More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1019 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1019  nucleotidyl transferase  100 
 
 
229 aa  463  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176753  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0969  nucleotidyl transferase  73.25 
 
 
229 aa  355  5e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0165491  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0867  nucleotidyl transferase  65.5 
 
 
222 aa  296  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0335423  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0910  nucleotidyl transferase  67.4 
 
 
222 aa  294  7e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00048093  normal  0.372808 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0884  nucleotidyl transferase  63.4 
 
 
249 aa  291  6e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000795934  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3204  nucleotidyl transferase  66.81 
 
 
221 aa  291  8e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0602858  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2883  nucleotidyl transferase  62.93 
 
 
239 aa  290  9e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245528  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3110  nucleotidyl transferase  66.08 
 
 
222 aa  290  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133152  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3634  nucleotidyltransferase family protein  64.16 
 
 
226 aa  280  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0982  nucleotidyl transferase  62.72 
 
 
225 aa  275  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0968395  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1084  nucleotidyl transferase  62.72 
 
 
225 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166383  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3307  Nucleotidyl transferase  62.72 
 
 
225 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.276059  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1051  nucleotidyl transferase  61.84 
 
 
225 aa  268  4e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00300889  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0994  nucleotidyl transferase  62.39 
 
 
225 aa  268  7e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.65594  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2814  nucleotidyl transferase  60 
 
 
226 aa  266  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164974  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3074  nucleotidyl transferase  58.52 
 
 
232 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5130  nucleotidyl transferase  54.5 
 
 
223 aa  229  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1452  Nucleotidyl transferase  56 
 
 
243 aa  228  4e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748194  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0437  nucleotidyl transferase  55.56 
 
 
223 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0406  nucleotidyl transferase  55.11 
 
 
223 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4796  nucleotidyl transferase  53.28 
 
 
223 aa  224  7e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.814441  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  54.67 
 
 
223 aa  224  8e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0565  nucleotidyl transferase  55.56 
 
 
222 aa  223  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2335  putative nucleotidyl transferase  53.07 
 
 
237 aa  221  9e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.512409 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4008  nucleotidyl transferase  53.78 
 
 
223 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  52.42 
 
 
223 aa  219  3.9999999999999997e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4622  nucleotidyl transferase  53.81 
 
 
240 aa  218  7e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2147  nucleotidyl transferase  53.51 
 
 
221 aa  216  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07790  putative nucleotidyl transferase  52.89 
 
 
224 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3416  nucleotidyl transferase  50.21 
 
 
250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.307515  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0741  putative nucleotidyl transferase  52.02 
 
 
224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0127  nucleotidyl transferase  51.52 
 
 
234 aa  209  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2300  Nucleotidyl transferase  51.95 
 
 
230 aa  209  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.706405  normal  0.0677947 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3661  nucleotidyl transferase  50.44 
 
 
223 aa  207  7e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1872  nucleotidyl transferase  50.44 
 
 
236 aa  206  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0599  nucleotidyltransferase family protein  51.32 
 
 
232 aa  204  8e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1576  Nucleotidyl transferase  50.66 
 
 
238 aa  204  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46780  nucleotidyl transferase  52.91 
 
 
222 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1018  nucleotidyl transferase  50 
 
 
228 aa  203  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352994  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0556  nucleotidyltransferase family protein  51.9 
 
 
210 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2431  nucleotidyl transferase  53.15 
 
 
223 aa  202  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  49.79 
 
 
222 aa  199  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0493  nucleotidyl transferase  48.92 
 
 
245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.427783  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2073  nucleotidyl transferase  48.66 
 
 
220 aa  197  7.999999999999999e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4828  nucleotidyl transferase  48.25 
 
 
232 aa  197  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4026  putative nucleotidyl transferase  47.84 
 
 
241 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0975  Nucleotidyl transferase  45.83 
 
 
236 aa  192  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395928  normal  0.0477553 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3512  nucleotidyl transferase  49.34 
 
 
228 aa  192  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0511  putative mannose-1-phosphate guanyltransferase-related protein  48.25 
 
