More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2798 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2798  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  100 
 
 
234 aa  471  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0982  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  70.69 
 
 
256 aa  333  1e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1582  sporulation sigma factor SigK  67.87 
 
 
226 aa  309  2.9999999999999997e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000492275  normal  0.195753 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3546  sporulation sigma factor SigK  61.6 
 
 
249 aa  292  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2471  sporulation sigma factor SigK  62.28 
 
 
236 aa  281  8.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4421  sporulation sigma factor SigK  60.96 
 
 
265 aa  275  5e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0778  sporulation sigma factor SigK  62.39 
 
 
237 aa  274  9e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.377161  hitchhiker  0.0088749 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4190  sporulation sigma factor SigK  62.39 
 
 
237 aa  274  9e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4236  sporulation sigma factor SigK  62.39 
 
 
237 aa  274  9e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4074  sporulation sigma factor SigK  62.39 
 
 
237 aa  274  9e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4084  sporulation sigma factor SigK  62.39 
 
 
237 aa  274  9e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4472  sporulation sigma factor SigK  62.39 
 
 
237 aa  274  9e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4566  sporulation sigma factor SigK  62.39 
 
 
237 aa  274  9e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4459  sporulation sigma factor SigK  62.39 
 
 
237 aa  274  9e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177817  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3065  sporulation sigma factor SigK  62.39 
 
 
237 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1012  sporulation sigma factor SigK  64.76 
 
 
236 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0982  sporulation sigma factor SigK  62.88 
 
 
245 aa  271  9e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0517  sporulation sigma factor SigK  59.11 
 
 
244 aa  267  1e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1501  sporulation sigma factor SigK  58.62 
 
 
231 aa  256  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05860  sporulation sigma factor SigK  60.45 
 
 
232 aa  254  7e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2020  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  56.7 
 
 
239 aa  250  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.851025  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2021  sporulation sigma factor SigK  58.48 
 
 
233 aa  244  8e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.653409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1738  sporulation sigma factor SigK  58.48 
 
 
233 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.475543  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1030  sporulation sigma factor SigE  54.76 
 
 
239 aa  229  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000129886  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2015  sporulation sigma factor SigE  54.63 
 
 
235 aa  229  3e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.785691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1733  sporulation sigma factor SigE  54.63 
 
 
235 aa  229  3e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0265453  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1900  sporulation sigma factor SigE  53.81 
 
 
239 aa  226  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3731  sporulation sigma factor SigE  53.33 
 
 
239 aa  223  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000278458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3949  sporulation sigma factor SigE  52.86 
 
 
239 aa  221  9e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000781708  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3957  sporulation sigma factor SigE  52.86 
 
 
239 aa  221  9e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000112899  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3755  sporulation sigma factor SigE  52.86 
 
 
239 aa  221  9e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00369355  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4005  sporulation sigma factor SigE  52.86 
 
 
239 aa  221  9e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00100878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3646  sporulation sigma factor SigE  52.86 
 
 
239 aa  221  9e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000510031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3663  sporulation sigma factor SigE  52.86 
 
 
239 aa  221  9e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000395259  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4043  sporulation sigma factor SigE  52.86 
 
 
239 aa  221  9e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1236  sporulation sigma factor SigE  52.86 
 
 
239 aa  221  9e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000024975  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3918  sporulation sigma factor SigE  52.86 
 
 
239 aa  221  9e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000071882 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2553  sporulation sigma factor SigE  52.86 
 
 
239 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000344705  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2001  sporulation sigma factor SigE  54.29 
 
 
241 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000755771  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1290  sporulation sigma factor SigE  52.38 
 
 
249 aa  217  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2062  sporulation sigma factor SigE  50.23 
 
 
243 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000360983  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0686  sporulation sigma factor SigE  50.95 
 
 
241 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0736  sporulation sigma factor SigK  55.24 
 
 
219 aa  210  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000259555  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1426  sporulation sigma factor SigE  50.73 
 
 
241 aa  209  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0852  sporulation sigma factor SigE  51.22 
 
 
243 aa  209  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0114797  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1066  sporulation sigma factor SigE  50 
 
 
241 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000178993  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1310  sporulation sigma factor SigE  49.52 
 
