More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0161 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0161  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 568 aa  1160    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000200021  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1635  Ion transport 2 domain protein  62.17 
 
 		 567 aa  709    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0302468  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1148  TrkA-N domain protein  51.64 
 
 		 614 aa  634  1e-180  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.549431 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0899  TrkA domain-containing protein  44.01 
 
 		 567 aa  482  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07220  K+ transport system, NAD-binding component  39.67 
 
 		 576 aa  370  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146502  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0527  TrkA domain-containing protein  34.51 
 
 		 564 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.630061  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  27.76 
 
 		 542 aa  224  2e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  27.8 
 
 		 544 aa  211  3e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  28.73 
 
 		 544 aa  190  5.999999999999999e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1187  TrkA-N domain protein  28.55 
 
 		 541 aa  187  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1196  TrkA-N domain protein  26.22 
 
 		 569 aa  178  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2691  TrkA-N domain protein  27.4 
 
 		 562 aa  178  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557317  normal  0.0657771 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0396  TrkA domain-containing protein  31.28 
 
 		 457 aa  171  3e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4312  TrkA-N domain protein  27.52 
 
 		 548 aa  170  6e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2323  TrkA domain-containing protein  25.55 
 
 		 549 aa  143  9e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.551813 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  28.35 
 
 		 347 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1924  TrkA-C domain protein  25.52 
 
 		 551 aa  128  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  31.22 
 
 		 325 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2072  TrkA-N  21.9 
 
 		 568 aa  93.2  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.712567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  23.84 
 
 		 341 aa  92  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  29.33 
 
 		 351 aa  90.9  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  26.54 
 
 		 350 aa  90.9  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  28.17 
 
 		 335 aa  89.7  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  29.02 
 
 		 332 aa  87.4  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  24.1 
 
 		 335 aa  87.4  7e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  24.21 
 
 		 355 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  24.36 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  26.92 
 
 		 351 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  21.38 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  21.6 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  21.6 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  21.6 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  27.35 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  25.44 
 
 		 332 aa  84.3  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  20.81 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  23.15 
 
 		 335 aa  83.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  29.46 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  23.67 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  24.51 
 
 		 350 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  27.44 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  27.27 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1315  TrkA-N domain protein  28.82 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  22.96 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  22.96 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  22.33 
 
 		 338 aa  80.1  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  23.81 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0418  TrkA-N domain protein  29.17 
 
 		 206 aa  79.7  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  26.76 
 
 		 330 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  24.85 
 
 		 346 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  29.81 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  23.23 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  25.22 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  26.5 
 
 		 330 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3112  potassium channel protein  23.64 
 
 		 225 aa  76.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0370735  normal  0.700906 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  24.88 
 
 		 332 aa  76.6  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  25.91 
 
 		 350 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  25.91 
 
 		 350 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  24.34 
 
 		 345 aa  76.3  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  28.37 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  25.82 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  26.13 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  27.88 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  25.82 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  25.82 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  25.82 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  22.51 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1030  conserved hypothetical protein (TrkA domain protein)  23.86 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.583921  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  28.02 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  24.02 
 
 		 352 aa  73.6  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  21.69 
 
 		 352 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  27.09 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  29.19 
 
 		 352 aa  72.8  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  26.05 
 
 		 355 aa  72  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  26.7 
 
 		 684 aa  70.5  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  20.81 
 
 		 376 aa  69.7  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  22.85 
 
 		 362 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  24.03 
 
 		 347 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  25.46 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  24.22 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  31.01 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  23.28 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  26.11 
 
 		 219 aa  66.6  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  25.48 
 
 		 445 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  24.3 
 
 		 668 aa  66.6  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0419  TrkA-N domain protein  24.88 
 
 		 313 aa  66.2  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  25.74 
 
 		 664 aa  66.6  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  22.13 
 
 		 324 aa  65.9  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  25.69 
 
 		 220 aa  66.2  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  22.22 
 
 		 672 aa  65.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2378  TrkA-N  22.22 
 
 		 575 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  25.69 
 
 		 220 aa  66.2  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.86 
 
 		 697 aa  64.3  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  25.93 
 
 		 674 aa  64.7  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  26.07 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  25.91 
 
 		 509 aa  64.3  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  28.45 
 
 		 658 aa  63.5  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  24 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2769  TrkA-N domain protein  23.79 
 
 		 565 aa  62.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  22.33 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  25.31 
 
 		 256 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.589845 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>