More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0070 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
702 aa  1417    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  27.36 
 
 
1020 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  25.62 
 
 
969 aa  141  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 
531 aa  136  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  27 
 
 
971 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3521  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.92 
 
 
1022 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1597  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  31.38 
 
 
981 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000711164  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.51 
 
 
819 aa  111  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 
374 aa  107  9e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.89 
 
 
804 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  40.67 
 
 
369 aa  106  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.847548  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  23.68 
 
 
1651 aa  104  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.65 
 
 
819 aa  103  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4555  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 
406 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.330139  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  23 
 
 
1631 aa  100  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2019  GAF sensor hybrid histidine kinase  24.53 
 
 
1016 aa  100  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.25506  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2570  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
381 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3616  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  37.58 
 
 
393 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159723  normal  0.789101 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3131  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.58 
 
 
464 aa  98.6  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0512  response regulator PleD  34.97 
 
 
456 aa  97.4  9e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1391  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 
373 aa  95.5  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.540189  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.74 
 
 
229 aa  95.1  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1422  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 
361 aa  94.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0500  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 
373 aa  94  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2370  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 
414 aa  93.6  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3794  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 
376 aa  93.6  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0277983  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
242 aa  93.2  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.69 
 
 
887 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  36.5 
 
 
355 aa  93.2  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 
566 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  35.19 
 
 
242 aa  92.8  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.15 
 
 
317 aa  92  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1538  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  37.4 
 
 
228 aa  91.7  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.280381 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3109  response regulator receiver  32.61 
 
 
285 aa  91.7  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0893452  normal  0.677049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.67 
 
 
457 aa  91.3  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3787  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.94 
 
 
344 aa  90.9  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.919533  normal  0.90313 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1090  response regulator receiver protein  37.4 
 
 
846 aa  90.9  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874134  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.03 
 
 
801 aa  91.3  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0836  response regulator receiver protein  34.36 
 
 
395 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.53 
 
 
228 aa  90.9  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1200  two component transcriptional regulator  38.52 
 
 
238 aa  90.9  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0506  adenylate/guanylate cyclase  37.98 
 
 
380 aa  90.9  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.149903  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.02 
 
 
231 aa  90.1  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  41.18 
 
 
705 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2317  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  38.03 
 
 
240 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.539006  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2689  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  29.68 
 
 
240 aa  89.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3373  two component transcriptional regulator  37.88 
 
 
238 aa  89.7  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.584151  normal  0.399207 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2887  response regulator receiver modulated serine phosphatase  41.53 
 
 
423 aa  89.4  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  33.12 
 
 
239 aa  89.4  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  42.15 
 
 
403 aa  89.4  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1569  DNA-binding response regulator ResD  37.5 
 
 
250 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45334e-32 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1601  DNA-binding response regulator ResD  37.5 
 
 
250 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953648  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1637  DNA-binding response regulator ResD  37.5 
 
 
250 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0246031  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1777  metal dependent phosphohydrolase, HD region with response regulator receiver modulation  36.51 
 
 
414 aa  89  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1562  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  38.03 
 
 
240 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.279171  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4328  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 
612 aa  89  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0809  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 
367 aa  89  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2261  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  38.03 
 
 
240 aa  89  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.806239  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2477  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  38.03 
 
 
240 aa  89  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0878  response regulator receiver  32.93 
 
 
302 aa  89  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2368  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  38.03 
 
 
240 aa  89  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.531777  normal  0.413146 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2361  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  38.03 
 
 
240 aa  89  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  35.66 
 
 
1119 aa  89  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0702  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.89 
 
 
331 aa  88.2  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  39.34 
 
 
460 aa  88.6  4e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3019  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  38.03 
 
 
240 aa  88.6  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0767733 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1475  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  31.82 
 
 
311 aa  88.2  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2294  two component transcriptional regulator  30.36 
 
 
228 aa  88.2  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305192  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0045  adenylate/guanylate cyclase  33.12 
 
 
382 aa  88.2  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1502  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  31.82 
 
 
311 aa  88.2  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01984  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with BaeS  38.03 
 
 
240 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1577  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.03 
 
 
240 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1399  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 
238 aa  87.8  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129694  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3123  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.42 
 
 
312 aa  88.2  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1392  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.43 
 
 
584 aa  88.2  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623748  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01976  hypothetical protein  38.03 
 
 
240 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2221  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  38.03 
 
 
240 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0981  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  38.03 
 
 
240 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.443633  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2371  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  38.03 
 
 
240 aa  87.8  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1154  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  38.03 
 
 
240 aa  87.8  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0825  response regulator receiver  34.85 
 
 
204 aa  87.8  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.63 
 
 
679 aa  87.4  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.381542  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  37.61 
 
 
170 aa  87.4  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2343  two component transcriptional regulator  41.6 
 
 
243 aa  87.8  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00929975  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1118  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
452 aa  87.4  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000972917  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1278  sensory box protein/response regulator  42.02 
 
 
705 aa  87.4  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.517683  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.53 
 
 
238 aa  87  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.32 
 
 
247 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3625  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.11 
 
 
322 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  33.61 
 
 
1127 aa  87  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0298  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.3 
 
 
331 aa  87  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.7054  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.76 
 
 
345 aa  86.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 
223 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.51 
 
 
454 aa  87  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2180  response regulator receiver  34.85 
 
 
151 aa  87  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269305  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3111  response regulator receiver protein  32.49 
 
 
328 aa  87  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1386  DNA-binding response regulator ResD  39.32 
 
 
238 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  35.54 
 
 
385 aa  85.9  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1030  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.33 
 
 
330 aa  85.9  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3541  response regulator PleD  36.97 
 
 
457 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>