More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0346 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  100 
 
 		 144 aa  298  2e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  83.8 
 
 		 148 aa  256  1e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  81.12 
 
 		 145 aa  245  1e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1250  ribosomal protein L13  71.83 
 
 		 146 aa  213  5.9999999999999996e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  65.49 
 
 		 142 aa  202  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  65.49 
 
 		 142 aa  202  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  65.49 
 
 		 142 aa  202  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  65.49 
 
 		 142 aa  201  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 		 142 aa  202  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  64.79 
 
 		 142 aa  201  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  65.49 
 
 		 142 aa  201  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  64.79 
 
 		 142 aa  201  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  64.79 
 
 		 142 aa  201  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  64.79 
 
 		 142 aa  201  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 		 142 aa  200  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  65.49 
 
 		 142 aa  200  6e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 154 aa  197  3e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0561  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 		 144 aa  194  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000199102  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3157  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 		 142 aa  193  5.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386051 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 142 aa  193  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 142 aa  194  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 142 aa  193  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  193  7e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 146 aa  192  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  60.58 
 
 		 147 aa  191  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  62.04 
 
 		 147 aa  191  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4053  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 		 142 aa  190  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536973 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  59.85 
 
 		 149 aa  190  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0410  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  189  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000575017  normal  0.0346472 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5914  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 		 142 aa  189  8e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4113  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  64.23 
 
 		 147 aa  189  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0604  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0625  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  59.85 
 
 		 149 aa  189  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 149 aa  188  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 145 aa  188  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2012  50S ribosomal protein L13  58.74 
 
 		 149 aa  187  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00853801  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4443  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  60.58 
 
 		 147 aa  187  4e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 144 aa  187  5e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 144 aa  187  5e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 150 aa  187  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  64.23 
 
 		 147 aa  186  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  64.23 
 
 		 147 aa  186  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6565  50S ribosomal protein L13  58.74 
 
 		 147 aa  186  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.870556  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4943  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 		 144 aa  186  7e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  186  7e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 150 aa  186  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  186  7e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  186  8e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2638  50S ribosomal protein L13  61.81 
 
 		 147 aa  186  8e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107212  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  186  8e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0500  50S ribosomal protein L13  61.11 
 
 		 147 aa  186  8e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  59.86 
 
 		 142 aa  186  9e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  186  9e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1232  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229053  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0468  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000130449  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 149 aa  186  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  185  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  58.7 
 
 		 146 aa  185  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4678  50S ribosomal protein L13  62.41 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.44664  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 149 aa  185  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 151 aa  185  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 170 aa  185  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 147 aa  185  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1590  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000486571  normal  0.621291 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  58.33 
 
 		 144 aa  184  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1886  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000953173  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  59.71 
 
 		 151 aa  184  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3452  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  184  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0225792 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  59.71 
 
 		 151 aa  184  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  61.31 
 
 		 148 aa  184  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3354  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  183  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000156516  hitchhiker  0.0000450928 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0801  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 151 aa  184  5e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0607  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  183  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000615689  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  184  5e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  183  5e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  62.96 
 
 		 143 aa  183  6e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1176  ribosomal protein L13  59.42 
 
 		 147 aa  183  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.874786 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 144 aa  183  8e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000419018  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>