68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2704 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  100 
 
 		 746 aa  1543    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1598  hypothetical protein  42.94 
 
 		 521 aa  254  5.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1258  hypothetical protein  32.64 
 
 		 650 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1015  hypothetical protein  37.02 
 
 		 701 aa  232  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.693082  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1612  hypothetical protein  32.57 
 
 		 866 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.514221 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0796  hypothetical protein  30.97 
 
 		 535 aa  213  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1539  hypothetical protein  32.74 
 
 		 399 aa  210  9e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2087  AAA ATPase  36.32 
 
 		 685 aa  209  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7054  hypothetical protein  27.19 
 
 		 739 aa  196  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  40.98 
 
 		 717 aa  194  6e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1348  hypothetical protein  38.83 
 
 		 643 aa  192  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  39.85 
 
 		 717 aa  185  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  38.93 
 
 		 283 aa  184  7e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  38.64 
 
 		 283 aa  183  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  40.07 
 
 		 717 aa  182  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  40.08 
 
 		 263 aa  178  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0023  hypothetical protein  27.58 
 
 		 576 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.640701  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  39.69 
 
 		 263 aa  174  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2066  hypothetical protein  29.35 
 
 		 636 aa  171  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  39.3 
 
 		 266 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1199  putative ATP-binding protein  33.9 
 
 		 545 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0498844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  36.94 
 
 		 289 aa  164  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  38.52 
 
 		 266 aa  162  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  36.6 
 
 		 287 aa  159  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1122  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  26.49 
 
 		 572 aa  153  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.371922  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  30.7 
 
 		 880 aa  152  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4450  putative ATP-binding protein  30.55 
 
 		 427 aa  148  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.403742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4830  putative ATP-binding protein  31.35 
 
 		 525 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.21 
 
 		 599 aa  139  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  31.9 
 
 		 289 aa  138  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4916  putative ATP-binding protein  31.76 
 
 		 377 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.325325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1451  bifunctional DNA primase/polymerase  32.27 
 
 		 255 aa  114  6e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0151027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2837  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  38.01 
 
 		 183 aa  104  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0750475  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  33.8 
 
 		 746 aa  99  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  33.8 
 
 		 746 aa  99  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3378  hypothetical protein  27.03 
 
 		 317 aa  92  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.28 
 
 		 970 aa  90.9  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.28 
 
 		 970 aa  90.5  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  26.91 
 
 		 667 aa  89  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  38.03 
 
 		 749 aa  88.2  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  28.44 
 
 		 955 aa  87  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2521  Bifunctional DNA primase/polymerase  33.54 
 
 		 206 aa  85.5  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0275963  normal  0.180999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4212  Bifunctional DNA primase/polymerase  28.09 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567212  normal  0.394336 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1213  bifunctional DNA primase/polymerase  25.27 
 
 		 290 aa  73.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0963471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1201  hypothetical protein  32.54 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000142595  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1983  Bifunctional DNA primase/polymerase  34.51 
 
 		 201 aa  68.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3733  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.11 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6679  Bifunctional DNA primase/polymerase  35.4 
 
 		 201 aa  68.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2546  hypothetical protein  25.22 
 
 		 1027 aa  63.5  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000509076  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1688  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.68 
 
 		 236 aa  63.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0265  bifunctional DNA primase/polymerase  28.27 
 
 		 214 aa  58.9  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0228201  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1926  bifunctional DNA primase/polymerase  25.47 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.394144  hitchhiker  0.00427695 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2843  hypothetical protein  36.36 
 
 		 102 aa  57  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00805434  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00280  hypothetical protein  27.34 
 
 		 314 aa  53.5  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1578  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.61 
 
 		 1006 aa  52.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.357329 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2772  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.41 
 
 		 1002 aa  52.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06580  DNA primase/polymerase-like protein  25.45 
 
 		 317 aa  53.1  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8778  Bifunctional DNA primase/polymerase  26.11 
 
 		 223 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.635311 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2729  hypothetical protein  29.7 
 
 		 220 aa  51.6  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3896  hypothetical protein  27.43 
 
 		 692 aa  51.2  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.425308  normal  0.91209 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4368  Bifunctional DNA primase/polymerase  34.25 
 
 		 217 aa  51.2  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3055  hypothetical protein  35.38 
 
 		 94 aa  49.7  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0517698  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4436  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.7 
 
 		 219 aa  49.3  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  41.67 
 
 		 723 aa  49.7  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0552  hypothetical protein  32.91 
 
 		 213 aa  48.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2259  hypothetical protein  24.38 
 
 		 264 aa  47  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0062  hypothetical protein  25 
 
 		 391 aa  47  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2527  hypothetical protein  30.08 
 
 		 756 aa  44.7  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>