More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0813 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
365 aa  730    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  31.71 
 
 
268 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  30.74 
 
 
268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  29.58 
 
 
395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  30.42 
 
 
278 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3399  peptidase M48 Ste24p  36.48 
 
 
362 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  31.98 
 
 
480 aa  106  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2756  peptidase M48, Ste24p  35.86 
 
 
354 aa  105  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114844  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  31.34 
 
 
264 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  31.88 
 
 
280 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  36.04 
 
 
486 aa  103  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  33.15 
 
 
424 aa  102  7e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3622  peptidase M48 Ste24p  32.4 
 
 
383 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  33.46 
 
 
500 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3686  peptidase M48 Ste24p  35.48 
 
 
383 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5225  peptidase M48 Ste24p  28.94 
 
 
358 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.32225 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1396  peptidase M48 Ste24p  28.36 
 
 
269 aa  100  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  32.7 
 
 
484 aa  99.8  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  30.63 
 
 
392 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  32.74 
 
 
494 aa  98.6  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3534  peptidase M48, Ste24p  34.08 
 
 
383 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2660  peptidase M48 Ste24p  35.11 
 
 
395 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.110854 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  29.79 
 
 
483 aa  97.4  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  31.36 
 
 
269 aa  97.1  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2378  peptidase M48 Ste24p  34.97 
 
 
640 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  31.02 
 
 
365 aa  96.7  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0188  peptidase M48 Ste24p  30.85 
 
 
632 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  33.49 
 
 
289 aa  96.3  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0072  peptidase M48 Ste24p  29.38 
 
 
260 aa  95.9  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0070  peptidase M48 Ste24p  29.38 
 
 
260 aa  95.9  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  30.85 
 
 
632 aa  95.9  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.457604 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  33.05 
 
 
569 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  33.49 
 
 
284 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  33.47 
 
 
561 aa  95.1  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0130  peptidase M48, Ste24p  31 
 
 
528 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  33.05 
 
 
567 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  33.01 
 
 
502 aa  94  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  34.11 
 
 
562 aa  94  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  38.22 
 
 
279 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  38.22 
 
 
279 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  32.71 
 
 
489 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  30.45 
 
 
269 aa  92.8  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  36.84 
 
 
560 aa  92.8  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  36.42 
 
 
573 aa  92.8  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  36.84 
 
 
589 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  36.84 
 
 
572 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  35.34 
 
 
278 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  36.84 
 
 
589 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  36.84 
 
 
572 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0233  peptidase M48 Ste24p  32.31 
 
 
289 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  36.84 
 
 
572 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  36.84 
 
 
572 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  31.78 
 
 
473 aa  91.7  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
483 aa  91.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  32.18 
 
 
266 aa  91.3  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0508  peptidase M48, Ste24p  28.74 
 
 
279 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  33.99 
 
 
285 aa  91.3  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1200  peptidase M48 Ste24p  32.42 
 
 
275 aa  90.9  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  36.46 
 
 
445 aa  90.5  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  31.1 
 
 
347 aa  90.5  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  31.86 
 
 
605 aa  90.1  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  30 
 
 
269 aa  90.1  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  30 
 
 
269 aa  90.1  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  36.26 
 
 
474 aa  90.1  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0222  peptidase M48 Ste24p  33.02 
 
 
289 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01850  mitochondrial inner membrane metallopeptidase Oma1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09730)  37.06 
 
 
376 aa  89.4  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  36.26 
 
 
589 aa  89.4  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  34.12 
 
 
487 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  34.12 
 
 
487 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1935  peptidase M48 Ste24p  30.35 
 
 
271 aa  89  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  32.71 
 
 
475 aa  89.4  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  34.12 
 
 
487 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  34.12 
 
 
487 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  34.12 
 
 
487 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0483  peptidase M48 Ste24p  35 
 
 
490 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260218 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  31.28 
 
 
262 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  33.49 
 
 
483 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  30.09 
 
 
272 aa  88.6  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  31.5 
 
 
604 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  31.34 
 
 
487 aa  87.8  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  36.53 
 
 
564 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  28.76 
 
 
248 aa  87.4  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  36.53 
 
 
588 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0218  peptidase M48 Ste24p  30.33 
 
 
311 aa  87.4  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  35.67 
 
 
564 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0203  peptidase M48, Ste24p  30.81 
 
 
291 aa  87.8  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  33.17 
 
 
489 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  32.64 
 
 
533 aa  87.4  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  36.53 
 
 
588 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  36.53 
 
 
588 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  30.15 
 
 
269 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  31.86 
 
 
266 aa  87  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  35.67 
 
 
564 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0492  peptidase M48 Ste24p  33.05 
 
 
553 aa  86.7  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0157273 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1185  hypothetical protein  30.9 
 
 
478 aa  86.7  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6512  peptidase M48 Ste24p  34.91 
 
 
267 aa  87  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00139826  normal  0.073163 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  30.15 
 
 
269 aa  86.7  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  30.05 
 
 
265 aa  86.7  6e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1179  hypothetical protein  30.9 
 
 
478 aa  86.7  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0229  peptidase M48, Ste24p  35.62 
 
 
553 aa  86.7  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00038191  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>