More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1290 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  100 
 
 
603 aa  1243    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  54.33 
 
 
616 aa  631  1e-180  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  35.2 
 
 
574 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  36.48 
 
 
542 aa  293  7e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  34.51 
 
 
569 aa  277  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  33.63 
 
 
620 aa  273  9e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  31.21 
 
 
606 aa  262  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  32.37 
 
 
583 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  32.37 
 
 
583 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  32.75 
 
 
543 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  33.21 
 
 
542 aa  253  7e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  33.04 
 
 
535 aa  247  4e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  31.08 
 
 
553 aa  240  5e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  29.29 
 
 
541 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  31.34 
 
 
537 aa  237  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  33.51 
 
 
589 aa  234  4.0000000000000004e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  30.05 
 
 
560 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  31.95 
 
 
569 aa  231  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  29.87 
 
 
608 aa  229  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  30.54 
 
 
560 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  33.09 
 
 
545 aa  227  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  30.7 
 
 
544 aa  227  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  29.66 
 
 
556 aa  226  8e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  29.71 
 
 
539 aa  226  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  34.22 
 
 
538 aa  224  4.9999999999999996e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  30.91 
 
 
582 aa  223  7e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  29.34 
 
 
613 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  31.25 
 
 
553 aa  221  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  32.11 
 
 
564 aa  221  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  30.81 
 
 
576 aa  219  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  33.51 
 
 
548 aa  219  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  33.51 
 
 
548 aa  219  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  33.51 
 
 
548 aa  219  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  32.02 
 
 
564 aa  217  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  30.1 
 
 
580 aa  216  8e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  30.11 
 
 
527 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  32.52 
 
 
576 aa  214  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  32.8 
 
 
563 aa  214  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  31.24 
 
 
547 aa  214  4.9999999999999996e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0751  amidohydrolase 3  31.33 
 
 
575 aa  213  7.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.696305 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  30.63 
 
 
573 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0990  urease domain-containing protein  31.09 
 
 
563 aa  212  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  30.91 
 
 
564 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  31.1 
 
 
579 aa  211  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3987  amidohydrolase 3  30.8 
 
 
563 aa  210  5e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3862  amidohydrolase 3  30.8 
 
 
563 aa  210  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  29.75 
 
 
552 aa  208  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  29.91 
 
 
527 aa  208  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  31.43 
 
 
560 aa  208  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  29.7 
 
 
560 aa  206  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  30.04 
 
 
574 aa  204  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  30.31 
 
 
522 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  29.13 
 
 
520 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  30.97 
 
 
601 aa  200  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  28.5 
 
 
564 aa  199  9e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  29.91 
 
 
550 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  29.98 
 
 
536 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  31.43 
 
 
532 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  29.98 
 
 
536 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  29.98 
 
 
536 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  29.8 
 
 
543 aa  198  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  30.37 
 
 
546 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  29.52 
 
 
543 aa  197  5.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3129  amidohydrolase 3  29.48 
 
 
568 aa  195  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  29.26 
 
 
550 aa  196  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  27.94 
 
 
557 aa  194  5e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  32.65 
 
 
569 aa  194  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  29.87 
 
 
584 aa  193  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.05 
 
 
544 aa  193  9e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  30.38 
 
 
538 aa  192  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  30.09 
 
 
549 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  28.19 
 
 
619 aa  192  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  27.94 
 
 
555 aa  191  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  28.75 
 
 
557 aa  189  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  29.46 
 
 
565 aa  188  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  29.53 
 
 
581 aa  187  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  28.86 
 
 
537 aa  187  5e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  29.21 
 
 
537 aa  187  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  28.33 
 
 
583 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  30.33 
 
 
544 aa  186  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06920  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  28.7 
 
 
542 aa  185  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.256585 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  28.66 
 
 
550 aa  184  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  29.32 
 
 
580 aa  183  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  27.32 
 
 
596 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  29.39 
 
 
522 aa  183  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  29.47 
 
 
522 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  29.96 
 
 
539 aa  182  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  26.74 
 
 
556 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  27.81 
 
 
558 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  29.38 
 
 
556 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  29.57 
 
 
583 aa  181  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  29.28 
 
 
522 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  28.84 
 
 
522 aa  179  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  29.02 
 
 
522 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  29.09 
 
 
522 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  29.32 
 
 
573 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  28.84 
 
 
522 aa  178  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10795  conserved hypothetical protein  28.83 
 
 
549 aa  177  7e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  29.34 
 
 
522 aa  176  9e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.34 
 
 
565 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>