More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0290 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
285 aa  580  1e-164  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  35.65 
 
 
318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  34.51 
 
 
339 aa  163  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  34.78 
 
 
315 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  34.82 
 
 
322 aa  159  6e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  29.53 
 
 
314 aa  156  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  33.63 
 
 
334 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  38.39 
 
 
322 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  33.63 
 
 
336 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  32.98 
 
 
341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  35.4 
 
 
339 aa  153  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  32.74 
 
 
327 aa  152  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  31.91 
 
 
328 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1157  beta-lactamase domain protein  31.77 
 
 
279 aa  150  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062155 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  34.5 
 
 
301 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  34.06 
 
 
301 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  37.67 
 
 
332 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  35.4 
 
 
324 aa  149  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  34.1 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  34.38 
 
 
314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  36.77 
 
 
330 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  33.78 
 
 
283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  30.74 
 
 
281 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  31.82 
 
 
312 aa  145  9e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  31.84 
 
 
279 aa  145  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  37.73 
 
 
311 aa  144  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  32.33 
 
 
351 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  36.56 
 
 
326 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  34.36 
 
 
310 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  37.44 
 
 
279 aa  143  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  30.3 
 
 
281 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  30.3 
 
 
281 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  32.35 
 
 
293 aa  142  8e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  33.2 
 
 
292 aa  142  9e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  37.33 
 
 
329 aa  142  9e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  30.29 
 
 
335 aa  142  9e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  33.64 
 
 
287 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  32.13 
 
 
327 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  32.67 
 
 
327 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  33.48 
 
 
310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  30.31 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  33.48 
 
 
310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  33.79 
 
 
238 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  34.5 
 
 
327 aa  139  7e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  34.36 
 
 
320 aa  139  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  33.48 
 
 
311 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  33.64 
 
 
287 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  26.95 
 
 
327 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  33.92 
 
 
310 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  32.16 
 
 
310 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  35.27 
 
 
293 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  31.87 
 
 
293 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  29.09 
 
 
321 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  34.08 
 
 
329 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  32.88 
 
 
279 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  32.76 
 
 
344 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  35.43 
 
 
348 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  35.43 
 
 
348 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  32.16 
 
 
310 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  32.16 
 
 
310 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  29.65 
 
 
342 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  33.48 
 
 
313 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  30.84 
 
 
306 aa  132  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  32.37 
 
 
321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 
330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  31.5 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  32.11 
 
 
322 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  27.92 
 
 
336 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  31.67 
 
 
327 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  31.44 
 
 
315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  29.52 
 
 
329 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  30.36 
 
 
332 aa  129  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  32.88 
 
 
320 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 
324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.53 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  31.9 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  27.92 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  29.26 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  32.44 
 
 
331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  28.83 
 
 
333 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  29.04 
 
 
330 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0028  Beta-lactamase-like  31.51 
 
 
279 aa  125  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.739364  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  34.11 
 
 
304 aa  126  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  33.48 
 
 
303 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  30.7 
 
 
311 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1412  beta-lactamase domain protein  29.78 
 
 
278 aa  124  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270255  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  32.46 
 
 
277 aa  122  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  31.05 
 
 
312 aa  122  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  29.67 
 
 
326 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  35.65 
 
 
315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  29.82 
 
 
306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  30.7 
 
 
302 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1682  beta-lactamase domain protein  32.88 
 
 
291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.779181  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  28.63 
 
 
319 aa  119  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  30.18 
 
 
326 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1402  glyoxalase II  37.2 
 
 
277 aa  119  7e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.701553  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  30.94 
 
 
291 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  30.18 
 
 
308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  29.12 
 
 
330 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  30.18 
 
 
308 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>