protein  34.49 
 
 
357 aa  189  9e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478854  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  36.36 
 
 
348 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2927  hypothetical protein  38.8 
 
 
348 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580788  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
355 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
355 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
355 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  33.13 
 
 
353 aa  186  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
360 aa  186  7e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1632  hypothetical protein  34.18 
 
 
357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  35.07 
 
 
360 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  38.65 
 
 
357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  33.53 
 
 
351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  34.05 
 
 
357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2574  Methyltransferase type 11  35.37 
 
 
363 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5910  Methyltransferase type 12  33.44 
 
 
353 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.512688 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2608  Methyltransferase type 12  35.31 
 
 
380 aa  179  5.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476854  hitchhiker  0.00248794 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  33.92 
 
 
365 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3711  methyltransferase type 12  32.84 
 
 
360 aa  179  7e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  34.36 
 
 
358 aa  179  8e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  30.56 
 
 
351 aa  178  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2188  Methyltransferase type 12  37.27 
 
 
343 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  36.56 
 
 
349 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1600  methyltransferase type 12  35.19 
 
 
359 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  35.33 
 
 
350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  35.59 
 
 
376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  34.9 
 
 
365 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0623  methyltransferase type 12  33.95 
 
 
357 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  35.28 
 
 
351 aa  169  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  35.84 
 
 
363 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  33.73 
 
 
353 aa  165  8e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  34.76 
 
 
360 aa  164  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  33.52 
 
 
366 aa  154  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5751  Methyltransferase type 11  34.41 
 
 
356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.171597 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
367 aa  152  7e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  34.16 
 
 
353 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  29.14 
 
 
363 aa  135  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  29.23 
 
 
356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43981  predicted protein  31.99 
 
 
418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321285  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  28.02 
 
 
416 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  29.04 
 
 
362 aa  94.4  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6936  putative cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.96 
 
 
343 aa  60.8  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389274  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3469  Methyltransferase type 11  28.07 
 
 
243 aa  56.6  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.508961  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  25.69 
 
 
457 aa  56.2  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 
281 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  27.5 
 
 
285 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0861  putative methyltransferase  32.2 
 
 
199 aa  55.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000766144  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  28.74 
 
 
274 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1689  methyltransferase type 12  22.55 
 
 
343 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  30.4 
 
 
268 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  26.13 
 
 
268 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  26.13 
 
 
268 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  28.33 
 
 
285 aa  53.9  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  28.33 
 
 
285 aa  53.9  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  28.95 
 
 
268 aa  53.5  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1544  Generic methyltransferase  27.36 
 
 
201 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  30.97 
 
 
270 aa  53.5  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1546  NodS  30.95 
 
 
283 aa  53.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377082  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2605  hypothetical protein  30.97 
 
 
265 aa  52.8  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.37 
 
 
345 aa  52.8  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  29.5 
 
 
267 aa  52.8  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  28.04 
 
 
226 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0799  methyltransferase type 11  29.66 
 
 
195 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0954  methyltransferase type 12  21.37 
 
 
343 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1509  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
186 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0992  methyltransferase type 12  21.37 
 
 
360 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  30.36 
 
 
268 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1967  methyltransferase type 11  30.82 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214855  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  30.48 
 
 
253 aa  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0419  hypothetical protein  28.07 
 
 
230 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.271566 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2730  methyltransferase type 12  29.52 
 
 
422 aa  50.8  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184055  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2150  methyltransferase type 11  25.93 
 
 
255 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.301161  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 
634 aa  50.8  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0254  methyltransferase type 11  28.32 
 
 
230 aa  50.8  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.753586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  28.69 
 
 
239 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 
252 aa  50.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3804  methyltransferase type 11  39.83 
 
 
279 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154752  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.53 
 
 
270 aa  50.4  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  27.87 
 
 
268 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2807  methyltransferase type 11  28.3 
 
 
341 aa  50.1  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.160359  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2732  hypothetical protein  31.78 
 
 
265 aa  50.1  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  31.18 
 
 
281 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
266 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  28.18 
 
 
287 aa  49.7  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>