271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1251 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  100 
 
 
2082 aa  4040    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  40.85 
 
 
821 aa  495  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  41.15 
 
 
818 aa  466  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  40.06 
 
 
911 aa  434  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  36.22 
 
 
743 aa  397  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  38.36 
 
 
717 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  38.49 
 
 
776 aa  372  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  38.38 
 
 
778 aa  368  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  39.36 
 
 
714 aa  363  3e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  38.68 
 
 
784 aa  360  1.9999999999999998e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  40.41 
 
 
792 aa  355  5.9999999999999994e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.08 
 
 
837 aa  332  4e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  31.28 
 
 
807 aa  303  2e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  41.03 
 
 
1679 aa  275  9e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  44.57 
 
 
1919 aa  257  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  40.88 
 
 
461 aa  247  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  36.24 
 
 
461 aa  245  5e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  31.12 
 
 
1126 aa  230  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  40.46 
 
 
449 aa  220  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  43.48 
 
 
561 aa  215  7e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  29.61 
 
 
1207 aa  209  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  36.34 
 
 
1129 aa  208  8e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  42.35 
 
 
579 aa  207  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  41.29 
 
 
417 aa  205  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  37.94 
 
 
547 aa  203  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  38.5 
 
 
593 aa  203  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0797  hypothetical protein  33.18 
 
 
1140 aa  201  9e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  30.36 
 
 
1222 aa  201  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  42.09 
 
 
477 aa  199  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  27.86 
 
 
1187 aa  199  6e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.95 
 
 
556 aa  197  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  39.26 
 
 
553 aa  196  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  41.88 
 
 
560 aa  195  9e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  38.61 
 
 
546 aa  194  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  36.83 
 
 
469 aa  193  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  40.34 
 
 
569 aa  192  7e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3239  hypothetical protein  32.93 
 
 
931 aa  191  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  35.96 
 
 
1848 aa  190  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  39.25 
 
 
551 aa  188  8e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  40.24 
 
 
554 aa  187  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  36.57 
 
 
835 aa  187  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  41.44 
 
 
555 aa  186  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  39.53 
 
 
558 aa  186  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.34 
 
 
563 aa  186  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  40.16 
 
 
555 aa  185  8.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.99 
 
 
567 aa  184  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  40.48 
 
 
570 aa  183  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.91 
 
 
706 aa  182  9e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  39.64 
 
 
577 aa  177  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  38.4 
 
 
554 aa  173  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  31.77 
 
 
363 aa  172  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  31.77 
 
 
363 aa  172  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  37.82 
 
 
558 aa  169  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  40.85 
 
 
681 aa  169  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  36.51 
 
 
726 aa  169  5.9999999999999996e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  41.71 
 
 
553 aa  169  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  42.42 
 
 
692 aa  166  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  39.37 
 
 
566 aa  164  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  35.26 
 
 
403 aa  160  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  40.45 
 
 
376 aa  157  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  37.84 
 
 
737 aa  154  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  34.11 
 
 
443 aa  151  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  26.2 
 
 
921 aa  140  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1010  immunoglobulin-like  33.59 
 
 
597 aa  136  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  34.91 
 
 
389 aa  134  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  32.66 
 
 
900 aa  133  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  30.37 
 
 
575 aa  130  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0623  hypothetical protein  27.61 
 
 
614 aa  128  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000504443  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  31.03 
 
 
810 aa  127  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  33.94 
 
 
624 aa  126  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.89 
 
 
454 aa  124  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.83 
 
 
787 aa  124  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.41 
 
 
726 aa  124  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  26.37 
 
 
728 aa  122  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  28.79 
 
 
817 aa  118  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  34.05 
 
 
1030 aa  117  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  29.97 
 
 
396 aa  115  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 
745 aa  111  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  32.72 
 
 
638 aa  111  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  30.4 
 
 
328 aa  111  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.66 
 
 
941 aa  110  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  32.01 
 
 
418 aa  110  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  32.59 
 
 
618 aa  109  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  30.84 
 
 
602 aa  108  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  30.61 
 
 
2816 aa  108  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.9 
 
 
1147 aa  107  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  32.78 
 
 
450 aa  106  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  31.01 
 
 
643 aa  103  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  28.99 
 
 
341 aa  102  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30.05 
 
 
535 aa  102  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  30.85 
 
 
558 aa  101  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0670  hypothetical protein  34.83 
 
 
1024 aa  101  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.680595  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4127  predicted protein  28.12 
 
 
390 aa  99.8  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.048963  normal  0.0914218 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48985  predicted protein  26.62 
 
 
547 aa  99.4  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  34.6 
 
 
332 aa  99  9e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  26.32 
 
 
643 aa  98.6  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  30.48 
 
 
447 aa  98.2  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0968  hypothetical protein  34.67 
 
 
456 aa  95.9  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  31.06 
 
 
544 aa  95.9  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45751  predicted protein  31.63 
 
 
386 aa  92.4  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0607057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>