More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0028 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0028  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 368 aa  759    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4857  Radical SAM domain protein  54.21 
 
 		 365 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0838  biotin synthase  43.48 
 
 		 350 aa  299  5e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2085  biotin synthase  42.03 
 
 		 350 aa  295  6e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000297943  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  33.56 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2151  biotin synthase  32.34 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0181  Radical SAM domain protein  32.33 
 
 		 349 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1502  biotin synthase  34.59 
 
 		 348 aa  135  8e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000209115  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1130  biotin synthase  32.66 
 
 		 352 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000236268  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1551  biotin synthase  34.03 
 
 		 348 aa  133  5e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2462  biotin synthase  32.43 
 
 		 347 aa  133  5e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2775  biotin synthase  32.09 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0563  biotin synthase  31.06 
 
 		 345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.295179  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1863  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 		 380 aa  126  8.000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.176912  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1597  biotin synthase  29.05 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2083  biotin synthase  30 
 
 		 372 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1839  biotin synthase  31.7 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0814889  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19160  biotin synthase  30.54 
 
 		 350 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0257647  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1388  biotin synthase  28.33 
 
 		 323 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00378301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1735  biotin synthase  31.58 
 
 		 350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00262623  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1607  biotin synthase  28.66 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0240  biotin synthase  32.14 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1244  Radical SAM domain protein  30.23 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0841  biotin synthase  29.31 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0271  Radical SAM domain protein  31.21 
 
 		 347 aa  114  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.195415  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3189  biotin synthase  27.3 
 
 		 345 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000310414  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16510  iron-only hydrogenase maturation protein HydE  29.3 
 
 		 351 aa  107  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2277  biotin synthase  28.04 
 
 		 337 aa  107  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3925  biotin synthase  27.89 
 
 		 359 aa  106  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1632  biotin synthase  29.64 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000234633  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3255  biotin synthase  25.9 
 
 		 359 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.464529  hitchhiker  0.000014228 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0166  radical SAM domain-containing protein  29.21 
 
 		 370 aa  100  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.372295  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1329  radical SAM domain-containing protein  28.34 
 
 		 346 aa  100  6e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017523 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0144  Radical SAM domain protein  27.34 
 
 		 352 aa  98.2  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000047373  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1844  biotin synthase  28.38 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1491  biotin synthase  26.73 
 
 		 357 aa  97.8  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0706  biotin synthase  27.01 
 
 		 359 aa  97.8  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.997344  hitchhiker  0.000263623 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0145  biotin and thiamin synthesis associated  27.56 
 
 		 475 aa  94.7  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000404218  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  23.16 
 
 		 341 aa  93.2  7e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.71 
 
 		 481 aa  92.8  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2639  Radical SAM domain protein  29.14 
 
 		 374 aa  92.4  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1131  biotin synthase  23.49 
 
 		 341 aa  91.7  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  23.16 
 
 		 341 aa  91.3  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1738  biotin synthase  27.34 
 
 		 349 aa  90.9  4e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1722  biotin synthase  27.12 
 
 		 348 aa  90.5  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000337366  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0238  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.03 
 
 		 469 aa  90.5  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1020  biotin synthase  29.5 
 
 		 311 aa  90.5  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1504  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.02 
 
 		 473 aa  90.1  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0434134  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1026  biotin synthase  25 
 
 		 344 aa  89.7  7e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1553  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.34 
 
 		 471 aa  87.4  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0469  biotin synthase  26.74 
 
 		 354 aa  86.3  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000778897 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0169  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.35 
 
 		 477 aa  85.5  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000784524  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1504  biotin synthase  28.74 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1125  biotin synthase  22.06 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1100  Radical SAM domain protein  24.21 
 
 		 364 aa  83.6  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00787041  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3104  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.83 
 
 		 470 aa  83.2  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.86 
 
 		 474 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0273  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.41 
 
 		 472 aa  82  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2637  biotin and thiamin synthesis associated  26.15 
 
 		 474 aa  81.6  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0455456  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0106  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.1 
 
 		 473 aa  82  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3253  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.35 
 
 		 479 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000173942 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3923  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.61 
 
 		 479 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0108  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.1 
 
 		 473 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0708  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.09 
 
 		 479 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.519768  hitchhiker  0.000306942 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.3 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1599  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.15 
 
 		 471 aa  79.3  0.00000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2082  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.67 
 
 		 472 aa  79  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.388177  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1492  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.47 
 
 		 473 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1390  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.44 
 
 		 464 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00852808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1864  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.81 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.804214  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1841  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.86 
 
 		 490 aa  77  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0513393  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2753  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.18 
 
 		 465 aa  76.6  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16500  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.03 
 
 		 484 aa  76.3  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0163  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.86 
 
 		 491 aa  76.3  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0182  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.42 
 
 		 469 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0842  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.61 
 
 		 468 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1505  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.06 
 
 		 467 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1022  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.17 
 
 		 487 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  29.09 
 
 		 328 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1301  Biotin synthase  28.91 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1241  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.62 
 
 		 492 aa  74.3  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  27.6 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  26.82 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.92 
 
 		 466 aa  73.6  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2103  biotin synthase  27.68 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.881041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  26.17 
 
 		 792 aa  73.2  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1853  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.77 
 
 		 367 aa  72.8  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0654  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.31 
 
 		 458 aa  72  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1734  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.48 
 
 		 467 aa  72  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.908145  normal  0.683505 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2150  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.94 
 
 		 489 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2187  biotin synthase  26.86 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.80903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  27.78 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1065  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.11 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2286  biotin synthase  27.1 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0215942 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  26.05 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  26.37 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  21.93 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0737  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.11 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1188  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.14 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  24.82 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>