More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0012 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0012  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 472 aa  911    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.728091  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4155  homoserine dehydrogenase  96.82 
 
 		 471 aa  781    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0011  homoserine dehydrogenase  60.71 
 
 		 466 aa  386  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2035  Homoserine dehydrogenase  57.07 
 
 		 452 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  44.72 
 
 		 443 aa  354  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  45.15 
 
 		 435 aa  348  1e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1912  homoserine dehydrogenase  48.78 
 
 		 452 aa  348  2e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  50.96 
 
 		 440 aa  346  5e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  46.62 
 
 		 436 aa  345  8e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  44.7 
 
 		 436 aa  345  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  44.27 
 
 		 443 aa  344  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  44.27 
 
 		 443 aa  344  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  45.37 
 
 		 436 aa  344  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  44.14 
 
 		 442 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  44.14 
 
 		 442 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  44.14 
 
 		 442 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  49.59 
 
 		 449 aa  343  5.999999999999999e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  45.96 
 
 		 448 aa  342  5.999999999999999e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  44.97 
 
 		 442 aa  342  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  46.62 
 
 		 444 aa  341  2e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  44.3 
 
 		 442 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  45.52 
 
 		 447 aa  339  8e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  44.24 
 
 		 436 aa  335  9e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  42.66 
 
 		 439 aa  335  1e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  44.3 
 
 		 442 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3206  homoserine dehydrogenase  50.95 
 
 		 453 aa  333  4e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2559  homoserine dehydrogenase  50.68 
 
 		 453 aa  332  7.000000000000001e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  42.44 
 
 		 436 aa  331  2e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  43.5 
 
 		 437 aa  331  2e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  43.5 
 
 		 437 aa  331  2e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  52.94 
 
 		 438 aa  331  2e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  44.07 
 
 		 442 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1147  homoserine dehydrogenase  45.48 
 
 		 442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0258107  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1385  homoserine dehydrogenase  45.48 
 
 		 442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2396  homoserine dehydrogenase  45.48 
 
 		 442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2198  homoserine dehydrogenase  45.48 
 
 		 442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000198219  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0022  homoserine dehydrogenase  45.48 
 
 		 442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1875  homoserine dehydrogenase  45.48 
 
 		 442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2232  homoserine dehydrogenase  45.48 
 
 		 442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2270  homoserine dehydrogenase  45.48 
 
 		 442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.606772  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  42.21 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2663  homoserine dehydrogenase  46.65 
 
 		 444 aa  325  8.000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  51.78 
 
 		 436 aa  325  1e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  45.27 
 
 		 433 aa  321  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  43.57 
 
 		 434 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  44.74 
 
 		 440 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  43.57 
 
 		 434 aa  320  5e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  43.34 
 
 		 434 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  43.34 
 
 		 434 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  43.34 
 
 		 434 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  43.57 
 
 		 434 aa  319  9e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  43.34 
 
 		 434 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1202  homoserine dehydrogenase  43.46 
 
 		 439 aa  317  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0498363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1263  homoserine dehydrogenase  43.46 
 
 		 439 aa  317  4e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.692056 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  44.58 
 
 		 437 aa  315  9e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  43.34 
 
 		 463 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  43.57 
 
 		 437 aa  310  2.9999999999999997e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1298  homoserine dehydrogenase  48.63 
 
 		 429 aa  310  4e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220896  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1209  homoserine dehydrogenase  43.4 
 
 		 450 aa  309  5e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0141244  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  42.89 
 
 		 434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  40.45 
 
 		 433 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39490  homoserine dehydrogenase  44.24 
 
 		 439 aa  306  4.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126248  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  46.74 
 
 		 439 aa  306  4.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  51.09 
 
 		 436 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  51.09 
 
 		 440 aa  306  6e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1327  homoserine dehydrogenase  46.54 
 
 		 439 aa  301  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.818962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  50.42 
 
 		 438 aa  301  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  44.84 
 
 		 438 aa  299  8e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  41.76 
 
 		 440 aa  299  8e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2273  homoserine dehydrogenase  52.1 
 
 		 428 aa  298  2e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  44.06 
 
 		 449 aa  297  3e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  46.37 
 
 		 440 aa  296  6e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  46.9 
 
 		 437 aa  295  9e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3394  homoserine dehydrogenase  43.57 
 
 		 434 aa  291  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1281  Homoserine dehydrogenase  45.15 
 
 		 437 aa  291  2e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0597  homoserine dehydrogenase  46.85 
 
 		 436 aa  288  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1541  homoserine dehydrogenase  44.63 
 
 		 438 aa  288  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2454  homoserine dehydrogenase  42.79 
 
 		 436 aa  288  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.38424  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  51.92 
 
 		 430 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2816  homoserine dehydrogenase  47.55 
 
 		 440 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0834  homoserine dehydrogenase  50.89 
 
 		 428 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.354577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  46.6 
 
 		 439 aa  281  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  48.77 
 
 		 436 aa  281  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  46.91 
 
 		 439 aa  281  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  46.2 
 
 		 441 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  47.81 
 
 		 427 aa  280  6e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0403  homoserine dehydrogenase  50.3 
 
 		 428 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  37.3 
 
 		 436 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  46.2 
 
 		 441 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2057  homoserine dehydrogenase  50.6 
 
 		 428 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  47.68 
 
 		 423 aa  277  2e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  46.3 
 
 		 439 aa  277  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4731  homoserine dehydrogenase  50.29 
 
 		 444 aa  277  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.911552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  46.13 
 
 		 436 aa  276  5e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  43.01 
 
 		 438 aa  276  5e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0253  homoserine dehydrogenase  40.93 
 
 		 448 aa  276  8e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000322184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2998  homoserine dehydrogenase  50.3 
 
 		 428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.49984  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3678  homoserine dehydrogenase  42.21 
 
 		 438 aa  275  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  41.93 
 
 		 427 aa  273  3e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0279  homoserine dehydrogenase  40.27 
 
 		 448 aa  273  6e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00103779  normal  0.156224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>