49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1977 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  100 
 
 		 913 aa  1821    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0987  hypothetical protein  37.83 
 
 		 911 aa  559  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000754464  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0972  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  36.03 
 
 		 916 aa  427  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0722  hypothetical protein  33.08 
 
 		 930 aa  428  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.851206  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  36.25 
 
 		 896 aa  424  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3621  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  35.08 
 
 		 906 aa  419  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221768  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1314  ATP-dependent nuclease subunit B  30.3 
 
 		 872 aa  410  1e-113  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00191673  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1374  hypothetical protein  29.89 
 
 		 862 aa  405  1e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886385  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0467  hypothetical protein  35.22 
 
 		 912 aa  397  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1752  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  31.46 
 
 		 940 aa  324  5e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.894533 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2223  hypothetical protein  27.52 
 
 		 858 aa  312  2e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2195  hypothetical protein  26.7 
 
 		 858 aa  305  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1698  hypothetical protein  28.99 
 
 		 922 aa  292  3e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  26.28 
 
 		 935 aa  232  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  27.59 
 
 		 993 aa  65.5  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0479  ATP-dependent nuclease subunit B-like  24.15 
 
 		 908 aa  62  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.236866  hitchhiker  0.000840779 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  23.5 
 
 		 951 aa  61.6  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  27.98 
 
 		 991 aa  58.2  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  22.57 
 
 		 781 aa  57.8  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0765  hypothetical protein  31.1 
 
 		 1100 aa  55.8  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166845 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3435  hypothetical protein  33.7 
 
 		 1018 aa  52.4  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  26.95 
 
 		 997 aa  50.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  33.95 
 
 		 259 aa  50.8  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  25.95 
 
 		 1059 aa  49.7  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  27.96 
 
 		 865 aa  50.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  24.86 
 
 		 988 aa  49.3  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  26.67 
 
 		 990 aa  49.3  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  23.23 
 
 		 780 aa  48.9  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  34.42 
 
 		 291 aa  49.3  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  25.77 
 
 		 1052 aa  47.8  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  27.41 
 
 		 984 aa  48.1  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  26.5 
 
 		 997 aa  47.8  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0978  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1000 aa  47.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.263512  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  31.18 
 
 		 991 aa  47.4  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25.82 
 
 		 957 aa  47  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25.92 
 
 		 1049 aa  47.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  22.76 
 
 		 1016 aa  47  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  25.75 
 
 		 1000 aa  46.6  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1682  ATP-dependent exonuclease, subunit B  28.57 
 
 		 1106 aa  46.6  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  27.74 
 
 		 1049 aa  46.2  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0517  hypothetical protein  23.79 
 
 		 960 aa  46.2  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0137071 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2795  putative helicase/exonuclease  27.21 
 
 		 980 aa  46.2  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  25.59 
 
 		 1048 aa  45.8  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  28.95 
 
 		 323 aa  45.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  24.89 
 
 		 976 aa  45.4  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  24.43 
 
 		 1062 aa  45.1  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  34.84 
 
 		 302 aa  45.1  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  30.66 
 
 		 311 aa  44.7  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  30.54 
 
 		 284 aa  44.3  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>