More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1377 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1377  putative UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  100 
 
 		 238 aa  483  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1196  Nucleotidyl transferase  40.34 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0102  nucleotidyl transferase  40.68 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1212  di-myo-inositol-1,3'-phosphate-1'-phosphate synthase / CTP:L-myo-inositol-1-phosphate cytidylyltransferase  34.51 
 
 		 436 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.35 
 
 		 428 aa  102  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  26.38 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7110  transferase  31.58 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1312  nucleotidyl transferase  27.63 
 
 		 241 aa  72  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203499  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1374  nucleotidyl transferase  27.63 
 
 		 241 aa  72  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000214203  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  35.94 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  27.24 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  29.64 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  26.84 
 
 		 392 aa  69.3  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0726  transferase, putative  30 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  34.38 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.7 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2300  Nucleotidyl transferase  39.67 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.706405  normal  0.0677947 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  28.16 
 
 		 392 aa  65.9  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  27.35 
 
 		 399 aa  65.5  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  28.45 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  26.77 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.08 
 
 		 355 aa  62  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  34.78 
 
 		 393 aa  62  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  26.51 
 
 		 832 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.4 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  30.61 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  27.69 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1354  sugar nucleotidyltransferase-like protein  30.67 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  26.17 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  25.75 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23.36 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  25.65 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.11 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  23.58 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  29.94 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0016  transferase, putative  32.16 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  34.78 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  22.22 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  26.94 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  33.63 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  31.86 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  30.43 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  28.99 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.31 
 
 		 355 aa  59.3  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  32.43 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  25.21 
 
 		 396 aa  58.9  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  25.75 
 
 		 400 aa  58.5  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  26.26 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0969  nucleotidyl transferase  36.84 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0165491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  26.44 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  25.21 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  25.3 
 
 		 832 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  24.86 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1019  nucleotidyl transferase  39.42 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176753  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0994  nucleotidyl transferase  37.82 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.65594  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2657  nucleotidyl transferase  24.11 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  31.48 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.48 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02245  nucleotidyl transferase  30.77 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.9499  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  25.91 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1423  hypothetical protein  25.47 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0459324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.02 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.4 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  25.82 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0722  nucleotidyltransferase family protein  29.88 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.646872  normal  0.0100327 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  25 
 
 		 397 aa  56.2  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  30.56 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  25.44 
 
 		 391 aa  55.8  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3110  nucleotidyl transferase  34.75 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  30.48 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3204  nucleotidyl transferase  35.04 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0602858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  27 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2814  nucleotidyl transferase  29.03 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164974  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  26.59 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  24.89 
 
 		 401 aa  55.5  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.61 
 
 		 357 aa  55.1  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  27.54 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1959  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  24.78 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0146821  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3032  nucleotidyltransferase family protein  33.08 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4108  Nucleotidyl transferase  27.76 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  27.16 
 
 		 366 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.09 
 
 		 355 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  33.08 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  27.32 
 
 		 854 aa  54.7  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0079  Nucleotidyl transferase  28.74 
 
 		 240 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.05 
 
 		 357 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0982  nucleotidyl transferase  36.22 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0968395  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1084  nucleotidyl transferase  36.22 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  27.69 
 
 		 383 aa  53.9  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1051  nucleotidyl transferase  36.22 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00300889  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  28.21 
 
 		 402 aa  53.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.1 
 
 		 357 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3303  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase / diamine N-acetyltransferase  30.38 
 
 		 459 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1250  nucleotidyl transferase  24.77 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.396561  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  37.84 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  22.59 
 
 		 411 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3307  Nucleotidyl transferase  36.22 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.276059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  24.19 
 
 		 712 aa  53.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  30.04 
 
 		 402 aa  53.5  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  25.31 
 
 		 820 aa  53.5  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>