More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0084 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0084  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  794    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.928121  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3433  hypothetical protein  83.38 
 
 		 391 aa  666    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3621  hypothetical protein  74.36 
 
 		 389 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0085  hypothetical protein  69.15 
 
 		 389 aa  548  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0068  hypothetical protein  68.89 
 
 		 389 aa  543  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.19832e-26 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0455  hypothetical protein  62.82 
 
 		 387 aa  496  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1884  hypothetical protein  39.9 
 
 		 395 aa  278  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.228041  normal  0.262576 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2134  hypothetical protein  41.22 
 
 		 391 aa  275  8e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1048  hypothetical protein  40.57 
 
 		 392 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4642  hypothetical protein  38.06 
 
 		 387 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6440  hypothetical protein  38.83 
 
 		 387 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0145661 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1016  hypothetical protein  38.96 
 
 		 392 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2474  hypothetical protein  37.33 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.651343  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2341  hypothetical protein  38.7 
 
 		 392 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0772  hypothetical protein  35.54 
 
 		 389 aa  239  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1145  hypothetical protein  37.17 
 
 		 391 aa  237  3e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0013509  normal  0.0789492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3457  hypothetical protein  38.26 
 
 		 390 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171276  hitchhiker  0.0000085327 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2412  hypothetical protein  35.54 
 
 		 392 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1794  hypothetical protein  37.94 
 
 		 393 aa  213  5.999999999999999e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000759831  normal  0.944472 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01830  arylformamidase, putative  32.33 
 
 		 451 aa  196  6e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1564  aminotransferase class I and II  35.14 
 
 		 400 aa  184  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2542  aminotransferase, class I and II  33.82 
 
 		 399 aa  184  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0513  aminotransferase  34.29 
 
 		 392 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3898  aminotransferase, class I and II  33.43 
 
 		 409 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.157846 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  32.58 
 
 		 367 aa  169  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0292  aspartate aminotransferase  32.05 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  28.19 
 
 		 394 aa  158  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  28.21 
 
 		 388 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1664  aminotransferase, class I and II  32.46 
 
 		 403 aa  157  4e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  29.69 
 
 		 398 aa  156  6e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1225  aspartate aminotransferase  26.48 
 
 		 391 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1196  aspartate aminotransferase  26.84 
 
 		 388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10418  predicted protein  30.54 
 
 		 375 aa  152  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00425999  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1578  aspartate aminotransferase  27.91 
 
 		 387 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.776902  hitchhiker  0.00064422 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  26.33 
 
 		 402 aa  150  4e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17330  aspartate aminotransferase  30.73 
 
 		 402 aa  149  6e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0535  aminotransferase class I and II  33.15 
 
 		 401 aa  149  8e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169316  normal  0.0112885 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2661  aspartate aminotransferase  30.09 
 
 		 402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.975518  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  27.68 
 
 		 398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2709  aspartate aminotransferase  29.38 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0229127 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  32.06 
 
 		 393 aa  147  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  29.78 
 
 		 396 aa  146  5e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1200  aminotransferase, class I and II  30.11 
 
 		 371 aa  146  6e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162477  normal  0.0266801 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3695  aspartate aminotransferase  26.63 
 
 		 391 aa  145  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  28.13 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6643  aspartate aminotransferase  31.35 
 
 		 413 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3209  aspartate aminotransferase  32.22 
 
 		 410 aa  145  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.053672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10411  aspartate aminotransferase  28.89 
 
 		 401 aa  142  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  29.54 
 
 		 406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2679  aminotransferase class I and II  28.19 
 
 		 411 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  28.57 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4527  aminotransferase class I and II  27.17 
 
 		 415 aa  141  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  30.46 
 
 		 414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  31.61 
 
 		 393 aa  140  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2997  aspartate aminotransferase  28.57 
 
 		 409 aa  139  7.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2619  aminotransferase class I and II  31.69 
 
 		 366 aa  139  8.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  33.54 
 
 		 393 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  27.99 
 
 		 405 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  30.21 
 
 		 381 aa  137  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21060  aspartate aminotransferase  28.26 
 
 		 410 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  28.85 
 
 		 370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3474  aminotransferase class I and II  30.66 
 
 		 393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.151006 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0436  aspartate aminotransferase  26.25 
 
 		 381 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0426  aminotransferase class I and II  26.94 
 
 		 374 aa  137  4e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  28.61 
 
 		 387 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1431  aminotransferase class I and II  28.65 
 
 		 391 aa  136  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000143032 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  26.65 
 
 		 417 aa  136  8e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1620  aspartate aminotransferase  30.77 
 
 		 401 aa  135  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.83573  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  30.58 
 
 		 386 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0401  aminotransferase class I and II  31.15 
 
 		 395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0552062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0673  aspartate aminotransferase  29.11 
 
 		 415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  29.85 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1295  aminotransferase class I and II  32.17 
 
 		 398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.768016 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  30.3 
 
 		 388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2408  aminotransferase class I and II  29.31 
 
 		 383 aa  134  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.987173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1011  aspartate aminotransferase  29.46 
 
 		 412 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  28.98 
 
 		 412 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  27.96 
 
 		 390 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  30.89 
 
 		 379 aa  133  3.9999999999999996e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  31.39 
 
 		 402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0911  aminotransferase, class I and II  25.33 
 
 		 367 aa  133  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  27.33 
 
 		 396 aa  133  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  26.87 
 
 		 395 aa  133  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0907  aspartate aminotransferase  28.26 
 
 		 415 aa  133  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.149386 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0300  aspartate aminotransferase  32.18 
 
 		 427 aa  133  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0401102 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03600  aspartate aminotransferase  28.89 
 
 		 411 aa  133  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  28.44 
 
 		 387 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  26.74 
 
 		 390 aa  132  9e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1370  aminotransferase class I and II  27.81 
 
 		 378 aa  132  9e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  29.37 
 
 		 379 aa  132  9e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1066  aminotransferase, class I and II  28.53 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.824593 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1220  putative aspartate transaminase  29 
 
 		 412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000208657 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  26.74 
 
 		 383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3133  aminotransferase  28.19 
 
 		 370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.367697  normal  0.475875 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0135  aminotransferase class I and II  31.03 
 
 		 407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.062979  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1677  aminotransferase class I and II  30.94 
 
 		 392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206654  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0770  aminotransferase, class I and II  27.51 
 
 		 397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0102863 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  25.91 
 
 		 375 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  28.96 
 
 		 398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  29.57 
 
 		 398 aa  130  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>