16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45751 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_45751  predicted protein  100 
 
 
386 aa  782    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0607057  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45750  predicted protein  67.92 
 
 
262 aa  343  4e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0489312  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  47.85 
 
 
1567 aa  217  2.9999999999999998e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40470  predicted protein  49.06 
 
 
256 aa  198  1.0000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47779  predicted protein  42.09 
 
 
622 aa  183  4.0000000000000006e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_40038  predicted protein  42.92 
 
 
214 aa  144  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0610628  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39243  predicted protein  47.19 
 
 
168 aa  136  8e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33498  predicted protein  46.96 
 
 
187 aa  130  5.0000000000000004e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38076  predicted protein  45.71 
 
 
446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3239  hypothetical protein  27.92 
 
 
931 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0797  hypothetical protein  30.03 
 
 
1140 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  29.9 
 
 
1030 aa  112  8.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  31.63 
 
 
2082 aa  92.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0623  hypothetical protein  25.82 
 
 
614 aa  63.2  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000504443  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  29.37 
 
 
3320 aa  61.6  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44846  predicted protein  48.33 
 
 
450 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>