More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2064 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 325 aa  668    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  42.81 
 
 		 309 aa  223  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  38.49 
 
 		 293 aa  206  4e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  36.51 
 
 		 353 aa  199  6e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  35.81 
 
 		 301 aa  192  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  35.76 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  36.24 
 
 		 346 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  37.96 
 
 		 307 aa  188  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  34.38 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  35.42 
 
 		 294 aa  185  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  36.99 
 
 		 346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  36.73 
 
 		 298 aa  182  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  36.33 
 
 		 336 aa  182  9.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  35.53 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  36.09 
 
 		 292 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  37.77 
 
 		 298 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  36.03 
 
 		 302 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  37.05 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  36.27 
 
 		 303 aa  177  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  34.66 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  35.56 
 
 		 303 aa  176  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0282  periplasmic solute binding protein  34.56 
 
 		 346 aa  174  9.999999999999999e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000440667  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  34.64 
 
 		 344 aa  174  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  35.77 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0623  periplasmic solute binding protein  39.56 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.917925 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  35.43 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  34.19 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  35.29 
 
 		 321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  34.67 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  34.1 
 
 		 371 aa  171  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  33.22 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  33.45 
 
 		 301 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  36.4 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0678  periplasmic solute binding protein  38.46 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0630556 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  33.21 
 
 		 292 aa  169  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  32.69 
 
 		 313 aa  169  5e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1312  periplasmic solute binding protein  37.23 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  32.68 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  35.14 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.64 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  33.45 
 
 		 305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  31.5 
 
 		 303 aa  165  9e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  32.68 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  31.95 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  33.93 
 
 		 309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  32.04 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  32.28 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  31.47 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1164  periplasmic solute binding protein  36.75 
 
 		 321 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1258  periplasmic solute binding protein  42.79 
 
 		 494 aa  160  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00438687  decreased coverage  0.000164305 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  31.17 
 
 		 291 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  33.33 
 
 		 313 aa  159  4e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0800  periplasmic solute binding protein  32.78 
 
 		 335 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.043708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  33.7 
 
 		 292 aa  158  9e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1591  periplasmic solute binding protein  41.35 
 
 		 497 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2846  periplasmic solute binding protein  33.23 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1071  periplasmic solute binding protein  38.71 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0773  periplasmic solute binding protein  32.78 
 
 		 335 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  32.1 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  34.36 
 
 		 309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  35.74 
 
 		 287 aa  156  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  31.33 
 
 		 328 aa  156  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  32.46 
 
 		 304 aa  155  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5591  periplasmic solute binding protein  34.29 
 
 		 339 aa  155  9e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5324  periplasmic solute binding protein  34.92 
 
 		 302 aa  155  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0845  periplasmic solute binding protein  34.32 
 
 		 289 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0688938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3980  periplasmic solute binding protein  30.97 
 
 		 354 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.749936 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  33.58 
 
 		 304 aa  152  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  31.8 
 
 		 291 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  33.23 
 
 		 315 aa  152  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2856  periplasmic solute binding protein  36.52 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  33.23 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3282  periplasmic solute binding protein  31.21 
 
 		 311 aa  149  7e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  31.33 
 
 		 327 aa  149  9e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2472  periplasmic solute binding protein  33.1 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1488  ABC transporter substrate-binding protein  34.17 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.520647  normal  0.191838 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3392  periplasmic solute binding protein  37.31 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00563427  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  31.48 
 
 		 321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  33.56 
 
 		 298 aa  146  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  31.94 
 
 		 305 aa  146  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  32.92 
 
 		 313 aa  145  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02035  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  33.33 
 
 		 303 aa  145  7.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  29.03 
 
 		 311 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10491  ABC transporter substrate-binding protein  32.89 
 
 		 320 aa  145  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3402  periplasmic solute binding protein  33.45 
 
 		 305 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0328  chelated iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  31.62 
 
 		 286 aa  145  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0037  ABC transporter substrate-binding protein  32.49 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  33.95 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  29.13 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  29.13 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  29.13 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  30.03 
 
 		 341 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  28.94 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  30.42 
 
 		 312 aa  142  6e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3170  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  31.05 
 
 		 304 aa  142  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  29.03 
 
 		 311 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  30.52 
 
 		 333 aa  142  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  31.18 
 
 		 292 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2141  periplasmic solute binding protein  32.36 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  31.77 
 
 		 315 aa  139  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>