152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0992 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0992  GTP-binding protein YqeH  100 
 
 		 369 aa  764    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2459  GTP-binding protein YqeH  79.4 
 
 		 370 aa  630  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019503  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4416  GTP-binding protein YqeH  64.05 
 
 		 368 aa  499  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4455  GTP-binding protein YqeH  64.05 
 
 		 368 aa  500  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4233  GTP-binding protein YqeH  64.05 
 
 		 368 aa  499  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4071  GTP-binding protein YqeH  64.05 
 
 		 368 aa  499  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0184971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4081  GTP-binding protein YqeH  64.05 
 
 		 368 aa  499  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4357  GTP-binding protein YqeH  64.05 
 
 		 368 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.701648 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4562  GTP-binding protein YqeH  64.05 
 
 		 368 aa  499  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4468  GTP-binding protein YqeH  64.05 
 
 		 368 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0923529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0782  GTP-binding protein YqeH  64.05 
 
 		 368 aa  499  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0185086  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4186  GTP-binding protein YqeH  62.7 
 
 		 368 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3061  GTP-binding protein YqeH  62.43 
 
 		 368 aa  490  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.844402  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1237  GTP-binding protein YqeH  55.56 
 
 		 375 aa  418  1e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000896118  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1585  GTP-binding protein YqeH  54.18 
 
 		 372 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.595212  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1664  GTP-binding protein YqeH  54.18 
 
 		 372 aa  414  1e-114  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00606929  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1164  GTP-binding protein YqeH  49.86 
 
 		 366 aa  392  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914946  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1740  GTP-binding protein YqeH  51.63 
 
 		 379 aa  375  1e-103  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1654  GTP-binding protein YqeH  50.68 
 
 		 366 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1689  GTP-binding protein YqeH  50.68 
 
 		 366 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0226  GTP-binding protein YqeH  49.35 
 
 		 401 aa  368  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1404  GTP-binding protein YqeH  47.47 
 
 		 369 aa  337  1.9999999999999998e-91  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000143151  hitchhiker  2.51031e-26 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0906  GTP-binding protein YqeH  41.02 
 
 		 385 aa  292  6e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.346468  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2017  ribosome biogenesis GTPase YqeH  37.23 
 
 		 396 aa  257  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0079  GTP-binding protein HSR1-related  34.77 
 
 		 363 aa  220  3e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00226262  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0079  GTP-binding protein, HSR1-related  34.5 
 
 		 363 aa  216  5e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000212587  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40200  predicted protein  35.44 
 
 		 710 aa  211  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00209699  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0841  hypothetical protein  32 
 
 		 365 aa  190  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1822  GTP-binding protein HSR1-related protein  28.73 
 
 		 379 aa  179  7e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0797  GTP-binding protein, HSR1-related  30.16 
 
 		 357 aa  176  8e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1198  GTP-binding protein HSR1-related  29.3 
 
 		 376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0424  hypothetical protein  28.65 
 
 		 367 aa  162  6e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.00290695  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49745  predicted protein  29.51 
 
 		 604 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.814694  normal  0.848329 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0436  GTP-binding protein HSR1-related protein  29.55 
 
 		 391 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl351  GTPase  27.85 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.213e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37471  predicted protein  33.55 
 
 		 401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0357188  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0525  ribosome biogenesis GTPase YqeH  27.12 
 
 		 361 aa  137  4e-31  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.642642  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0716  GTP1/OBG protein  28.9 
 
 		 292 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00781144  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2377  ribosomal biogenesis GTPase  29.22 
 
 		 307 aa  53.1  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0824  GTP-binding protein, HSR1-related  32.17 
 
 		 261 aa  53.1  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34264  predicted protein  25 
 
 		 597 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3528  GTPase EngC  39.77 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1339  GTP-binding protein HSR1-related  27.32 
 
 		 374 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28031  predicted protein  24.84 
 
 		 676 aa  50.8  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3386  GTP-binding protein EngA  34.29 
 
 		 442 aa  50.4  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.6 
 
 		 316 aa  50.1  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0259  GTP-binding protein YlqF  25.89 
 
 		 384 aa  49.7  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02636  ribosomal biogenesis GTPase  25.75 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2892  GTPase family protein  35.97 
 
