More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2115 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  45.09 
 
 		 934 aa  790    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  45.18 
 
 		 934 aa  803    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  45.06 
 
 		 934 aa  803    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  45.18 
 
 		 934 aa  803    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  44.78 
 
 		 934 aa  784    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  43.61 
 
 		 929 aa  791    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  45.18 
 
 		 934 aa  803    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  100 
 
 		 921 aa  1907    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  45.06 
 
 		 934 aa  803    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  44.37 
 
 		 934 aa  779    Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  45.2 
 
 		 934 aa  791    Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  44.37 
 
 		 934 aa  779    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0504  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  60.15 
 
 		 909 aa  1121    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.77 
 
 		 952 aa  485  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  31.72 
 
 		 929 aa  464  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.24 
 
 		 930 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.26 
 
 		 921 aa  443  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.22 
 
 		 960 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.64 
 
 		 921 aa  441  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.33 
 
 		 934 aa  434  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.34 
 
 		 927 aa  434  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.6 
 
 		 957 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0916  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  31.07 
 
 		 954 aa  429  1e-118  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1025  DNA polymerase III, epsilon subunit/ATP-dependent helicase DinG  30.8 
 
 		 902 aa  394  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1030  Rad3-related DNA helicase  30.7 
 
 		 937 aa  355  2e-96  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0174435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  31.02 
 
 		 838 aa  342  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  30.2 
 
 		 876 aa  324  5e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  30.72 
 
 		 851 aa  320  7.999999999999999e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  30.79 
 
 		 840 aa  312  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  30.69 
 
 		 843 aa  311  5e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  31.29 
 
 		 659 aa  309  1.0000000000000001e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0509  helicase c2  31.54 
 
 		 843 aa  306  9.000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  30.59 
 
 		 832 aa  305  3.0000000000000004e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  29.88 
 
 		 822 aa  303  7.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  31.11 
 
 		 729 aa  300  7e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  31.7 
 
 		 646 aa  298  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3854  helicase c2  30.28 
 
 		 830 aa  296  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000920192 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3770  helicase c2  29.72 
 
 		 830 aa  293  7e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  31.67 
 
 		 647 aa  293  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0709  helicase c2  30.9 
 
 		 650 aa  292  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0820  helicase c2  30.76 
 
 		 650 aa  289  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0024  helicase c2  27.37 
 
 		 846 aa  286  9e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  27.82 
 
 		 709 aa  286  2.0000000000000002e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  30.79 
 
 		 674 aa  284  5.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  30.29 
 
 		 659 aa  283  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1543  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  36.36 
 
 		 897 aa  281  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.959984  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1514  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  36.36 
 
 		 897 aa  281  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.103927  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1859  helicase c2  30.29 
 
 		 674 aa  281  4e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  30.06 
 
 		 661 aa  277  7e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  30.43 
 
 		 647 aa  273  1e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  30.4 
 
 		 643 aa  270  8e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  30.24 
 
 		 646 aa  270  8e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1359  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.73 
 
 		 978 aa  270  1e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.838712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2455  helicase c2  30.95 
 
 		 641 aa  268  4e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28440  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  26.82 
 
 		 986 aa  267  5e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32018  normal  0.0233138 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  27.98 
 
 		 707 aa  268  5e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  29.81 
 
 		 651 aa  267  5.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  30.42 
 
 		 639 aa  267  7e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3486  helicase c2  29.46 
 
 		 698 aa  265  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  29.38 
 
 		 667 aa  263  8.999999999999999e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2147  helicase c2  30.78 
 
 		 641 aa  261  4e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0303331  hitchhiker  0.00135971 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.34 
 
 		 956 aa  261  4e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2517  ATP-dependent helicase, DEXD family  30.78 
 
 		 641 aa  261  4e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.764826  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.41 
 
 		 944 aa  258  4e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1957  helicase c2  29.73 
 
 		 699 aa  257  5e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0276528  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3093  helicase c2  30.84 
 
 		 681 aa  257  8e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3855  helicase c2  29.2 
 
 		 665 aa  257  8e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3929  helicase c2  29.2 
 
 		 665 aa  257  8e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0336304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3841  helicase c2  29.2 
 
 		 665 aa  257  9e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478709  normal  0.0359375 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2196  helicase c2  30.1 
 
 		 641 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2524  helicase c2  30.42 
 
 		 755 aa  254  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00188741  decreased coverage  0.000000000263353 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  28.72 
 
 		 662 aa  252  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0995  helicase c2  29.51 
 
 		 681 aa  251  6e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900844  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01597  ATP-dependent helicase  29.81 
 
 		 675 aa  247  6e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2094  helicase c2  29.86 
 
 		 673 aa  244  6e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.239782  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29270  DNA helicase, Rad3  29.74 
 
 		 684 aa  242  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.318454 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6530  putative ATP-dependent helicase  29.21 
 
 		 674 aa  240  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290122  normal  0.0410108 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2347  helicase c2  30.52 
 
 		 670 aa  240  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.490547  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0239  helicase c2  27.82 
 
 		 664 aa  239  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2005  putative ATP-dependent DNA helicase-related protein  27.43 
 
 		 666 aa  232  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.349435 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4334  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.2 
 
 		 714 aa  232  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.044641  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1863  helicase c2  27.84 
 
 		 668 aa  231  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879395 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50840  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.93 
 
 		 714 aa  230  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144938 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4290  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.57 
 
 		 714 aa  230  9e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1125  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.42 
 
 		 714 aa  230  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437588  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0021  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.18 
 
 		 692 aa  230  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1161  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.42 
 
 		 714 aa  230  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1146  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.5 
 
 		 714 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.980909  normal  0.730569 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  28.53 
 
 		 652 aa  228  6e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1225  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.46 
 
 		 714 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2024  Rad3-related DNA helicase  32.18 
 
 		 791 aa  221  3.9999999999999997e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.323186  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1467  helicase c2  28.24 
 
 		 690 aa  221  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0659778  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3856  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.87 
 
 		 714 aa  220  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.160495  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1446  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.24 
 
 		 703 aa  220  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107544  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1513  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.21 
 
 		 690 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433839  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3086  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.71 
 
 		 692 aa  218  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175143  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4486  helicase c2  27.29 
 
 		 714 aa  217  7e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19450  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.27 
 
 		 714 aa  217  7e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1566  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.34 
 
 		 692 aa  217  9e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000620367 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1129  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.91 
 
 		 694 aa  216  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0640459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>