More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0037 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  99.78 
 
 
451 aa  892  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  84.38 
 
 
396 aa  644  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  100 
 
 
451 aa  893  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  100 
 
 
451 aa  893  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  99.75 
 
 
394 aa  772  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84574 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
412 aa  812  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  99.78 
 
 
451 aa  892  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  100 
 
 
451 aa  893  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  45.96 
 
 
395 aa  322  1e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  47.32 
 
 
403 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  47.32 
 
 
403 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2353  major facilitator transporter  45.2 
 
 
413 aa  304  2e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  47.15 
 
 
403 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  45.38 
 
 
399 aa  300  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2563  major facilitator transporter  46.72 
 
 
403 aa  299  6e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3560  major facilitator transporter  46.15 
 
 
400 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3960  major facilitator transporter  45.87 
 
 
400 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  47.5 
 
 
379 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  47.18 
 
 
408 aa  292  9e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4451  major facilitator transporter  44.07 
 
 
402 aa  289  6e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  45.24 
 
 
401 aa  284  2e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3800  major facilitator transporter  42.38 
 
 
420 aa  280  5e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131241 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  41.21 
 
 
400 aa  279  6e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1160  major facilitator superfamily MFS_1  40.27 
 
 
403 aa  270  6e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  5.54807e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  39.06 
 
 
404 aa  266  8e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  40.91 
 
 
401 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1579  major facilitator family transporter  42.44 
 
 
402 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  39.25 
 
 
398 aa  264  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  39.14 
 
 
402 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2319  major facilitator superfamily MFS_1  38.8 
 
 
396 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0805208  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0632  major facilitator transporter  38.55 
 
 
410 aa  256  8e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0719  major facilitator superfamily MFS_1  38.67 
 
 
400 aa  254  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  38.87 
 
 
410 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  40.56 
 
 
402 aa  253  4e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0328  purine ribonucleoside efflux pump NepI  39.79 
 
 
397 aa  252  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1362  major facilitator transporter  40.92 
 
 
403 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726387  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6467  major facilitator transporter  40.92 
 
 
403 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.070181  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4887  major facilitator transporter  40.58 
 
 
398 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5383  major facilitator transporter  40.58 
 
 
398 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1136  major facilitator superfamily MFS_1  42.06 
 
 
408 aa  251  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  39.62 
 
 
400 aa  250  4e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0207  putative transporter transmembrane protein  40.33 
 
 
408 aa  249  6e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6377  major facilitator transporter  39.36 
 
 
404 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860251  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0835  major facilitator superfamily MFS_1  39.57 
 
 
433 aa  248  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  38.42 
 
 
407 aa  246  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5629  major facilitator transporter  39.35 
 
 
404 aa  246  5e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208414  normal  0.0407096 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1945  major facilitator transporter  38.46 
 
 
401 aa  245  9e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6830  major facilitator transporter  40.34 
 
 
394 aa  245  1e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0782  major facilitator superfamily MFS_1  38.73 
 
 
384 aa  243  7e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35500  Major facilitator superfamily transporter  39.25 
 
 
376 aa  237  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4801  major facilitator transporter  40.17 
 
 
376 aa  236  5e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2475  major facilitator transporter  39.57 
 
 
402 aa  233  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46904  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2011  major facilitator superfamily MFS_1  37.33 
 
 
409 aa  226  6e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2738  major facilitator superfamily MFS_1  34.26 
 
 
416 aa  225  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  36.05 
 
 
411 aa  223  5e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7381  permease  38.31 
 
 
402 aa  217  3e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0862221  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4854  major facilitator superfamily MFS_1  38.17 
 
 
395 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011677  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  36.8 
 
 
397 aa  206  5e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 
412 aa  199  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2898  major facilitator superfamily MFS_1  37.8 
 
 
402 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.537958  normal  0.729301 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  32.98 
 
 
418 aa  185  1e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  32.14 
 
 
399 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  34.33 
 
 
402 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  33.43 
 
 
415 aa  175  2e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  29.95 
 
 
406 aa  173  7e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  32.57 
 
 
415 aa  171  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  32.3 
 
 
408 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  34.68 
 
 
390 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2152  major facilitator transporter  33.9 
 
 
408 aa  166  6e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2647  major facilitator family transporter  33.9 
 
 
408 aa  166  7e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 
402 aa  166  8e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3182  major facilitator transporter  33.9 
 
 
413 aa  166  1e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 
397 aa  163  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1381  major facilitator transporter  33.6 
 
 
394 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  33.43 
 
 
410 aa  162  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 
398 aa  157  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4094  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 
422 aa  153  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  29.62 
 
 
407 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 
735 aa  150  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2694  major facilitator transporter  29.59 
 
 
392 aa  147  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303666  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0427  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 
390 aa  140  4e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.064985  normal  0.054119 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22240  arabinose efflux permease family protein  29.77 
 
 
409 aa  138  3e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 
390 aa  136  6e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  27.78 
 
 
397 aa  136  9e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3138  major facilitator transporter  28.24 
 
 
400 aa  135  2e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1788  major facilitator transporter  30.05 
 
 
399 aa  133  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0140849 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  25.99 
 
 
404 aa  132  1e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3749  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 
394 aa  131  2e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.630877  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2926  major facilitator transporter  31.55 
 
 
401 aa  131  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0235269  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2718  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 
403 aa  129  7e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00439118  normal  0.195622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  28.81 
 
 
404 aa  129  9e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3068  major facilitator family transporter  30.91 
 
 
375 aa  129  1e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.547079  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1543  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 
387 aa  129  1e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329427  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  31.42 
 
 
399 aa  128  2e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1499  sugar efflux transporter  28.77 
 
 
376 aa  127  4e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  6.71324e-08  normal  0.520287 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  30 
 
 
405 aa  126  8e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  27.12 
 
 
396 aa  126  8e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0860  major facilitator transporter  28.79 
 
 
397 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2428  sugar efflux transporter  29.97 
 
 
408 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0595849  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  29.38 
 
 
408 aa  124  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>