More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1835 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2026  TolC family type I secretion outer membrane protein  98.5 
 
 
405 aa  778  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341805  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1835  type I secretion outer membrane protein, TolC family  100 
 
 
447 aa  886  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  73.44 
 
 
469 aa  607  1e-172  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2352  TolC family type I secretion outer membrane protein  68.78 
 
 
446 aa  543  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  67.06 
 
 
491 aa  524  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  59.87 
 
 
512 aa  508  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1664  Type I secretion outer membrane protein, TolC  61.19 
 
 
453 aa  492  1e-138  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2604  Type I secretion outer membrane protein, TolC  59.59 
 
 
442 aa  484  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  59.38 
 
 
450 aa  483  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1041  type I secretion outer membrane efflux protein  54.83 
 
 
451 aa  434  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2439  TolC family type I secretion outer membrane protein  52.61 
 
 
443 aa  389  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.690734 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2711  Type I secretion outer membrane protein TolC  45.8 
 
 
493 aa  345  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0749  Type I secretion outer membrane protein, TolC  44.3 
 
 
497 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  42.12 
 
 
437 aa  293  3e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3926  Type I secretion outer membrane protein, TolC  42.89 
 
 
441 aa  294  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  45.72 
 
 
434 aa  286  7e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2283  Type I secretion outer membrane protein, TolC  39.01 
 
 
480 aa  280  3e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1022  Type I secretion outer membrane protein, TolC  42.17 
 
 
489 aa  280  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15714  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0695  porin (omp) ABC transporter protein  38.94 
 
 
484 aa  275  9e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0288188  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0645  type I secretion outer membrane protein, TolC family  39.2 
 
 
488 aa  273  6e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.173394 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0604  type I secretion outer membrane protein, TolC family  39.42 
 
 
478 aa  272  7e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.62 
 
 
468 aa  250  4e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0483  type I secretion outer membrane protein, TolC  37.3 
 
 
440 aa  233  4e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3585  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.04 
 
 
484 aa  222  1e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2616  Type I secretion outer membrane protein, TolC  35.68 
 
 
450 aa  221  2e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.930678  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  35 
 
 
435 aa  214  3e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  4.56355e-08  hitchhiker  5.11139e-05 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  35 
 
 
435 aa  214  3e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  5.55232e-06  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  35 
 
 
435 aa  213  4e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  2.45313e-06  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  35 
 
 
435 aa  211  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  3.09945e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0258  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.96 
 
 
539 aa  205  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17913  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.82 
 
 
461 aa  204  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  34.54 
 
 
435 aa  204  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.18 
 
 
442 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  32.39 
 
 
462 aa  203  5e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  3.44286e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0806  outer membrane channel protein  33.95 
 
 
435 aa  201  1e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.13836e-08  hitchhiker  8.82186e-11 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  34.41 
 
 
434 aa  201  2e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.35514e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0781  outer membrane channel protein  33.95 
 
 
435 aa  201  2e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.84345e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2558  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.49 
 
 
452 aa  201  2e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.431388  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00869  outer membrane channel protein  33.04 
 
 
445 aa  201  2e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  33.71 
 
 
442 aa  201  2e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  3.01167e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3578  outer membrane channel protein  33.95 
 
 
435 aa  201  2e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  4.08694e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0813  outer membrane channel protein  33.95 
 
 
435 aa  201  2e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  6.21601e-07  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  35.65 
 
 
449 aa  199  8e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.33 
 
 
453 aa  198  2e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  34.16 
 
 
448 aa  197  4e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  5.76987e-07  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3157  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.26 
 
 
442 aa  197  4e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.262509 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.67 
 
 
436 aa  196  5e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  1.14483e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3048  outer membrane channel protein  35.91 
 
 
432 aa  196  5e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  9.73822e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3332  outer membrane channel protein  34.52 
 
 
431 aa  196  9e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0563453  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1642  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.6 
 
 
446 aa  195  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0774  outer membrane channel protein  32.42 
 
 
441 aa  195  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  9.83275e-07  unclonable  1.04798e-10 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3225  outer membrane channel protein  34.33 
 
 
432 aa  195  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  9.29322e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  30.55 
 
 
449 aa  193  6e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  32.87 
 
 
438 aa  191  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.58125e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4195  outer membrane channel protein  31.59 
 
 
443 aa  190  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  6.11538e-05  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0654  outer membrane channel protein  31.86 
 
 
464 aa  190  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.945309  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0573  outer membrane channel protein  31.86 
 
 
464 aa  190  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5705  outer membrane efflux protein  34.25 
 
 
481 aa  189  6e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0284  outer membrane channel protein  32.56 
 
 
465 aa  189  9e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65750  putative outer membrane efflux protein precursor  35.24 
 
 
482 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0313  outer membrane channel protein  31.71 
 
 
463 aa  188  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1990  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.52 
 
 
498 aa  188  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  32.41 
 
 
454 aa  186  7e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  29.98 
 
 
489 aa  185  1e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  29.98 
 
 
489 aa  185  1e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  29.98 
 
 
489 aa  185  1e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  29.98 
 
 
489 aa  186  1e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  29.98 
 
 
489 aa  185  1e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0610  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.68 
 
 
480 aa  184  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1282  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.57 
 
 
465 aa  183  7e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1304  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.15 
 
 
446 aa  181  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  1.51154e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  31.31 
 
 
470 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.78 
 
 
494 aa  181  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2675  outer membrane channel protein  29.41 
 
 
441 aa  181  3e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0323  outer membrane channel protein  31.02 
 
 
463 aa  180  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  6.73159e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0381  type I secretion outer membrane protein, TolC family  32.09 
 
 
445 aa  180  4e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230254  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  31.63 
 
 
493 aa  180  5e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  31.63 
 
 
493 aa  179  6e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02907  outer membrane channel precursor protein  31.63 
 
 
493 aa  179  6e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02857  hypothetical protein  31.63 
 
 
493 aa  179  6e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4349  outer membrane channel protein  31.63 
 
 
493 aa  179  6e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823303  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.63 
 
 
493 aa  179  6e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  31.63 
 
 
495 aa  179  7e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  31.63 
 
 
495 aa  179  7e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3468  outer membrane channel protein  31.4 
 
 
495 aa  179  8e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  30.52 
 
 
497 aa  179  9e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0585  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.37 
 
 
456 aa  179  9e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449084  normal  0.127961 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  29.65 
 
 
494 aa  178  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0056  porin (omp) ABC transporter protein  34.24 
 
 
460 aa  177  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30.11 
 
 
456 aa  176  9e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1345  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.77 
 
 
455 aa  176  1e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0733  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.29 
 
 
434 aa  174  3e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  29.6 
 
 
469 aa  174  4e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0491  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.72 
 
 
477 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00611692  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4715  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.68 
 
 
477 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.133912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4923  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.17 
 
 
477 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1746  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.5 
 
 
446 aa  170  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3453  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.74 
 
 
432 aa  170  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4799  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.17 
 
 
477 aa  170  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125067  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4976  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.87 
 
 
478 aa  167  3e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>