More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0428 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  100 
 
 		 219 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  79.19 
 
 		 221 aa  355  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  77.62 
 
 		 219 aa  340  1e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  73.52 
 
 		 220 aa  340  1e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  71.69 
 
 		 218 aa  329  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  70.32 
 
 		 219 aa  325  4.0000000000000003e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  68.95 
 
 		 218 aa  323  1e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  68.95 
 
 		 219 aa  318  5e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  68.49 
 
 		 219 aa  317  7e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  68.49 
 
 		 219 aa  317  7e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  68.49 
 
 		 219 aa  317  7e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  68.49 
 
 		 219 aa  317  7e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  68.49 
 
 		 219 aa  317  7e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  68.49 
 
 		 219 aa  317  7e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  68.49 
 
 		 219 aa  317  7e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  68.49 
 
 		 219 aa  317  7e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  68.49 
 
 		 219 aa  317  7e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  67.27 
 
 		 218 aa  317  7.999999999999999e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  68.4 
 
 		 226 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  66.67 
 
 		 220 aa  310  7.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  68.42 
 
 		 214 aa  310  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2327  30S ribosomal protein S3  71.56 
 
 		 227 aa  308  2.9999999999999997e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000359117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  65.91 
 
 		 222 aa  308  2.9999999999999997e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  66.36 
 
 		 226 aa  306  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  65.4 
 
 		 211 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  64.9 
 
 		 229 aa  304  7e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2271  30S ribosomal protein S3  63.85 
 
 		 217 aa  302  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  64.45 
 
 		 211 aa  302  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2312  30S ribosomal protein S3  63.85 
 
 		 217 aa  302  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000168649  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1825  30S ribosomal protein S3  62.1 
 
 		 217 aa  302  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.652235  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  64.45 
 
 		 211 aa  301  4.0000000000000003e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  66.06 
 
 		 221 aa  300  8.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  63.08 
 
 		 223 aa  300  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  62.5 
 
 		 210 aa  300  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  63.93 
 
 		 217 aa  299  2e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  63.51 
 
 		 222 aa  300  2e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  65.45 
 
 		 222 aa  298  3e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  64.38 
 
 		 217 aa  298  3e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  63.51 
 
 		 211 aa  298  4e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  61.99 
 
 		 221 aa  298  4e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  64.42 
 
 		 210 aa  298  5e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  63.33 
 
 		 210 aa  297  8e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  63.94 
 
 		 210 aa  293  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377493  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  60.75 
 
 		 224 aa  292  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  60.75 
 
 		 224 aa  292  2e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  62.02 
 
 		 224 aa  291  4e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  62.84 
 
 		 222 aa  291  6e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  62.84 
 
 		 222 aa  291  6e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  62.33 
 
 		 243 aa  291  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  62.33 
 
 		 243 aa  291  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1179  ribosomal protein S3  62.56 
 
 		 262 aa  290  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484191  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  62.56 
 
 		 217 aa  289  2e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1917  ribosomal protein S3  59.81 
 
 		 224 aa  288  6e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652876 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1620  30S ribosomal protein S3  63.08 
 
 		 249 aa  286  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2972  30S ribosomal protein S3  62.62 
 
 		 225 aa  285  4e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.845651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3661  ribosomal protein S3  61.9 
 
 		 219 aa  285  5e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178065  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1940  30S ribosomal protein S3  61.68 
 
 		 225 aa  285  5e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4020  ribosomal protein S3  60.66 
 
 		 260 aa  284  5.999999999999999e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  hitchhiker  0.00000649383 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0714  ribosomal protein S3  64.11 
 
 		 216 aa  284  8e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874756  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  63.94 
 
 		 240 aa  284  8e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0853  SSU ribosomal protein S3P  60.48 
 
 		 210 aa  284  9e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111374  hitchhiker  0.000095719 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1685  ribosomal protein S3  61.4 
 
 		 252 aa  283  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000519283  hitchhiker  0.00000302048 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  60.93 
 
 		 237 aa  283  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2301  30S ribosomal protein S3  60.93 
 
 		 232 aa  282  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371999  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3661  30S ribosomal protein S3  60.93 
 
 		 235 aa  282  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3178  30S ribosomal protein S3  60.93 
 
 		 232 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1672  30S ribosomal protein S3  59.81 
 
 		 235 aa  282  3.0000000000000004e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356257  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3442  30S ribosomal protein S3  60.47 
 
 		 232 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1962  30S ribosomal protein S3  59.53 
 
 		 236 aa  281  7.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1227  30S ribosomal protein S3  59.53 
 
 		 236 aa  280  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1190  30S ribosomal protein S3  59.53 
 
 		 236 aa  280  1e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5064  30S ribosomal protein S3  60.47 
 
 		 236 aa  280  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2366  30S ribosomal protein S3  63.46 
 
 		 223 aa  279  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1551  30S ribosomal protein S3  59.53 
 
 		 231 aa  279  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1568  ribosomal protein S3  61.5 
 
 		 238 aa  279  3e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000461215  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1360  ribosomal protein S3  58.6 
 
 		 241 aa  278  4e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.0370461 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0574  ribosomal protein S3  60 
 
 		 239 aa  278  5e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0704  30S ribosomal protein S3  58.41 
 
 		 236 aa  277  7e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220755  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0672  30S ribosomal protein S3  58.41 
 
 		 236 aa  277  7e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114905  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04040  SSU ribosomal protein S3P  59.07 
 
 		 286 aa  277  7e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1370  30S ribosomal protein S3  59.53 
 
 		 231 aa  277  8e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2446  ribosomal protein S3  59.53 
 
 		 248 aa  277  9e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2168  ribosomal protein S3  59.53 
 
 		 248 aa  277  9e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2742  ribosomal protein S3  60 
 
 		 236 aa  277  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0769117  normal  0.282476 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2224  ribosomal protein S3  59.53 
 
 		 248 aa  276  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2129  ribosomal protein S3  59.53 
 
 		 248 aa  276  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.429997 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23410  SSU ribosomal protein S3P  60.28 
 
 		 244 aa  275  3e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000415625  hitchhiker  0.000000143523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3999  ribosomal protein S3  56.87 
 
 		 223 aa  275  3e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217214  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3018  ribosomal protein S3  59.81 
 
 		 241 aa  275  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0195481  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10721  30S ribosomal protein S3  58.96 
 
 		 274 aa  275  4e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.680794  normal  0.235718 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4315  ribosomal protein S3  60 
 
 		 272 aa  275  4e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5130  ribosomal protein S3  58.85 
 
 		 268 aa  275  5e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.805435 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1914  ribosomal protein S3  59.07 
 
 		 251 aa  275  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0533377  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3899  30S ribosomal protein S3  61.65 
 
 		 278 aa  275  5e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1129  ribosomal protein S3  60.68 
 
 		 279 aa  274  6e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1722  30S ribosomal protein S3  62.5 
 
 		 238 aa  274  7e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094862  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0367  30S ribosomal protein S3  62.5 
 
 		 238 aa  274  7e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0255  30S ribosomal protein S3  60.58 
 
 		 239 aa  274  8e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4921  ribosomal protein S3  60.98 
 
 		 230 aa  274  9e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0969238  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0347  ribosomal protein S3  58.6 
 
 		 252 aa  274  9e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.924426  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>