 
239 aa  207  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000184343  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09150  sporulation sigma factor SigE  50.24 
 
 
245 aa  203  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000261644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4054  sporulation sigma factor SigE  51.94 
 
 
249 aa  203  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0787  sporulation sigma factor SigE  49.29 
 
 
244 aa  203  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.761292  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0447  sporulation sigma factor SigE  49.29 
 
 
244 aa  202  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000743913  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0835  sporulation sigma factor SigE  47.56 
 
 
240 aa  201  5e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.935984  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2655  sporulation sigma factor SigK  44.54 
 
 
232 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2469  sporulation sigma factor SigE  49.77 
 
 
246 aa  198  6e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130703  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1553  sporulation sigma factor SigE  50.24 
 
 
242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000347236  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2290  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  54.69 
 
 
207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.345877  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4418  RNA polymerase sigma-K factor  66.92 
 
 
149 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0997  sigma-70 region 2 domain-containing protein  76.92 
 
 
118 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0912  sigma-70 region 4 domain-containing protein  74.36 
 
 
118 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1770  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  64.35 
 
 
114 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.692748  normal  0.378996 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0501  sigma 28 (flagella/sporulation)  57.02 
 
 
126 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1737  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  56.48 
 
 
113 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0277937 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0788  sporulation sigma factor SigG  30.43 
 
 
255 aa  94  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667987  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2870  sporulation sigma factor SigG  30.04 
 
 
273 aa  93.2  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000515832  hitchhiker  0.0000000000171975 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4361  RNA polymerase sigma-K factor  56.18 
 
 
100 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2468  sporulation sigma factor SigG  29.64 
 
 
260 aa  87  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000740675  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1552  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  28.46 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178805  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1680  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  32.75 
 
 
232 aa  86.7  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1425  sporulation sigma factor SigG  29.64 
 
 
255 aa  85.1  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00153435  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1702  RpoS  27.94 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0629652  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2061  sporulation sigma factor SigG  29.84 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147139  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2000  sporulation sigma factor SigG  29.64 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000480045  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12400  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  30.86 
 
 
358 aa  84.3  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0607  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0448  sporulation sigma factor SigG  30.24 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000243038  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0863  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  30.4 
 
 
245 aa  83.6  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07020  sporulation sigma factor SigF  29.51 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0853  sporulation sigma factor SigG  28.79 
 
 
272 aa  82.8  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0182418  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09160  sporulation sigma factor SigG  30.24 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000197734  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2284  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  30.74 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1732  sporulation sigma factor SigG  28.85 
 
 
257 aa  82  0.000000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0249664  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0687  sporulation sigma factor SigG  28.06 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0013  putative type II alternative sigma factor, sigma70 family  28.93 
 
 
307 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2014  sporulation sigma factor SigG  28.85 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06321  type II alternative sigma-70 family RNA polymerase sigma factor  28.93 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.903812  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3442  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  30.92 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3036  RNA polymerase sigma factor RpoD  30.8 
 
 
359 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0549205  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1203  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  30.58 
 
 
281 aa  79.3  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000512753  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1031  sporulation sigma factor SigG  27.24 
 
 
259 aa  79  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000174079  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1901  sporulation sigma factor SigG  27.24 
 
 
259 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2414  RNA polymerase sigma factor RpoD  30.89 
 
 
374 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000700134  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2739  RpoD family RNA polymerase sigma factor  28.05 
 
 
323 aa  78.6  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1291  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  29.41 
 
 
259 aa  78.6  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0157  RNA polymerase sigma factor RpoD  29.88 
 
 
375 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0374  sporulation sigma factor SigF  27.05 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4032  RNA polymerase sigma factor RpoD  30.89 
 
 
373 aa  77  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.92398e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4042  RNA polymerase sigma factor RpoD  30.89 
 
 
373 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000102439  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4408  RpoD family RNA polymerase sigma factor  28.63 
 
 
347 aa  77  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.756386  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4515  RNA polymerase sigma factor RpoD  30.89 
 
 
373 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000315443  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3730  sporulation sigma factor SigG  28.63 
 
 
292 aa  77  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4053  sporulation sigma factor SigG  28.91 
 
 
257 aa  77  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000132793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>