23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0796 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0796  hypothetical protein  100 
 
 		 535 aa  1102    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1258  hypothetical protein  40.34 
 
 		 650 aa  335  1e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1598  hypothetical protein  40.8 
 
 		 521 aa  288  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0023  hypothetical protein  34.86 
 
 		 576 aa  260  4e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.640701  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7054  hypothetical protein  35.57 
 
 		 739 aa  259  7e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1539  hypothetical protein  35.51 
 
 		 399 aa  249  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1612  hypothetical protein  31.97 
 
 		 866 aa  240  4e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.514221 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2066  hypothetical protein  34.69 
 
 		 636 aa  228  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1015  hypothetical protein  33.61 
 
 		 701 aa  226  8e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.693082  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1348  hypothetical protein  35.1 
 
 		 643 aa  222  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  37.44 
 
 		 880 aa  218  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  30.97 
 
 		 746 aa  213  7e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1122  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  31.4 
 
 		 572 aa  207  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.371922  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1199  putative ATP-binding protein  37.74 
 
 		 545 aa  206  7e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0498844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2087  AAA ATPase  32.84 
 
 		 685 aa  206  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4830  putative ATP-binding protein  31.49 
 
 		 525 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4450  putative ATP-binding protein  34.22 
 
 		 427 aa  176  9e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.403742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4916  putative ATP-binding protein  32.77 
 
 		 377 aa  163  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.325325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3378  hypothetical protein  27.69 
 
 		 317 aa  107  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2546  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1027 aa  76.6  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000509076  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3790  DNA primase catalytic core  25 
 
 		 1103 aa  45.8  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.443954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1921  DNA primase-like  25 
 
 		 1103 aa  46.2  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0501943  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0907  Zn-finger, CHC2 type  23.91 
 
 		 1098 aa  44.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>