294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2691 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2691  TrkA-N domain protein  100 
 
 
562 aa  1115    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557317  normal  0.0657771 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1924  TrkA-C domain protein  43.33 
 
 
551 aa  368  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  34.94 
 
 
542 aa  354  2e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  36.75 
 
 
544 aa  338  1.9999999999999998e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1315  TrkA-N domain protein  66.94 
 
 
293 aa  335  2e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  33.88 
 
 
544 aa  291  2e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4312  TrkA-N domain protein  33.15 
 
 
548 aa  281  2e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1187  TrkA-N domain protein  36.33 
 
 
541 aa  276  1.0000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0899  TrkA domain-containing protein  29.4 
 
 
567 aa  203  6e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0527  TrkA domain-containing protein  27.01 
 
 
564 aa  201  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.630061  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1148  TrkA-N domain protein  28.87 
 
 
614 aa  196  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.549431 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1635  Ion transport 2 domain protein  25.95 
 
 
567 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0302468  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0161  TrkA domain-containing protein  27.22 
 
 
568 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000200021  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0396  TrkA domain-containing protein  31.61 
 
 
457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1196  TrkA-N domain protein  28.37 
 
 
569 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2323  TrkA domain-containing protein  28.29 
 
 
549 aa  144  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.551813 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  29.09 
 
 
347 aa  137  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07220  K+ transport system, NAD-binding component  25.87 
 
 
576 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146502  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  27.25 
 
 
341 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2072  TrkA-N  22.5 
 
 
568 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.712567  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  27.79 
 
 
335 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  27.96 
 
 
335 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  26.67 
 
 
335 aa  108  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  27.98 
 
 
371 aa  103  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  27.89 
 
 
332 aa  101  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0419  TrkA-N domain protein  26.27 
 
 
313 aa  97.8  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  26.64 
 
 
334 aa  96.7  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  26.64 
 
 
330 aa  97.1  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  26.64 
 
 
334 aa  96.3  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  27.03 
 
 
333 aa  95.5  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  26.38 
 
 
330 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  26.04 
 
 
346 aa  95.1  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  30.82 
 
 
350 aa  93.6  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  27.56 
 
 
350 aa  92.8  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  23.7 
 
 
330 aa  93.2  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  25.45 
 
 
330 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  27.05 
 
 
397 aa  93.2  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  29.01 
 
 
345 aa  92.4  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  25.15 
 
 
330 aa  90.9  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  27.39 
 
 
347 aa  88.2  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  24.71 
 
 
337 aa  86.7  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  26.67 
 
 
351 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  23.29 
 
 
325 aa  84  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  24.78 
 
 
351 aa  83.6  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  28.31 
 
 
331 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  25.09 
 
 
354 aa  82.4  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  27.86 
 
 
346 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  26.46 
 
 
338 aa  82  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  30.87 
 
 
395 aa  81.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  25.86 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 
332 aa  80.9  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  22.33 
 
 
351 aa  80.5  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  24.45 
 
 
336 aa  80.5  0.00000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  22.33 
 
 
351 aa  80.5  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  22.33 
 
 
351 aa  80.5  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0771  hypothetical protein  27.39 
 
 
376 aa  79  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.94547  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  26.49 
 
 
355 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  28.45 
 
 
332 aa  77.8  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  23.1 
 
 
351 aa  77.8  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  22.13 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  26.67 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  22.7 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  25.93 
 
 
356 aa  77  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  24.03 
 
 
335 aa  77  0.0000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  25.93 
 
 
356 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  23.05 
 
 
335 aa  76.6  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  23.55 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  28.18 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3112  potassium channel protein  25.99 
 
 
225 aa  72.4  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0370735  normal  0.700906 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  25.1 
 
 
362 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  23.21 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  25.32 
 
 
337 aa  71.2  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  29.22 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  24.29 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  29.73 
 
 
217 aa  69.7  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  32.58 
 
 
388 aa  68.2  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  25.16 
 
 
335 aa  67.8  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1601  hypothetical protein  24.6 
 
 
378 aa  67.8  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  25.65 
 
 
384 aa  67.8  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  24.66 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  23.83 
 
 
509 aa  67  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0064  K+ transport systems, NAD-binding component  26.7 
 
 
221 aa  66.6  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  27.78 
 
 
341 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  25.93 
 
 
366 aa  65.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  25 
 
 
352 aa  65.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  21.62 
 
 
357 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  25.51 
 
 
662 aa  65.1  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  24.07 
 
 
355 aa  65.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  27.63 
 
 
399 aa  65.1  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  22.49 
 
 
352 aa  64.3  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0141  TrkA domain-containing protein  36.28 
 
 
217 aa  62.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00479404  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  24.89 
 
 
517 aa  63.2  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5245  potassium channel protein, C-terminus  26.11 
 
 
182 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.835427  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  28.5 
 
 
395 aa  62.4  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  24.14 
 
 
352 aa  62.4  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  23.98 
 
 
376 aa  62.8  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  30.53 
 
 
583 aa  62  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  23.36 
 
 
650 aa  61.6  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  30 
 
 
364 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  22.58 
 
 
359 aa  61.6  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>