21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1258 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1258  hypothetical protein  100 
 
 
650 aa  1289    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1598  hypothetical protein  52.21 
 
 
521 aa  400  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1539  hypothetical protein  44.36 
 
 
399 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0796  hypothetical protein  40.34 
 
 
535 aa  336  1e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1015  hypothetical protein  39.47 
 
 
701 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.693082  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7054  hypothetical protein  39.75 
 
 
739 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0023  hypothetical protein  39.74 
 
 
576 aa  317  3e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.640701  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2087  AAA ATPase  40.4 
 
 
685 aa  306  9.000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1612  hypothetical protein  34.09 
 
 
866 aa  287  5e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.514221 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1348  hypothetical protein  38.71 
 
 
643 aa  271  2.9999999999999997e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2066  hypothetical protein  36.53 
 
 
636 aa  248  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  32.64 
 
 
746 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  36.44 
 
 
880 aa  230  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1199  putative ATP-binding protein  37.7 
 
 
545 aa  229  9e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0498844  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1122  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  32.59 
 
 
572 aa  217  7e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.371922  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4830  putative ATP-binding protein  31.47 
 
 
525 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4450  putative ATP-binding protein  33.52 
 
 
427 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.403742  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4916  putative ATP-binding protein  36.36 
 
 
377 aa  178  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.325325  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3378  hypothetical protein  36.97 
 
 
317 aa  167  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2546  hypothetical protein  31.4 
 
 
1027 aa  72.4  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000509076  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1538  hypothetical protein  35.94 
 
 
272 aa  46.2  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>