More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4711 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 334 aa  675    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  52.76 
 
 		 333 aa  330  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  49.85 
 
 		 337 aa  318  1e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0186  alanine racemase  50.92 
 
 		 335 aa  311  1e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1973  LacI family transcription regulator  49.54 
 
 		 341 aa  309  4e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.768247  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00486  transcriptional regulator LacI family  50.46 
 
 		 331 aa  306  3e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2662  LacI family transcription regulator  50.46 
 
 		 328 aa  305  8.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1186  transcriptional regulator, LacI family  49.54 
 
 		 358 aa  301  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0882106  normal  0.328337 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3107  transcriptional regulator, LacI family  51.53 
 
 		 331 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2860  putative transcription regulation repressor transcription regulator protein  50.15 
 
 		 329 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2742  transcriptional regulator, LacI family  51.53 
 
 		 331 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0297688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4253  LacI family transcription regulator  50.15 
 
 		 354 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  45.05 
 
 		 347 aa  277  2e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  43.58 
 
 		 342 aa  268  1e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0609  alanine racemase  44.68 
 
 		 347 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0432  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  44 
 
 		 334 aa  255  8e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3127  transcriptional regulator, LacI family  42.38 
 
 		 331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501484  hitchhiker  0.00254336 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1785  LacI family transcription regulator  43.69 
 
 		 334 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  42.34 
 
 		 334 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3984  transcriptional regulator, LacI family  43.94 
 
 		 336 aa  243  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.83 
 
 		 338 aa  242  6e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  39.27 
 
 		 342 aa  241  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  42.2 
 
 		 326 aa  239  5.999999999999999e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.15 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  37.8 
 
 		 335 aa  236  4e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  39.71 
 
 		 337 aa  236  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.4 
 
 		 356 aa  233  5e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  37.28 
 
 		 340 aa  232  6e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.69 
 
 		 336 aa  229  4e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  40.06 
 
 		 346 aa  228  8e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.91 
 
 		 352 aa  225  7e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  38.91 
 
 		 348 aa  224  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  36.56 
 
 		 347 aa  222  8e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  34.74 
 
 		 332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  34.74 
 
 		 332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  37.5 
 
 		 349 aa  219  5e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  38.55 
 
 		 346 aa  219  6e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  38.02 
 
 		 355 aa  218  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  38.62 
 
 		 332 aa  217  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.65 
 
 		 339 aa  218  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  37.72 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0187  transcriptional regulator, LacI family  41.87 
 
 		 339 aa  216  2.9999999999999998e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  38.83 
 
 		 361 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  36.06 
 
 		 338 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  32.52 
 
 		 331 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0438  alanine racemase  36.83 
 
 		 338 aa  211  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000864233  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  35.26 
 
 		 339 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4628  transcriptional regulator, LacI family  36.04 
 
 		 332 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656687 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  37.16 
 
 		 353 aa  209  6e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.34 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  38.11 
 
 		 330 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0299  transcriptional regulator protein  36.21 
 
 		 365 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  35.33 
 
 		 339 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  33.33 
 
 		 333 aa  203  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  35.24 
 
 		 334 aa  203  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  34.55 
 
 		 340 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  34.85 
 
 		 337 aa  202  6e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  33.33 
 
 		 331 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2503  transcriptional regulator  31.55 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117668  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7027  LacI family transcription regulator  38.46 
 
 		 353 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  35.63 
 
 		 357 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0779  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.43 
 
 		 342 aa  200  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.561354  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  34.24 
 
 		 338 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  35.12 
 
 		 368 aa  199  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  33.64 
 
 		 328 aa  199  7.999999999999999e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  33.63 
 
 		 337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  33.94 
 
 		 340 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0647  transcriptional regulator, LacI family  36.28 
 
 		 357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2817  LacI family transcription regulator  31.42 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1984  LacI family transcription regulator  34.6 
 
 		 360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4257  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.43 
 
 		 342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  30.7 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  37.72 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  33.64 
 
 		 340 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  33.63 
 
 		 346 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3220  ribose operon repressor  34.69 
 
 		 336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396432  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0304  degradation activator  31.29 
 
 		 332 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3131  transcriptional regulator, LacI family  35.76 
 
 		 334 aa  196  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  hitchhiker  0.005841 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  33.94 
 
 		 340 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  36.39 
 
 		 359 aa  196  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.42 
 
 		 333 aa  195  7e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  36.14 
 
 		 335 aa  195  9e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  33.73 
 
 		 341 aa  194  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  32.13 
 
 		 338 aa  194  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  32.21 
 
 		 335 aa  195  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2686  transcriptional regulator, LacI family  34.64 
 
 		 340 aa  194  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241666  normal  0.163804 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0632  LacI family transcription regulator  31.63 
 
 		 344 aa  195  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  36.93 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.42 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  36.93 
 
 		 323 aa  193  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 348 aa  193  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  36.6 
 
 		 323 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  36.6 
 
 		 323 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  32.74 
 
 		 337 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  36.6 
 
 		 323 aa  192  6e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0812  ribose operon repressor, putative  37.05 
 
 		 343 aa  192  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  34.65 
 
 		 358 aa  192  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  36.6 
 
 		 323 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  36.6 
 
 		 323 aa  192  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  36.6 
 
 		 323 aa  192  7e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>