More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2484 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 		 266 aa  531  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  73.21 
 
 		 266 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  75.09 
 
 		 266 aa  385  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  69.43 
 
 		 268 aa  368  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.4 
 
 		 266 aa  346  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.51 
 
 		 266 aa  339  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  64.91 
 
 		 267 aa  329  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.89 
 
 		 273 aa  256  2e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.34 
 
 		 268 aa  255  5e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.96 
 
 		 268 aa  253  3e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0733  indole-3-glycerol-phosphate synthase  59.07 
 
 		 266 aa  251  8.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.69 
 
 		 264 aa  251  8.000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.31 
 
 		 264 aa  251  1e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2024  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.08 
 
 		 262 aa  249  3e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.92 
 
 		 270 aa  249  4e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.49 
 
 		 271 aa  248  6e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0594  indole-3-glycerol phosphate synthase  52.65 
 
 		 278 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.96 
 
 		 266 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.19 
 
 		 265 aa  244  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.33 
 
 		 264 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.19 
 
 		 266 aa  244  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  51.54 
 
 		 271 aa  244  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4579  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.27 
 
 		 278 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0514187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.71 
 
 		 266 aa  242  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.81 
 
 		 295 aa  242  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  50.38 
 
 		 267 aa  241  6e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.46 
 
 		 276 aa  240  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  49.25 
 
 		 265 aa  239  4e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  50 
 
 		 263 aa  239  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 		 263 aa  239  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.56 
 
 		 272 aa  239  4e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 		 278 aa  239  5e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3944  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.89 
 
 		 279 aa  237  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0870  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.93 
 
 		 295 aa  236  3e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.474663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3876  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.19 
 
 		 262 aa  236  4e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.82 
 
 		 271 aa  235  6e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5113  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.62 
 
 		 278 aa  235  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0792  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.14 
 
 		 278 aa  235  6e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04004  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.15 
 
 		 265 aa  234  9e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.76 
 
 		 278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3520  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.79 
 
 		 270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4781  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 		 277 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.574175 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3026  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.68 
 
 		 267 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114163  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1529  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.56 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.260745  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 		 261 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0422  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 		 277 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.909241 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 		 264 aa  231  9e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0455  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 		 277 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.811875  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13441  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.44 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.847237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.44 
 
 		 266 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.89 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.49 
 
 		 268 aa  229  3e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1897  indole-3-glycerol phosphate synthase  48.85 
 
 		 263 aa  229  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.995297  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  50 
 
 		 267 aa  229  5e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3181  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.52 
 
 		 270 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.509881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.69 
 
 		 266 aa  229  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4483  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.57 
 
 		 272 aa  228  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249423  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0895  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.36 
 
 		 258 aa  228  7e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1733  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.43 
 
 		 281 aa  228  8e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.582058  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2778  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.46 
 
 		 262 aa  228  9e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000331448  hitchhiker  0.0000255859 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3173  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.43 
 
 		 265 aa  228  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.568636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.76 
 
 		 265 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0370  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.06 
 
 		 266 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  48.08 
 
 		 288 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.46 
 
 		 263 aa  226  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19771  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.59 
 
 		 301 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0661236 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.11 
 
 		 264 aa  226  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3559  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.54 
 
 		 261 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.723493  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2912  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.92 
 
 		 261 aa  225  6e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2466  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.57 
 
 		 272 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00979183  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.54 
 
 		 261 aa  225  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0864  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.98 
 
 		 258 aa  225  7e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1822  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.77 
 
 		 270 aa  225  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025467 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2829  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.43 
 
 		 265 aa  224  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.232078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0452  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.24 
 
 		 277 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.42981  normal  0.418549 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2332  indole-3-glycerol phosphate synthase  48.29 
 
 		 268 aa  224  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0361  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.3 
 
 		 266 aa  224  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1566  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.74 
 
 		 263 aa  223  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.04 
 
 		 267 aa  222  4e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.927898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.21 
 
 		 265 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3578  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.77 
 
 		 261 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0530  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.77 
 
 		 261 aa  222  6e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.343706  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0647  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.77 
 
 		 261 aa  222  6e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.83 
 
 		 271 aa  222  6e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0943  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.77 
 
 		 261 aa  222  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0145  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.04 
 
 		 267 aa  221  6e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.694484  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1913  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.77 
 
 		 261 aa  222  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0770  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.11 
 
 		 267 aa  221  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2017  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.38 
 
 		 270 aa  221  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00220799  normal  0.525687 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  48.45 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.74 
 
 		 271 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.21 
 
 		 287 aa  219  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1838  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.46 
 
 		 264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.79 
 
 		 269 aa  218  6e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1409  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.43 
 
 		 271 aa  217  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.827257  normal  0.309445 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0458  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.15 
 
 		 261 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.1 
 
 		 285 aa  217  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1877  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.31 
 
 		 266 aa  216  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.597244  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.91 
 
 		 265 aa  217  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0460  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.76 
 
 		 261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.212838 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>