55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1248 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1248  phage integrase family protein  100 
 
 		 372 aa  773    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0661784  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1503  phage integrase family protein  97.04 
 
 		 372 aa  756    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.279125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2269  phage integrase family protein  62.63 
 
 		 372 aa  503  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0691132  hitchhiker  0.00139304 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1599  intergrase  44 
 
 		 380 aa  330  2e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122116 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1744  site-specific recombinase, phage integrase family  44.44 
 
 		 376 aa  325  5e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000266789  hitchhiker  0.000213416 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1415  phage integrase family site specific recombinase  44.44 
 
 		 376 aa  325  6e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0278227  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3178  site-specific recombinase, phage integrase family  44.18 
 
 		 376 aa  324  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0439431  hitchhiker  0.000000000000369688 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1821  site-specific recombinase, phage integrase family  44.18 
 
 		 376 aa  324  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0160439  hitchhiker  0.00000000000638112 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1426  site-specific recombinase, phage integrase family  44.18 
 
 		 376 aa  322  8e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0270724  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1650  phage integrase family protein  46.23 
 
 		 311 aa  268  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1841  phage integrase family protein  38.5 
 
 		 394 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400369  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2028  integrase family protein  50.97 
 
 		 260 aa  266  5e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0383876  normal  0.0301338 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1532  phage integrase, putative  36.58 
 
 		 368 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0656  Phage integrase  35.28 
 
 		 372 aa  197  3e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  35.9 
 
 		 356 aa  193  5e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  35.33 
 
 		 356 aa  192  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  34.76 
 
 		 356 aa  189  7e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1674  lambda integrase  34.87 
 
 		 385 aa  167  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154447  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2023  phage integrase  34.65 
 
 		 359 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.280518  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2029  phage integrase  35.29 
 
 		 359 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.0993134 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2084  integrase  37.15 
 
 		 284 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1432  integrase  35.29 
 
 		 359 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00370653  normal  0.301971 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1379  phage integrase  35.01 
 
 		 359 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000565692 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1011  integrase-like protein  32.96 
 
 		 375 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2946  integrase  34.13 
 
 		 312 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00705  hypothetical protein  33.1 
 
 		 304 aa  146  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2426  integrase family protein  30.83 
 
 		 362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0688  phage integrase  33.18 
 
 		 228 aa  100  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000188097  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7378  hypothetical protein  39.47 
 
 		 194 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0269984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3920  phage integrase, putative  31.55 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2016  putative cytoplasmic protein  39.32 
 
 		 122 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544327 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2069  hypothetical protein  39.32 
 
 		 122 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2577  hypothetical protein  27.5 
 
 		 394 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0261207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00702  hypothetical protein  51.92 
 
 		 54 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000701341  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1428  hypothetical protein  52 
 
 		 72 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3987  phage integrase family site specific recombinase  29.71 
 
 		 319 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  26.37 
 
 		 326 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  26.09 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  23.48 
 
 		 329 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1255  integrase  33.94 
 
 		 119 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1275  integrase family protein  33.33 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  24.69 
 
 		 349 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0376  integrase family protein  33.33 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0808  integrase family protein  33.33 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1083  integrase family protein  31.62 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000439188  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  24.03 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1212  integrase family protein  33.33 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  38.33 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  38.33 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2096  phage integrase family protein  26.46 
 
 		 200 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635069  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  33.33 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  38.33 
 
 		 339 aa  44.7  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  25.45 
 
 		 342 aa  43.9  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  40.43 
 
 		 346 aa  42.7  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  22.55 
 
 		 370 aa  43.1  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>