237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2748 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2748  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 149 aa  309  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2301  thioesterase superfamily protein  39.29 
 
 		 149 aa  100  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0934  thioesterase superfamily protein  36.77 
 
 		 181 aa  89.7  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11530  predicted thioesterase  32.28 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4181  hypothetical protein  36.43 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2639  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 166 aa  77  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0958965  normal  0.564769 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 		 132 aa  76.6  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1355  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000561668 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24680  predicted thioesterase  31.64 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.489708  normal  0.117336 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  33.33 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04420  predicted thioesterase  31.51 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17668  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  33.07 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08950  predicted thioesterase  29.49 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.936041  normal  0.0657601 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1058  putative thioesterase  37.04 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  33.81 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  32.12 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1095  thioesterase superfamily protein  31.01 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  30.5 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  30.83 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  32 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3156  thioesterase superfamily protein  32.37 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2608  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7358  thioesterase superfamily protein  35.85 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6384  thioesterase superfamily protein  35.86 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0187489  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 146 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 146 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  29.1 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0973  hypothetical protein  27.54 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0326933 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1693  thioesterase family protein  31.62 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1114  thioesterase family protein  31.62 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224064  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0944  thioesterase family protein  31.62 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1871  thioesterase family protein  31.62 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  31.82 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1644  thioesterase superfamily protein  34.13 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1717  thioesterase family protein  31.62 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3415  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1556  thioesterase family protein  31.62 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000380649  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0217  thioesterase family protein  31.62 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0748592  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  27.94 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5551  putative thioesterase  31.06 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  27.94 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  27.94 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  34.62 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00219  thioesterase family protein  30.22 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  34.15 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  31.01 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3994  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  27.41 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1841  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.61 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00333557  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4476  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  29.92 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3424  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996991  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  26.12 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  28.26 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3570  thioesterase superfamily protein  31.54 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3775  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.752542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2680  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0073  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4185  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  29.84 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 		 175 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1613  thioesterase superfamily protein  33.87 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  29.17 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1586  hypothetical protein  30 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.689627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0426  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1040  hypothetical protein  30 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  25.4 
 
 		 143 aa  52  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0326  hypothetical protein  30 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  29.03 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  29.03 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2862  thioesterase superfamily protein  27.4 
 
 		 292 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4436  hypothetical protein  31.2 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4343  thioesterase superfamily protein  26.19 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2677  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 		 140 aa  50.1  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1386  hypothetical protein  33.66 
 
 		 158 aa  50.4  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.402075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>