 		 463 aa  48.5  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1203  GTP-binding protein HSR1-related  30.99 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000139155  normal  0.179888 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5023  tRNA modification GTPase TrmE  35.87 
 
 		 447 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1049  small GTP-binding protein  29.89 
 
 		 256 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0648076 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0483  GTP-binding protein, HSR1-related  33.73 
 
 		 258 aa  48.5  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0579  GTP-binding protein HSR1-related  26.34 
 
 		 388 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2864  tRNA modification GTPase TrmE  42.03 
 
 		 428 aa  48.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4089  ribosomal biogenesis GTPase  24.11 
 
 		 281 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1586  ribosomal biogenesis GTPase  27.63 
 
 		 281 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0128264 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2667  tRNA modification GTPase TrmE  31.73 
 
 		 428 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0398705  normal  0.380735 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1961  ribosomal biogenesis GTPase  29.27 
 
 		 281 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.648804  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1679  ribosomal biogenesis GTPase  29.27 
 
 		 281 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.607688  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0577  GTP-binding protein EngA  27.35 
 
 		 435 aa  47  0.0006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.416412  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2407  tRNA modification GTPase TrmE  33.91 
 
 		 433 aa  47  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0017  GTP-binding protein HSR1-related  32.74 
 
 		 259 aa  47  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  29.93 
 
 		 494 aa  47  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0059  GTP-binding protein HSR1-related  28.85 
 
 		 260 aa  47  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.800533  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0822  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.34 
 
 		 464 aa  46.6  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.460708  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1409  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  29.29 
 
 		 271 aa  46.2  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.421311  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2048  GTP-binding protein, HSR1-related  26.61 
 
 		 284 aa  46.2  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000391161  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10438  conserved hypothetical protein  22.55 
 
 		 634 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.906693 
 
 
-
 
NC_002978  WD1098  GTP-binding protein EngA  28.71 
 
 		 441 aa  45.4  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0731  ribosome small subunit-dependent GTPase A  27.61 
 
 		 367 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.194733  normal  0.466383 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2182  predicted protein  25.67 
 
 		 360 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0351  GTPase EngC  36 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00346768  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4128  ribosomal biogenesis GTPase  24.39 
 
 		 281 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0392  tRNA modification GTPase TrmE  43.48 
 
 		 460 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0663  ribosomal biogenesis GTPase  25.68 
 
 		 279 aa  45.8  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.5554  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1589  ribosomal biogenesis GTPase  27.1 
 
 		 313 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06087  ribosomal biogenesis GTPase  26.95 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1703  ribosomal biogenesis GTPase  25.71 
 
 		 310 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0429  tRNA modification GTPase TrmE  42.03 
 
 		 462 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0580  GTP-binding protein hflX  34.44 
 
 		 427 aa  45.1  0.002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.627309  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  43.94 
 
 		 456 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0591  GTP-binding protein EngA  29.58 
 
 		 472 aa  45.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1194  GTP-binding protein HSR1-related  32.84 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3454  tRNA modification GTPase TrmE  31.19 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2840  small GTP-binding protein  28.96 
 
 		 501 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118235 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1982  ribosomal biogenesis GTPase  25 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2437  ribosomal biogenesis GTPase  27.1 
 
 		 313 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2306  ribosomal biogenesis GTPase  28.3 
 
 		 313 aa  44.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.575224  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2029  ribosomal biogenesis GTPase  25.81 
 
 		 312 aa  44.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.831437  normal  0.492608 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2453  ribosomal biogenesis GTPase  24.68 
 
 		 312 aa  44.3  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.643671  normal  0.265294 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02121  ribosomal biogenesis GTPase  25.84 
 
 		 290 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269316  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1855  ribosomal biogenesis GTPase  27.1 
 
 		 313 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02141  ribosomal biogenesis GTPase  25.84 
 
 		 290 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.909722  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0021  GTP-binding protein, HSR1-related  36.22 
 
 		 261 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  30.66 
 
 		 442 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1882  ribosomal biogenesis GTPase  27.1 
 
 		 313 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140157  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2638  ribosomal biogenesis GTPase  25.81 
 
 		 312 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00454653  normal  0.052608 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1889  ribosomal biogenesis GTPase  27.1 
 
 		 313 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2058  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.75 
 
 		 319 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.834521  normal  0.0277453 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>