 
241 aa  192  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.560778  normal  0.0591515 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0433  nucleotidyl transferase  46.75 
 
 
232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.73488  normal  0.148714 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0673  Nucleotidyl transferase  47.26 
 
 
242 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1652  nucleotidyl transferase  49.1 
 
 
232 aa  187  8e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1716  nucleotidyl transferase  46.94 
 
 
240 aa  187  1e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0694785  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1646  nucleotidyl transferase  46.53 
 
 
240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.233302  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1517  nucleotidyl transferase  45.78 
 
 
246 aa  182  3e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.631437  normal  0.41315 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3032  nucleotidyltransferase family protein  47.98 
 
 
229 aa  182  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  47.98 
 
 
229 aa  182  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0402  Nucleotidyl transferase  46.29 
 
 
234 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.707685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0387  Nucleotidyl transferase  47.35 
 
 
230 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  47.21 
 
 
232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6040  nucleotidyl transferase  46.15 
 
 
239 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1696  nucleotidyl transferase  44.2 
 
 
242 aa  179  4e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.114305  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02245  nucleotidyl transferase  45.15 
 
 
236 aa  178  4.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.9499  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0586  nucleotidyl transferase  46.15 
 
 
240 aa  178  7e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0394  nucleotidyl transferase  47.21 
 
 
232 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.824565  normal  0.063826 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4057  nucleotidyl transferase  47.5 
 
 
245 aa  176  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2740  nucleotidyl transferase  45.73 
 
 
240 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518203  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2631  nucleotidyl transferase  45.3 
 
 
239 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311513  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2101  nucleotidyl transferase  45.73 
 
 
240 aa  174  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.539682  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2713  nucleotidyl transferase  45.73 
 
 
240 aa  174  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0690  nucleotidyl transferase family protein  44.12 
 
 
239 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0206  nucleotidyltransferase family protein  44.12 
 
 
239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2419  nucleotidyltransferase family protein  44.3 
 
 
231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0868  nucleotidyltransferase family protein  44.12 
 
 
239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0704  nucleotidyl transferase family protein  44.12 
 
 
239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2739  nucleotidyltransferase family protein  44.12 
 
 
239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2339  nucleotidyltransferase family protein  44.12 
 
 
239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329535  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1752  nucleotidyl transferase  43.86 
 
 
251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2765  nucleotidyl transferase  45.76 
 
 
239 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0109  nucleotidyl transferase family protein  41.96 
 
 
219 aa  171  5.999999999999999e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00238886  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2073  mannose-1-phosphate guanyltransferase  41.96 
 
 
219 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.403503  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0573  nucleotidyltransferase family protein  44.59 
 
 
239 aa  167  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0348  hypothetical protein  42.08 
 
 
220 aa  165  5e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0373  hypothetical protein  41.33 
 
 
220 aa  164  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0257  putative mannose-1-phosphate guanyltransferase-related protein  43.72 
 
 
234 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5261  Nucleotidyl transferase  45.8 
 
 
236 aa  161  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0742  transaldolase AB  41.94 
 
 
230 aa  155  6e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4583  nucleotidyl transferase  42.21 
 
 
263 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.693762  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0085  nucleotidyl transferase  39.39 
 
 
272 aa  151  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.420165  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0194  nucleotidyl transferase  40.89 
 
 
247 aa  149  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0983981 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0963  nucleotidyl transferase  43.36 
 
 
244 aa  149  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.168083  hitchhiker  0.00146596 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3958  nucleotidyl transferase  39.75 
 
 
271 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3308  nucleotidyl transferase  39.75 
 
 
271 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0218  nucleotidyl transferase  37.1 
 
 
274 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0125725 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0937  nucleotidyl transferase  39.33 
 
 
272 aa  143  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  33.73 
 
 
785 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1607  Nucleotidyl transferase  34.05 
 
 
248 aa  112  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0819429  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  32.93 
 
 
784 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  32.93 
 
 
784 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
784 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>