54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1363 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1363  hypothetical protein  100 
 
 
703 aa  1405    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000334966  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2228  hypothetical protein  50.14 
 
 
697 aa  631  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2479  hypothetical protein  32.4 
 
 
193 aa  72.4  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2330  hypothetical protein  31.97 
 
 
189 aa  69.7  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2659  hypothetical protein  35.22 
 
 
199 aa  69.7  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.765719  normal  0.533611 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2446  hypothetical protein  30.52 
 
 
551 aa  68.9  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.78808  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0893  hypothetical protein  32.68 
 
 
189 aa  67  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1504  conserved hypothetical conserved membrane protein  32.73 
 
 
196 aa  67  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2049  hypothetical protein  31.54 
 
 
166 aa  65.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1714  hypothetical protein  29.87 
 
 
163 aa  65.5  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1846  hypothetical protein  34.15 
 
 
166 aa  64.7  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.589694  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1533  hypothetical protein  32.33 
 
 
171 aa  64.3  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.886614  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1702  conserved hypothetical conserved membrane protein  30.82 
 
 
196 aa  64.3  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.653343  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1594  hypothetical protein  31.58 
 
 
171 aa  63.9  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1843  hypothetical protein  30.41 
 
 
171 aa  63.5  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2509  hypothetical protein  26.97 
 
 
163 aa  63.9  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1600  hypothetical protein  32.33 
 
 
171 aa  61.6  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.209415 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1895  hypothetical protein  28.92 
 
 
176 aa  62  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00041409 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1857  hypothetical protein  32.5 
 
 
171 aa  61.2  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1621  hypothetical protein  33.12 
 
 
171 aa  61.6  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1818  hypothetical protein  32.5 
 
 
171 aa  61.2  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2468  hypothetical protein  32.5 
 
 
171 aa  61.2  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.186702  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1810  hypothetical protein  32.5 
 
 
171 aa  60.8  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2993  hypothetical protein  28.92 
 
 
176 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3071  hypothetical protein  28.92 
 
 
176 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333579  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0897  hypothetical protein  32.03 
 
 
189 aa  58.5  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.672038  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1251  hypothetical protein  30.06 
 
 
160 aa  57.4  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1253  hypothetical protein  34.69 
 
 
336 aa  56.6  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  25.16 
 
 
1006 aa  55.8  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3038  hypothetical protein  28.95 
 
 
164 aa  55.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57781  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2230  hypothetical protein  32.46 
 
 
190 aa  55.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  hitchhiker  0.000590839 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1619  hypothetical protein  31.18 
 
 
363 aa  54.7  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2355  hypothetical protein  32.77 
 
 
183 aa  54.3  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000541115  hitchhiker  0.000000775471 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2480  membrane protein  34.78 
 
 
370 aa  53.9  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.404247  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4248  hypothetical protein  26.97 
 
 
552 aa  52.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1296  hypothetical protein  57.14 
 
 
161 aa  51.2  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3195  hypothetical protein  29.79 
 
 
166 aa  51.2  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461646  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2331  hypothetical protein  32.28 
 
 
376 aa  50.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2470  hypothetical protein  27.62 
 
 
395 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.932984  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1816  hypothetical protein  32.56 
 
 
387 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1894  phosphohistidine phosphatase SixA  25.17 
 
 
174 aa  48.9  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1298  membrane protein-like protein  24.56 
 
 
312 aa  48.5  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2660  membrane protein-like protein  28.38 
 
 
431 aa  48.5  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2047  hypothetical protein  30.89 
 
 
323 aa  47.4  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1840  hypothetical protein  29.2 
 
 
357 aa  47.8  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1829  hypothetical protein  30.65 
 
 
219 aa  47  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.186354  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1855  hypothetical protein  26.55 
 
 
389 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.655192  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1531  hypothetical protein  29.36 
 
 
354 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0892  hypothetical protein  32.41 
 
 
334 aa  47  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1592  hypothetical protein  29.36 
 
 
354 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.644089 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1598  hypothetical protein  29.3 
 
 
354 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1808  hypothetical protein  27.61 
 
 
384 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0896  hypothetical protein  31.31 
 
 
378 aa  45.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.555033  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3040  hypothetical protein  34.44 
 
 
342 aa  44.7  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>