More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0255 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 251 aa  511  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  63.27 
 
 		 252 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  61.94 
 
 		 253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  61.63 
 
 		 252 aa  311  7.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  65.2 
 
 		 254 aa  301  9e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  59.51 
 
 		 253 aa  295  7e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  55.87 
 
 		 258 aa  277  9e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  57.43 
 
 		 259 aa  276  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  56.05 
 
 		 253 aa  271  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  56.33 
 
 		 254 aa  261  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 268 aa  249  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 257 aa  248  7e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 251 aa  234  8e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 251 aa  234  8e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 251 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  47.33 
 
 		 270 aa  230  2e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  45.02 
 
 		 274 aa  221  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  48.24 
 
 		 271 aa  215  5e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  44.08 
 
 		 278 aa  203  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  35.95 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  39.37 
 
 		 255 aa  168  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 245 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  36.14 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  37.55 
 
 		 254 aa  163  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  36.55 
 
 		 243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  37.05 
 
 		 243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  36.65 
 
 		 243 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  37.05 
 
 		 243 aa  160  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  36.65 
 
 		 243 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  36.65 
 
 		 243 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  35.86 
 
 		 244 aa  159  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  37.2 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  35.86 
 
 		 244 aa  156  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  39.68 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  32.79 
 
 		 254 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  31.97 
 
 		 254 aa  143  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  40.16 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3670  MerR family transcriptional regulator  60 
 
 		 377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.87615  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 238 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1012  methyltransferase type 11  56.56 
 
 		 429 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.878034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  32.65 
 
 		 244 aa  130  3e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  34.68 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  33.59 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  33.06 
 
 		 245 aa  125  7e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  29.76 
 
 		 253 aa  125  9e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 258 aa  118  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  30.36 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  28.27 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  27.85 
 
 		 249 aa  108  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2739  MerR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 270 aa  102  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  29.44 
 
 		 250 aa  97.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1629  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  35.92 
 
 		 148 aa  95.9  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651813  normal  0.0608845 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2183  putative transcriptional regulator, MerR family  32.37 
 
 		 242 aa  92  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  31.13 
 
 		 252 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  27.95 
 
 		 251 aa  90.5  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2100  transcriptional regulator, MerR family  27.57 
 
 		 284 aa  89  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.444835  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 342 aa  85.1  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  40.37 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0639  transcriptional regulator, MerR family  34.26 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0264  MerR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  39.45 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  39.64 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0217  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323328 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2871  TipAS antibiotic-recognition  32.52 
 
 		 170 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  45.78 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  38.53 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 343 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6769  transcriptional regulator, MerR family  34.84 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.220453  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  50.67 
 
 		 339 aa  78.6  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2414  MerR family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  47.87 
 
 		 288 aa  78.6  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2462  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  23.55 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1581  hypothetical protein  44.58 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  49.25 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 342 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 342 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>