More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0048 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  85.1 
 
 
1094 aa  1823  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
1142 aa  2274  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  33.49 
 
 
1160 aa  309  2e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.74 
 
 
1080 aa  308  5e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  33.24 
 
 
1081 aa  294  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.94 
 
 
1089 aa  291  6e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  29.62 
 
 
1093 aa  266  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  28.91 
 
 
1134 aa  265  5e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.24 
 
 
1055 aa  261  8e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  31.2 
 
 
1198 aa  245  4e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  29.8 
 
 
1050 aa  244  5e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.8 
 
 
1050 aa  244  5e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.37 
 
 
1053 aa  241  5e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.85 
 
 
1226 aa  234  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  27.87 
 
 
1148 aa  234  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.61 
 
 
1141 aa  232  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.01 
 
 
1291 aa  231  6e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.7 
 
 
1149 aa  231  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2301  adenylate/guanylate cyclase  67.98 
 
 
199 aa  227  8e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  9.15403e-05  normal  0.0162961 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  28.66 
 
 
1138 aa  227  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.97 
 
 
1014 aa  227  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  28.65 
 
 
1139 aa  223  1e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  28.18 
 
 
1151 aa  221  7e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.29 
 
 
1151 aa  221  9e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  29.34 
 
 
1204 aa  219  3e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  27.93 
 
 
1048 aa  219  3e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4346  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.01 
 
 
1190 aa  218  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  28.53 
 
 
1227 aa  218  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  27.74 
 
 
1122 aa  209  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0329  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.65 
 
 
1285 aa  207  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.902018  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  25.68 
 
 
1105 aa  204  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  28.91 
 
 
1046 aa  199  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.37 
 
 
1403 aa  197  8e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  28.49 
 
 
1063 aa  193  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.88 
 
 
1175 aa  192  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4787  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  32.02 
 
 
1190 aa  188  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000313261 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.89 
 
 
1096 aa  187  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.5 
 
 
1441 aa  186  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  24.77 
 
 
1123 aa  170  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.23 
 
 
1360 aa  170  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.19 
 
 
1429 aa  169  3e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  27.95 
 
 
1065 aa  168  6e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  25.9 
 
 
1055 aa  167  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.26 
 
 
1422 aa  167  1e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  21.41 
 
 
1153 aa  162  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  29.27 
 
 
919 aa  162  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  27.78 
 
 
1043 aa  161  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  28.46 
 
 
1377 aa  159  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.25277e-08 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  25.08 
 
 
1403 aa  158  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  24.36 
 
 
1037 aa  157  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  27.72 
 
 
1271 aa  156  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  25.37 
 
 
1402 aa  154  8e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.06 
 
 
1087 aa  154  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  28.88 
 
 
968 aa  149  2e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  4.59834e-05 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  26.86 
 
 
1398 aa  145  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  28.48 
 
 
1358 aa  142  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2514  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.63 
 
 
805 aa  138  7e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255798  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  30.05 
 
 
833 aa  137  1e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.63 
 
 
1117 aa  136  2e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4842  SARP family transcriptional regulator  28.45 
 
 
979 aa  136  2e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.06 
 
 
852 aa  134  7e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1236  adenylate/guanylate cyclase  34.73 
 
 
320 aa  133  2e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.818625  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1253  putative adenylate/guanylate cyclase  34.73 
 
 
320 aa  133  2e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344364  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.74 
 
 
1295 aa  129  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  25.96 
 
 
1027 aa  128  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  34.43 
 
 
738 aa  124  9e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  25.74 
 
 
1027 aa  124  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  25.74 
 
 
1027 aa  124  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1682  putative adenylate/guanylate cyclase  26.69 
 
 
1071 aa  120  1e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114173 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1991  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.72 
 
 
1023 aa  119  2e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  36.02 
 
 
513 aa  117  1e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  32.75 
 
 
518 aa  115  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  35.42 
 
 
665 aa  115  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  25.8 
 
 
1264 aa  115  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  3.02868e-06 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  35.29 
 
 
864 aa  114  1e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  32.99 
 
 
861 aa  113  2e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1214  adenylate/guanylate cyclase  25.41 
 
 
1130 aa  111  7e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.54 
 
 
656 aa  111  9e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3132  serine/threonine protein kinase  26.04 
 
 
1349 aa  110  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28005  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.39 
 
 
611 aa  110  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  31.94 
 
 
860 aa  110  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  32.99 
 
 
971 aa  109  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  35.11 
 
 
858 aa  108  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.33 
 
 
657 aa  108  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4989  serine/threonine protein kinase  25.98 
 
 
1348 aa  108  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  33.16 
 
 
523 aa  106  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3160  serine/threonine protein kinase  24.61 
 
 
956 aa  107  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  31.72 
 
 
479 aa  106  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0102  serine/threonine protein kinase  25 
 
 
1289 aa  106  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  26.43 
 
 
1015 aa  106  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2749  serine/threonine protein kinase  24.94 
 
 
1320 aa  106  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.750661  normal  0.0664583 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2267  putative adenylate/guanylate cyclase  28.04 
 
 
703 aa  105  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  32.07 
 
 
546 aa  105  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4057  serine/threonine protein kinase  25.93 
 
 
1321 aa  105  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.362289 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  34.39 
 
 
794 aa  105  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0329  ATPase-like protein  25 
 
 
1169 aa  105  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.257596 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  32.98 
 
 
859 aa  104  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.16 
 
 
678 aa  104  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  35.29 
 
 
483 aa  103  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  34.84 
 
 
483 aa  103  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>