128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1157 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1157  glutamate synthase alpha subunit domain protein  100 
 
 
381 aa  787    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000112739  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2159  glutamate synthase alpha subunit  54.61 
 
 
771 aa  335  1e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.681462  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2600  glutamate synthase, alpha subunit-like  53.24 
 
 
771 aa  334  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1723  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.11 
 
 
777 aa  229  5e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0383  glutamate synthase alpha subunit domain protein  42.38 
 
 
635 aa  226  4e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0102  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.46 
 
 
777 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2276  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.4 
 
 
776 aa  206  7e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1370  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.64 
 
 
794 aa  199  9e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1377  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.91 
 
 
793 aa  197  3e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.118947  normal  0.859258 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.83 
 
 
777 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1080  glutamate synthase alpha subunit  28.23 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1596  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.23 
 
 
256 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0867  glutamate synthase alpha subunit  28.49 
 
 
256 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0287996  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  32.84 
 
 
281 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  25 
 
 
252 aa  70.9  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  29.06 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2024  glutamate synthase alpha subunit  30.49 
 
 
246 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  36.43 
 
 
245 aa  70.1  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  29.47 
 
 
245 aa  70.1  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  29.47 
 
 
245 aa  70.1  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  29.63 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1289  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.45 
 
 
245 aa  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000639589 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0562  glutamate synthase alpha subunit  28.7 
 
 
242 aa  65.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  29.52 
 
 
568 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2490  glutamate synthase alpha subunit  29.55 
 
 
248 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0168  glutamate synthase alpha subunit  34.31 
 
 
229 aa  61.6  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  30 
 
 
240 aa  60.8  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1816  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  29.72 
 
 
251 aa  60.1  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0997673  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5066  glutamate synthase (NADH) large subunit  28.57 
 
 
1527 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5154  glutamate synthase (NADH) large subunit  28.57 
 
 
1527 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.631687 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5445  glutamate synthase (NADH) large subunit  28.57 
 
 
1536 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5920  glutamate synthase alpha subunit  32.16 
 
 
232 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.413716 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  26.09 
 
 
264 aa  59.7  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1094  glutamate synthase alpha subunit  25.14 
 
 
256 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1752  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.22 
 
 
249 aa  57.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.216628 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1235  hypothetical protein  27.27 
 
 
248 aa  57  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28040  glutamate synthase (NADH) large subunit  28.28 
 
 
1527 aa  57  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.723113  normal  0.697076 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  30.43 
 
 
670 aa  57  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3072  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.99 
 
 
1527 aa  56.6  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191791  hitchhiker  0.00286701 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  30.33 
 
 
568 aa  55.8  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  27.75 
 
 
245 aa  55.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2319  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  45.45 
 
 
578 aa  54.7  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000648814  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0972  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.62 
 
 
658 aa  53.5  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  31.39 
 
 
659 aa  53.5  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  34.96 
 
 
572 aa  53.5  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0999  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.62 
 
 
658 aa  53.5  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1692  glutamate synthase alpha subunit  31.41 
 
 
247 aa  53.5  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.737414  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1709  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.62 
 
 
658 aa  53.1  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0974  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.62 
 
 
658 aa  53.1  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.540369  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13895  ferredoxin-dependent glutamate synthase [NADPH] large subunit gltB  28.79 
 
 
1527 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1302  glutamate synthase alpha subunit  24.47 
 
 
261 aa  52.4  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0452  glutamate synthase (ferredoxin)  28 
 
 
1477 aa  52.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0585  glutamate synthase, large subunit, putative  27.33 
 
 
1478 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0498  glutamate synthase, large subunit  27.33 
 
 
1478 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0441  glutamate synthase, NADPH, large subunit  27.33 
 
 
1478 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0437  glutamate synthase, NADPH, large subunit  27.33 
 
 
1478 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0530  glutamate synthase, large subunit  27.33 
 
 
1478 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  31.09 
 
 
646 aa  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0513  putative glutamate synthase, large subunit  27.33 
 
 
1478 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4791  putative glutamate synthase, large subunit  27.33 
 
 
1478 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.621621  normal  0.701675 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0696  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  45.45 
 
 
577 aa  51.6  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0586  putative glutamate synthase, large subunit  27.33 
 
 
1478 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0535  putative glutamate synthase, large subunit  27.33 
 
 
1478 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.684549  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0130  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  45.45 
 
 
578 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000213386  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1562  sulfite reductase, beta subunit  40.35 
 
 
319 aa  50.8  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0446  glutamate synthase (ferredoxin)  27.52 
 
 
1478 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2477  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  42.11 
 
 
653 aa  50.4  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3044  glutamate synthase (NADH) large subunit  27.98 
 
 
1518 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3103  glutamate synthase (NADH) large subunit  27.98 
 
 
1518 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238876  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2822  glutamate synthase (ferredoxin)  28.22 
 
 
1518 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.857674 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3060  glutamate synthase (NADH) large subunit  27.98 
 
 
1518 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0031  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  40.74 
 
 
578 aa  49.7  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.43195 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1954  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  43.64 
 
 
579 aa  49.3  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.151886  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0458  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  31.82 
 
 
230 aa  49.3  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951315  normal  0.387952 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3213  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.64 
 
 
1542 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0038  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  40.74 
 
 
578 aa  48.5  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.093726  normal  0.0842207 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2358  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  42.62 
 
 
544 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5693  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.94 
 
 
1512 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  33.91 
 
 
553 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1593  2-oxoacid:acceptor oxidoreductase, delta subunit, pyruvate/2-ketoisovalerate  27.43 
 
 
315 aa  47.4  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1939  glutamate synthase alpha subunit domain protein  31.69 
 
 
229 aa  47  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1179  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.52 
 
 
557 aa  46.6  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  21.98 
 
 
576 aa  46.6  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1657  glutamate synthase alpha subunit  31.69 
 
 
229 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1574  glutamate synthase alpha subunit domain protein  31.69 
 
 
229 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3730  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.57 
 
 
1554 aa  46.2  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1294  glutamate synthase (ferredoxin)  25.64 
 
 
1562 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.163498  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0526  Glutamate synthase (ferredoxin)  24.42 
 
 
1548 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.801021  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1198  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C (tungsten)  52.94 
 
 
152 aa  45.8  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3782  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.57 
 
 
1554 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.376942  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3593  glutamate synthase (ferredoxin)  27.61 
 
 
1514 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.544233  normal  0.0352812 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2942  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.95 
 
 
1524 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.290675  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  29.51 
 
 
274 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1855  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.82 
 
 
579 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0230589  normal  0.0943361 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2193  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  39.29 
 
 
648 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.119268  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1596  hypothetical protein  31.25 
 
 
594 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2060  hypothetical protein  29.41 
 
 
594 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.124935 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1139  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  40.82 
 
 
288 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.079984  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3677  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.25 
 
 
665 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667385  normal  0.188485 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  46.67 
 
 
596 aa  45.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>