More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3112 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3112  signal peptide peptidase SppA, 36K type  100 
 
 		 293 aa  579  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1150  signal peptide peptidase SppA, 36K type  94.2 
 
 		 293 aa  501  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  60.96 
 
 		 301 aa  363  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2285  signal peptide peptidase SppA, 36K type  64.41 
 
 		 298 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2551  signal peptide peptidase SppA, 36K type  63.06 
 
 		 295 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.210829  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  66.15 
 
 		 260 aa  340  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2497  signal peptide peptidase SppA, 36K type  65.88 
 
 		 295 aa  326  3e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.609347  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  53.23 
 
 		 298 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  51.13 
 
 		 299 aa  236  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.77 
 
 		 290 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0236  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.49 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0147104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.23 
 
 		 297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  48.94 
 
 		 316 aa  212  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0508  signal peptide peptidase A  44.18 
 
 		 280 aa  209  6e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  48.29 
 
 		 382 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  48.29 
 
 		 382 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.35 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000244919  normal  0.445804 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.9 
 
 		 366 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4106  signal peptide peptidase A  41.35 
 
 		 303 aa  204  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.827209  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  46.12 
 
 		 274 aa  202  6e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  49.77 
 
 		 296 aa  195  7e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.24 
 
 		 282 aa  193  3e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0403  signal peptide peptidase SppA, 36K type  48.08 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.469925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  48.08 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.54 
 
 		 299 aa  191  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1689  signal peptide peptidase A  46.92 
 
 		 273 aa  183  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5345  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.02 
 
 		 274 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4753  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.31 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0127167  hitchhiker  0.0000000108216 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13731  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  52.11 
 
 		 269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1916  signal peptide peptidase A  47.03 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.85 
 
 		 335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  50.75 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  49.49 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.33 
 
 		 336 aa  178  9e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  49.24 
 
 		 269 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13811  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  50.78 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.99906  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.07 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2255  signal peptide peptidase SppA  45.5 
 
 		 273 aa  177  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.221521  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.86 
 
 		 348 aa  176  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2329  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.8 
 
 		 383 aa  177  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2494  signal peptide peptidase A  41.31 
 
 		 272 aa  176  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1781  peptidase S49, SppA  43.1 
 
 		 270 aa  176  5e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06151  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  45 
 
 		 270 aa  176  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0720976 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.55 
 
 		 339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.36 
 
 		 371 aa  171  1e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0799  signal peptide peptidase A  45.02 
 
 		 269 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16541  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  45.02 
 
 		 269 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.29 
 
 		 342 aa  169  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0583  signal peptide peptidase A  46.12 
 
 		 273 aa  169  7e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12671  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  46.7 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000540358 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.11 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.43 
 
 		 324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.38 
 
 		 327 aa  161  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0228  protease IV  34.1 
 
 		 297 aa  157  1e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.53 
 
 		 605 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.41 
 
 		 656 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  44.44 
 
 		 340 aa  157  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1590  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.21 
 
 		 307 aa  156  3e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.152894  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  38.02 
 
 		 608 aa  152  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.21 
 
 		 311 aa  152  5e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.16 
 
 		 598 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.16 
 
 		 598 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.02 
 
 		 326 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000360798  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2467  protease IV; signal peptide peptidase  38.1 
 
 		 583 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.023523 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0361  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.39 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.366365  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0373  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.49 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0119133  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1425  protease 4  39.55 
 
 		 622 aa  149  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1213  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.37 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2021  protease 4  39.55 
 
 		 618 aa  149  6e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124959  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1850  protease 4  39.55 
 
 		 618 aa  149  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115674  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1962  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.45 
 
 		 329 aa  149  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0118482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1503  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.86 
 
 		 287 aa  149  6e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1866  protease 4  39.55 
 
 		 618 aa  149  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235233  decreased coverage  0.00000640053 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01735  protease IV (signal peptide peptidase)  39.55 
 
 		 618 aa  148  9e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0080246  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1876  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.55 
 
 		 618 aa  148  9e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00501003  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0020  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.56 
 
 		 319 aa  148  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184229 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01723  hypothetical protein  39.55 
 
 		 618 aa  148  9e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1990  protease 4  39.55 
 
 		 618 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152485  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3163  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.88 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1937  signal peptide peptidase A  36.59 
 
 		 410 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.003866  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3198  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.21 
 
 		 313 aa  146  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.45 
 
 		 587 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1681  protease 4  39.46 
 
 		 618 aa  146  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.239548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0288  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.15 
 
 		 286 aa  145  6e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3671  signal peptide peptidase A  37 
 
 		 322 aa  145  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.95 
 
 		 615 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000218784  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0907  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36 
 
 		 282 aa  144  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000565575 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2585  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.64 
 
 		 637 aa  143  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.27 
 
 		 611 aa  143  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2294  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.94 
 
 		 615 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000944101  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1901  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.14 
 
 		 613 aa  143  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000029404  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.07 
 
 		 615 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0685  peptidase S49, SppA  34.85 
 
 		 289 aa  143  4e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.22 
 
 		 617 aa  143  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.94 
 
 		 615 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.94 
 
 		 615 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000075558  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0867  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.74 
 
 		 595 aa  142  9e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.74 
 
 		 605 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0908  protease IV family protein  37.4 
 
 		 621 aa  141  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.378235  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.74 
 
 		 605 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  0.00000852075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>