More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0560 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0560  histidine kinase  100 
 
 		 670 aa  1331    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.618015  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2136  histidine kinase  35.05 
 
 		 638 aa  365  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1697  histidine kinase  31.25 
 
 		 664 aa  310  4e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182651 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4277  histidine kinase  31.22 
 
 		 659 aa  281  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.186124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2388  histidine kinase  33.02 
 
 		 653 aa  213  7e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255891  normal  0.393123 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2961  ATP-binding region ATPase domain protein  38.53 
 
 		 645 aa  206  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.10084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4503  histidine kinase  34.52 
 
 		 643 aa  193  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2111  ATP-binding region ATPase domain protein  36.14 
 
 		 645 aa  189  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.184163  normal  0.230765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1733  histidine kinase  35.99 
 
 		 687 aa  156  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.568791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4552  histidine kinase  34.48 
 
 		 738 aa  153  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00113459  normal  0.0314449 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12538  two-component sensor histidine kinase  33.42 
 
 		 606 aa  153  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0257303  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1988  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 		 730 aa  144  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.465421  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2102  histidine kinase  29.73 
 
 		 616 aa  142  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.603531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6528  histidine kinase  32.49 
 
 		 592 aa  137  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5844  histidine kinase  29.07 
 
 		 270 aa  134  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2056  histidine kinase  36.4 
 
 		 475 aa  134  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  36.06 
 
 		 1739 aa  126  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  35.81 
 
 		 525 aa  125  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6439  histidine kinase  33.17 
 
 		 657 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0415  histidine kinase  28.06 
 
 		 600 aa  122  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  29.63 
 
 		 391 aa  121  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  32.39 
 
 		 585 aa  120  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0699  histidine kinase  29.39 
 
 		 526 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00253859  normal  0.376247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1808  histidine kinase  36.36 
 
 		 461 aa  116  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5543  histidine kinase  31.97 
 
 		 637 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.88701  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  37.06 
 
 		 451 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  34.17 
 
 		 451 aa  115  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4665  histidine kinase  31.47 
 
 		 306 aa  115  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3230  sensory box histidine kinase  32.34 
 
 		 518 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 1229 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5408  histidine kinase  33.2 
 
 		 494 aa  113  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0406252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2908  histidine kinase  34.01 
 
 		 246 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108136  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  33.8 
 
 		 1101 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 535 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0106  membrane-associated sensory histidine kinase-like ATPase  31.73 
 
 		 632 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100844  normal  0.392929 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 408 aa  111  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00145033  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  34.27 
 
 		 1226 aa  110  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3044  Sensor DegS domain protein  31.71 
 
 		 381 aa  109  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367044  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6490  ATP-binding region ATPase domain protein  32.24 
 
 		 636 aa  109  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  34.95 
 
 		 1024 aa  109  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0939  histidine kinase  29.91 
 
 		 363 aa  108  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08896  putative transmembrane protein  28.57 
 
 		 680 aa  108  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2464  ATPase domain-containing protein  31.39 
 
 		 344 aa  107  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2416  histidine kinase  31.39 
 
 		 344 aa  107  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0476  histidine kinase  33.98 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01475  histidine kinase sensor protein  27.36 
 
 		 668 aa  105  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.399099  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5475  histidine kinase  37.09 
 
 		 267 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 		 468 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  32.51 
 
 		 456 aa  105  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 386 aa  105  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1345  histidine kinase  30.29 
 
 		 338 aa  105  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000383255 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1701  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 		 521 aa  105  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279897 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 661 aa  105  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3079  histidine kinase  34.5 
 
 		 223 aa  104  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  30.63 
 
 		 481 aa  103  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1385  sensor histidine kinase  35.82 
 
 		 377 aa  103  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00939681  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 		 603 aa  103  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1982  sensor histidine kinase, putative  31.68 
 
 		 344 aa  103  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  32.64 
 
 		 388 aa  103  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  29.55 
 
 		 772 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2311  putative two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.71 
 
 		 383 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.615957  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  32.57 
 
 		 466 aa  102  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3668  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 650 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2480  histidine kinase  32.99 
 
 		 350 aa  102  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.90361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2962  histidine kinase  27.72 
 
 		 287 aa  102  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 486 aa  102  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 775 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 339 aa  101  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  29.47 
 
 		 466 aa  100  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  29.47 
 
 		 466 aa  100  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 412 aa  100  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  29.47 
 
 		 466 aa  100  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 770 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 		 748 aa  99.8  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1405  sensor histidine kinase  31.91 
 
 		 483 aa  99.8  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 485 aa  99.8  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3748  histidine kinase  32.23 
 
 		 287 aa  99.4  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2833  histidine kinase  34.65 
 
 		 447 aa  99  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.665069  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1401  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 384 aa  99  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 490 aa  99.8  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0623  sensor protein UhpB  32.87 
 
 		 527 aa  99.4  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3863  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 		 446 aa  99.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.165954  normal  0.826823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 447 aa  99  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 471 aa  99  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  28.44 
 
 		 458 aa  99.4  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1580  histidine kinase  29.28 
 
 		 349 aa  99.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 480 aa  98.6  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  29.95 
 
 		 460 aa  99  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 480 aa  99  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 480 aa  99  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  30.18 
 
 		 422 aa  99  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  28.99 
 
 		 466 aa  98.2  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0384  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 348 aa  98.2  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3211  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 394 aa  98.2  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  28.99 
 
 		 466 aa  98.2  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  28.99 
 
 		 466 aa  98.2  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  28.99 
 
 		 466 aa  98.2  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 461 aa  98.2  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1204  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 779 aa  97.8  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>