20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2546 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2546  hypothetical protein  100 
 
 
1027 aa  2112    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000509076  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0796  hypothetical protein  26.5 
 
 
535 aa  76.6  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1258  hypothetical protein  31.4 
 
 
650 aa  72.8  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  29.28 
 
 
880 aa  66.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  25.22 
 
 
746 aa  63.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2087  AAA ATPase  31.65 
 
 
685 aa  60.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1015  hypothetical protein  25.23 
 
 
701 aa  60.1  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.693082  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0023  hypothetical protein  25.08 
 
 
576 aa  60.1  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.640701  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1539  hypothetical protein  29.21 
 
 
399 aa  60.1  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1199  putative ATP-binding protein  27.23 
 
 
545 aa  58.9  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0498844  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  27.5 
 
 
769 aa  57.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1348  hypothetical protein  28.41 
 
 
643 aa  56.2  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7054  hypothetical protein  26.18 
 
 
739 aa  55.1  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1612  hypothetical protein  26.6 
 
 
866 aa  51.6  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.514221 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1122  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  24.19 
 
 
572 aa  50.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.371922  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1598  hypothetical protein  32.12 
 
 
521 aa  50.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3790  DNA primase catalytic core  22.88 
 
 
1103 aa  45.8  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.443954  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4450  putative ATP-binding protein  29.93 
 
 
427 aa  45.4  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.403742  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1921  DNA primase-like  23.48 
 
 
1103 aa  45.8  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0501943  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1193  protein of unknown function DUF927  32.35 
 
 
897 aa  45.4  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.280994 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>