More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1826 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  100 
 
 		 247 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  86.29 
 
 		 248 aa  437  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  82.45 
 
 		 246 aa  423  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  80.74 
 
 		 246 aa  414  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  78.37 
 
 		 255 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  71.6 
 
 		 246 aa  368  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  67.92 
 
 		 240 aa  342  2.9999999999999997e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  66.67 
 
 		 248 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2492  ABC transporter related  68.31 
 
 		 243 aa  334  9e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  65.85 
 
 		 248 aa  333  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  67.08 
 
 		 243 aa  332  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  65.43 
 
 		 249 aa  326  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  66.67 
 
 		 243 aa  324  7e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  62.14 
 
 		 259 aa  323  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  66.8 
 
 		 248 aa  323  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3332  ABC transporter related  62.04 
 
 		 261 aa  322  3e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  62.5 
 
 		 242 aa  321  6e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  62.34 
 
 		 247 aa  321  7e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.45 
 
 		 253 aa  320  9.999999999999999e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  61.51 
 
 		 249 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  61.63 
 
 		 270 aa  319  3e-86  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  61.32 
 
 		 267 aa  318  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2020  ABC transporter related  65.98 
 
 		 246 aa  318  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  64.63 
 
 		 253 aa  318  6e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  62.92 
 
 		 244 aa  318  6e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  60.41 
 
 		 257 aa  317  7.999999999999999e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.59 
 
 		 269 aa  317  9e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  60.83 
 
 		 240 aa  317  9e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  60.82 
 
 		 257 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  62.92 
 
 		 242 aa  317  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  61.48 
 
 		 246 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  59.51 
 
 		 249 aa  317  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  60.98 
 
 		 249 aa  317  2e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.04 
 
 		 284 aa  317  2e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  62.08 
 
 		 244 aa  316  2e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2913  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 		 245 aa  315  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  62.2 
 
 		 257 aa  316  3e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  63.07 
 
 		 243 aa  315  3e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  61.94 
 
 		 247 aa  315  4e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  60.42 
 
 		 242 aa  315  4e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  62.92 
 
 		 244 aa  315  5e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.59 
 
 		 249 aa  314  7e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  58.7 
 
 		 249 aa  314  7e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  60.08 
 
 		 250 aa  314  7e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  61.73 
 
 		 245 aa  314  8e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  60.25 
 
 		 269 aa  313  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  65.18 
 
 		 252 aa  313  9.999999999999999e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  62.08 
 
 		 245 aa  313  1.9999999999999998e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  61.41 
 
 		 244 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  60.25 
 
 		 246 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  61.25 
 
 		 242 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  61.67 
 
 		 243 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  60.41 
 
 		 265 aa  312  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  60.08 
 
 		 262 aa  312  2.9999999999999996e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  60.17 
 
 		 244 aa  312  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  59.17 
 
 		 242 aa  311  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  63.07 
 
 		 243 aa  311  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  58.37 
 
 		 258 aa  311  5.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  58.37 
 
 		 258 aa  311  5.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.58 
 
 		 251 aa  311  7.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  61 
 
 		 247 aa  310  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2260  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  61.09 
 
 		 249 aa  310  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.334703  normal  0.463936 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  59.18 
 
 		 261 aa  310  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  62.08 
 
 		 246 aa  310  1e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2758  ABC transporter related  60.73 
 
 		 252 aa  310  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  61.57 
 
 		 244 aa  310  1e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2465  ABC transporter related  61.09 
 
 		 249 aa  310  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  60.83 
 
 		 239 aa  309  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  62.5 
 
 		 256 aa  310  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  59.51 
 
 		 258 aa  310  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  59.5 
 
 		 245 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  61.41 
 
 		 243 aa  310  2e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  60.49 
 
 		 247 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  58.61 
 
 		 246 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  62.5 
 
 		 242 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  57.89 
 
 		 259 aa  308  4e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2072  ABC transporter related  60.67 
 
 		 249 aa  308  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0159024  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  59.5 
 
 		 253 aa  308  5e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2585  ABC transporter related  59.34 
 
 		 244 aa  308  5.9999999999999995e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.83 
 
 		 251 aa  308  8e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  61.67 
 
 		 242 aa  307  9e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  57.89 
 
 		 249 aa  306  1.0000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  60.32 
 
 		 247 aa  306  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  61.51 
 
 		 268 aa  306  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  58.75 
 
 		 253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  56.91 
 
 		 252 aa  306  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5813  ABC transporter ATP-binding protein  61.89 
 
 		 244 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  58.68 
 
 		 258 aa  306  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  60.42 
 
 		 241 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  58.75 
 
 		 242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0377  ABC transporter-like  61.07 
 
 		 244 aa  306  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67030  ABC transporter ATP-binding protein  61.89 
 
 		 244 aa  305  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  59.26 
 
 		 256 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2068  ABC transporter related  60.73 
 
 		 247 aa  305  4.0000000000000004e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  59.17 
 
 		 240 aa  305  4.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  59.02 
 
 		 261 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  59.75 
 
 		 251 aa  305  5.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  60 
 
 		 242 aa  305  5.0000000000000004e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  58.3 
 
 		 263 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  60.42 
 
 		 249 aa  305  6e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>