21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1348 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1348  hypothetical protein  100 
 
 
643 aa  1295    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1258  hypothetical protein  36.36 
 
 
650 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1598  hypothetical protein  41.71 
 
 
521 aa  267  4e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1015  hypothetical protein  39.74 
 
 
701 aa  261  3e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.693082  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0023  hypothetical protein  36.13 
 
 
576 aa  261  3e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.640701  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2087  AAA ATPase  39.78 
 
 
685 aa  244  5e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0796  hypothetical protein  33.94 
 
 
535 aa  241  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1539  hypothetical protein  35.73 
 
 
399 aa  238  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7054  hypothetical protein  31.61 
 
 
739 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1612  hypothetical protein  32.04 
 
 
866 aa  214  4.9999999999999996e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.514221 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  34.84 
 
 
746 aa  212  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1122  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  31.46 
 
 
572 aa  204  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.371922  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  33.48 
 
 
880 aa  195  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1199  putative ATP-binding protein  33.79 
 
 
545 aa  193  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0498844  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2066  hypothetical protein  30.97 
 
 
636 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4830  putative ATP-binding protein  33.76 
 
 
525 aa  191  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4916  putative ATP-binding protein  38.73 
 
 
377 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.325325  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4450  putative ATP-binding protein  38.1 
 
 
427 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.403742  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3378  hypothetical protein  31.34 
 
 
317 aa  127  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2546  hypothetical protein  26.64 
 
 
1027 aa  62  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000509076  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0907  Zn-finger, CHC2 type  24.22 
 
 
1098 aa  46.6  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>