More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0213 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0213  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 722 aa  1456    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100019 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1684  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  61.04 
 
 		 581 aa  684    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0799101  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1658  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  65.97 
 
 		 579 aa  785    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0362267  normal  0.337398 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 		 564 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2391  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 		 573 aa  352  2e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000390402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0016  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.56 
 
 		 679 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.225702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2148  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 		 729 aa  204  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 592 aa  191  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 595 aa  188  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2821  sensory box histidine kinase  31.99 
 
 		 604 aa  186  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2908  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.04 
 
 		 604 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.293686  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 		 586 aa  185  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.1 
 
 		 598 aa  181  4.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0768  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 673 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1396  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.98 
 
 		 547 aa  173  9e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  42.24 
 
 		 458 aa  173  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  42.24 
 
 		 458 aa  172  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  42.24 
 
 		 458 aa  172  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  41.81 
 
 		 465 aa  171  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  41.81 
 
 		 458 aa  171  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2592  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.82 
 
 		 539 aa  171  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  42.67 
 
 		 458 aa  171  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0675  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 855 aa  170  7e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1634  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.33 
 
 		 538 aa  169  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  42.24 
 
 		 458 aa  169  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0915  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.27 
 
 		 362 aa  169  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.115848  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1494  sensory box histidine kinase  34.38 
 
 		 550 aa  169  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102326  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2787  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.86 
 
 		 365 aa  169  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220649  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  32.77 
 
 		 363 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  41.81 
 
 		 458 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4384  sensor protein ZraS  40.08 
 
 		 465 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.528671 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1781  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 430 aa  164  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4417  sensor protein ZraS  40.08 
 
 		 465 aa  164  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00746463  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4504  sensor protein ZraS  40.08 
 
 		 465 aa  164  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79058  normal  0.150047 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  40.08 
 
 		 465 aa  163  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  39.66 
 
 		 465 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0449014 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3078  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.66 
 
 		 369 aa  161  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.86 
 
 		 578 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2456  sensor histidine kinase  34.67 
 
 		 509 aa  159  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.237642  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2419  sensor histidine kinase  34.67 
 
 		 595 aa  159  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.131968  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2665  sensor histidine kinase  36 
 
 		 590 aa  159  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650271 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2380  sensor histidine kinase  34.67 
 
 		 595 aa  159  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.343005  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2703  hypothetical protein  34.67 
 
 		 595 aa  159  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.894836  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1384  sensory histidine kinase AtoS  32.3 
 
 		 617 aa  159  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2659  hypothetical protein  36 
 
 		 595 aa  159  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 525 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2636  sensor histidine kinase  34.67 
 
 		 499 aa  158  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0828  sensory histidine kinase AtoS  39.34 
 
 		 613 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.167481 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0186  sensor protein ZraS  43.75 
 
 		 521 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2653  sensor histidine kinase  34.42 
 
 		 595 aa  157  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000377576 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 526 aa  157  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1016  sensor protein ZraS  38.59 
 
 		 450 aa  157  9e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0625472  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2662  hypothetical protein  35.6 
 
 		 595 aa  156  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 803 aa  156  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.623752 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2146  two component signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 559 aa  155  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 525 aa  156  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  40.4 
 
 		 655 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0824  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.96 
 
 		 616 aa  154  4e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125796 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 		 372 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  31.42 
 
 		 621 aa  153  8.999999999999999e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2562  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.05 
 
 		 363 aa  153  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1311  sensory histidine kinase AtoS  35.15 
 
 		 614 aa  153  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 543 aa  153  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2505  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 595 aa  153  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0288015  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0414  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.58 
 
 		 581 aa  151  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1138  histidine kinase  38.05 
 
 		 234 aa  149  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03833  hypothetical protein  43.2 
 
 		 422 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0772561  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 372 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  32.66 
 
 		 608 aa  147  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  32.66 
 
 		 608 aa  147  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  32.66 
 
 		 608 aa  147  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 		 656 aa  147  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 		 645 aa  147  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  37.66 
 
 		 656 aa  147  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.66 
 
 		 608 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  32.66 
 
 		 608 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  32.66 
 
 		 608 aa  147  9e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1796  histidine kinase  33.45 
 
 		 584 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  36.13 
 
 		 581 aa  146  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  37.87 
 
 		 367 aa  145  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0448  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.61 
 
 		 519 aa  145  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1700  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 591 aa  145  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 655 aa  143  9e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0979  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 617 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0233  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 553 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0966  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 615 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.25 
 
 		 1215 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 		 689 aa  142  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 367 aa  142  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 510 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2643  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 434 aa  141  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4825  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 582 aa  141  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1751  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 671 aa  141  4.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 549 aa  140  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3573  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 		 402 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1970  sensory box histidine kinase  27.56 
 
 		 415 aa  140  8.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.645732  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2061  histidine kinase  39.29 
 
 		 412 aa  140  8.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000174417 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1993  two component sensor histidine kinase  34.8 
 
 		 366 aa  140  8.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1736  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 		 738 aa  140  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 378 aa  140  8.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>