More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0408 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  320  7e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1296  hypothetical protein  42.67 
 
 		 161 aa  134  4e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0433075  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1159  hypothetical protein  42.67 
 
 		 161 aa  134  5e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147113  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1492  hypothetical protein  39.44 
 
 		 158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  39.71 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  39.06 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  36.43 
 
 		 159 aa  101  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  37.76 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  39.1 
 
 		 153 aa  97.4  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  40.41 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  36.73 
 
 		 161 aa  96.7  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  39.04 
 
 		 161 aa  95.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  38.35 
 
 		 153 aa  95.5  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  35.34 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0182  protein of unknown function UPF0079  36.36 
 
 		 148 aa  91.7  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0313363  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  37.93 
 
 		 150 aa  90.9  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1228  hypothetical protein  35.77 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  35.33 
 
 		 160 aa  90.1  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  39.23 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1190  ATP/GTP hydrolase  34.25 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1524  hypothetical protein  38.06 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.535681  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  38.93 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  38.93 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  32.56 
 
 		 187 aa  88.6  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  38.93 
 
 		 159 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  36.3 
 
 		 171 aa  88.2  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  41.59 
 
 		 160 aa  88.2  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  37.82 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  33.58 
 
 		 170 aa  88.2  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  36.96 
 
 		 153 aa  87.8  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  37.98 
 
 		 173 aa  87.4  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0357  hypothetical protein  37.4 
 
 		 179 aa  87.4  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.479824  normal  0.0878506 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04610  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  31.82 
 
 		 157 aa  87  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.343919 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  35.61 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  37.16 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  34.78 
 
 		 152 aa  86.3  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  33.33 
 
 		 176 aa  85.9  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  32 
 
 		 164 aa  86.3  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  33.11 
 
 		 157 aa  85.1  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  32.17 
 
 		 157 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  35.42 
 
 		 164 aa  84.7  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  38.02 
 
 		 184 aa  84.3  6e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3072  protein of unknown function UPF0079  35.48 
 
 		 160 aa  84.3  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351219  normal  0.508247 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0008  P-loop hydrolase family protein  43.08 
 
 		 155 aa  84  7e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  unclonable  0.00000890288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  31.47 
 
 		 157 aa  84  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2452  protein of unknown function UPF0079  32.74 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  36.67 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  39.05 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  31.91 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  31.47 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  29.66 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  36.52 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2364  protein of unknown function UPF0079  32.74 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118731  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1503  hypothetical protein  32.74 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170985  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  30.77 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  30.77 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  30.77 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  30.77 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  30.77 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  30.77 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  30.77 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  35.88 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  35.61 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  36.07 
 
 		 181 aa  80.1  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  32.62 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  35.25 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2169  hypothetical protein  34.59 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.884354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  32.41 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0090  protein of unknown function UPF0079  30.83 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6124  protein of unknown function UPF0079  35.07 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0053  hypothetical protein  35.88 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  33.33 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0033  protein of unknown function UPF0079  37.3 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  36.84 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07470  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  38.05 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.565446  normal  0.131404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2896  protein of unknown function UPF0079  35.9 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.166162  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  31.34 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  32.85 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2330  hypothetical protein  31.58 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0774  hypothetical protein  34.07 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000567369  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1298  protein of unknown function UPF0079  30.88 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1486  hypothetical protein  32.17 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48549  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1192  protein of unknown function UPF0079  31.78 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  31.88 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0487  hypothetical protein  33.61 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2842  hypothetical protein  36 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.523389 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0374  protein of unknown function UPF0079  37.93 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0095  hypothetical protein  32.09 
 
 		 146 aa  77  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1143  protein of unknown function UPF0079  38.1 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216548  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  30.07 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  33.57 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2605  hypothetical protein  32.62 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  32.84 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  31.65 
 
 		 503 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1719  hypothetical protein  40.91 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.266415  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29240  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  35.71 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18361  ATPase or kinase  40.74 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.130336  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0186  hypothetical protein  40.38 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>