69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0062 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0062  Zn-dependent protease-like protein  100 
 
 		 620 aa  1292    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0621  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.54 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2405  hypothetical protein  25 
 
 		 444 aa  70.1  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0754  hypothetical protein  25.86 
 
 		 454 aa  69.3  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31840  hypothetical protein  25.78 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6028  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.92 
 
 		 467 aa  64.7  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0978  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.28 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0215485  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3242  hypothetical protein  26.41 
 
 		 453 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.033407  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0543  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.93 
 
 		 446 aa  63.5  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  26.27 
 
 		 453 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4996  Zn-dependent protease  25.97 
 
 		 453 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.4 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4000  Zn-dependent protease  24.89 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.60746  hitchhiker  0.0000000571903 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3127  hypothetical protein  25.54 
 
 		 453 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1374  hypothetical protein  25.54 
 
 		 453 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1094  hypothetical protein  25.54 
 
 		 454 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.81 
 
 		 439 aa  60.5  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2359  hypothetical protein  25.54 
 
 		 454 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2065  hypothetical protein  25.54 
 
 		 453 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1458  hypothetical protein  25.54 
 
 		 453 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.5 
 
 		 438 aa  59.7  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4768  hypothetical protein  25 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.280128 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1901  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.61 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2706  hypothetical protein  24.78 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169347  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0408  hypothetical protein  24.44 
 
 		 441 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.47 
 
 		 445 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3720  hypothetical protein  24.67 
 
 		 448 aa  55.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.54 
 
 		 470 aa  55.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1453  hypothetical protein  26.58 
 
 		 453 aa  54.3  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09231  putative modulator of DNA gyrase  27.95 
 
 		 459 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.276659  hitchhiker  0.00000210119 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.12 
 
 		 439 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4148  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.67 
 
 		 492 aa  53.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.516156  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  33.94 
 
 		 449 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4162  Zn-dependent protease  24.05 
 
 		 447 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0996  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.81 
 
 		 427 aa  52.4  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.100891 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39830  hypothetical protein  26.81 
 
 		 439 aa  51.6  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0754435  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4122  putative Zn-dependent protease  23.63 
 
 		 447 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4950  hypothetical protein  24.89 
 
 		 439 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.26 
 
 		 433 aa  49.3  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.14 
 
 		 445 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0326  TldD/PmbA family protein  32.11 
 
 		 449 aa  49.7  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2559  hypothetical protein  26.48 
 
 		 418 aa  49.7  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0278  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.19 
 
 		 430 aa  48.9  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.026735  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2692  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.42 
 
 		 425 aa  48.5  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4320  hypothetical protein  25.1 
 
 		 511 aa  47.8  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0313  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  21.37 
 
 		 428 aa  48.1  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2115  peptidase PmbA  27.94 
 
 		 447 aa  47.4  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002397  PmbA protein  29.1 
 
 		 447 aa  47.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5246  hypothetical protein  23.01 
 
 		 445 aa  47  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1148  hypothetical protein  26.47 
 
 		 472 aa  46.6  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0910313 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0365  putative modulator of DNA gyrase  28.3 
 
 		 462 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10471  putative modulator of DNA gyrase  28.3 
 
 		 462 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0348305  hitchhiker  0.00321513 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4823  hypothetical protein  24.43 
 
 		 439 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0183457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3671  protease TldD  31.43 
 
 		 481 aa  45.8  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0044  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.97 
 
 		 442 aa  45.8  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1427  hypothetical protein  25.88 
 
 		 444 aa  45.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.6198  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1709  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.47 
 
 		 441 aa  46.2  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2275  Zn-dependent protease and their inactivated protein-like protein  26.61 
 
 		 465 aa  45.8  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000955106  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1167  modulator of DNA gyrase  29.01 
 
 		 455 aa  45.8  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.975255  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1308  modulator of DNA gyrase  27.27 
 
 		 456 aa  45.8  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28 
 
 		 443 aa  45.4  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0719088  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3439  hypothetical protein  25.12 
 
 		 456 aa  45.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189451 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1165  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.55 
 
 		 444 aa  45.1  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.860051  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4999  hypothetical protein  23.98 
 
 		 439 aa  44.7  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.75 
 
 		 448 aa  44.7  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.16 
 
 		 470 aa  44.3  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3803  hypothetical protein  23.21 
 
 		 457 aa  44.3  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85728  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0490  protein TldD  32.38 
 
 		 481 aa  43.9  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2560  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.38 
 
 		 479 aa  43.9  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206592  normal  0.703309 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>